45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3859 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3859  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 461 aa  919    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0175  polysaccharide biosynthesis protein  30.98 
 
 		 449 aa  202  8e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3713  polysaccharide biosynthesis protein  29.58 
 
 		 445 aa  194  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.336357  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  27.2 
 
 		 446 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  21.57 
 
 		 483 aa  57.4  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3669  polysaccharide biosynthesis protein  23.45 
 
 		 501 aa  54.3  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2504  polysaccharide biosynthesis protein  24.6 
 
 		 486 aa  54.3  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0604  polysaccharide biosynthesis protein  20.91 
 
 		 483 aa  53.5  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000572815  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0730  putative polysaccharide transport protein  29.38 
 
 		 505 aa  53.5  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0464  polysaccharide transporter protein, putative  20.91 
 
 		 486 aa  53.1  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000125112  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1637  polysaccharide biosynthesis protein  21.84 
 
 		 504 aa  52.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  20.45 
 
 		 489 aa  50.1  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  22.14 
 
 		 490 aa  50.1  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0590  polysaccharide biosynthesis protein, putative  22.73 
 
 		 483 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000415804  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  23.36 
 
 		 507 aa  49.3  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3796  polysaccharide biosynthesis protein  26.26 
 
 		 478 aa  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1969  polysaccharide biosynthesis protein  27.59 
 
 		 488 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2969  O-antigen and teichoic acid-like export protein  26.88 
 
 		 449 aa  48.1  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.369206  normal  0.787883 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  24 
 
 		 487 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5279  polysaccharide biosynthesis protein  22.67 
 
 		 484 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0394078  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0545  polysaccharide biosynthesis family protein  28.18 
 
 		 484 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5522  polysaccharide synthase family protein  22.67 
 
 		 484 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  25.81 
 
 		 483 aa  46.6  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5123  spore cortex biosynthesis protein  22.67 
 
 		 484 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151446  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1706  polysaccharide biosynthesis family protein  28.18 
 
 		 488 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.974383  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0753  polysaccharide biosynthesis family protein  28.18 
 
 		 488 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5676  polysaccharide biosynthesis protein  22.67 
 
 		 484 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0694  polysaccharide biosynthesis family protein  27.22 
 
 		 488 aa  46.6  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.731179  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2229  polysaccharide transporter  26.63 
 
 		 488 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0925528 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1665  polysaccharide biosynthesis family protein  28.18 
 
 		 484 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702931  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1873  polysaccharide biosynthesis family protein  28.18 
 
 		 484 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1809  polysaccharide biosynthesis protein  24.74 
 
 		 553 aa  45.8  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2428  polysaccharide biosynthesis protein  28.18 
 
 		 484 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1844  polysaccharide biosynthesis protein  24.74 
 
 		 553 aa  45.8  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2289  polysaccharide biosynthesis protein  28.18 
 
 		 484 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  27.66 
 
 		 517 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0028  polysaccharide biosynthesis protein  20.9 
 
 		 484 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4609  polysaccharide biosynthesis protein  31.19 
 
 		 488 aa  44.7  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.286147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1942  polysaccharide biosynthesis protein  25.53 
 
 		 491 aa  44.7  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5222  polysaccharide biosynthesis protein  20.3 
 
 		 484 aa  44.3  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5560  polysaccharide biosynthesis protein, putative  20.3 
 
 		 484 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3362  polysaccharide biosynthesis protein  29.17 
 
 		 488 aa  43.1  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3866  polysaccharide biosynthesis protein  29.17 
 
 		 488 aa  43.1  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.377761  normal  0.957657 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1073  polysaccharide biosynthesis protein  26.15 
 
 		 492 aa  43.1  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.610845 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2112  polysaccharide biosynthesis protein  29.17 
 
 		 498 aa  43.1  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.306384 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>