94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3854 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3854  hypothetical protein  100 
 
 		 407 aa  843    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1956  glycosyl transferase group 1  26.68 
 
 		 397 aa  140  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.454805  hitchhiker  0.000698573 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0179  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 		 404 aa  127  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.160562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1963  glycosyl transferase group 1  25.06 
 
 		 406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000383254 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0170  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 		 394 aa  110  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.269733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2210  glycosyl transferase, group 1  27.72 
 
 		 392 aa  107  6e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.516379  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4118  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 		 383 aa  106  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0967144  hitchhiker  0.00000000882956 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3059  glycosyl transferase, group 1  32.2 
 
 		 416 aa  105  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.304674  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1306  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 		 422 aa  104  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.622401  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2641  hypothetical protein  28.36 
 
 		 392 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602501  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4703  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 		 390 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  27.97 
 
 		 1293 aa  100  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2727  hypothetical protein  28.36 
 
 		 392 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.298348  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  25.67 
 
 		 1119 aa  99.8  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0105  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 385 aa  98.2  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2822  hypothetical protein  27.61 
 
 		 392 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0058  glycosyltransferase-like protein  28.51 
 
 		 443 aa  95.9  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4204  glycosyl transferase, group 1  26.51 
 
 		 398 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186805  normal  0.199136 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3620  glycosyltransferase  26.05 
 
 		 443 aa  94  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3716  glycosyl transferase group 1  25.85 
 
 		 400 aa  93.6  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19360  hypothetical protein  27.89 
 
 		 319 aa  92.4  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1753  glycosyl transferase family 2  26.47 
 
 		 705 aa  87.4  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0589133  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0677  glycosyl transferase group 1  31.72 
 
 		 397 aa  87  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2281  glycosyl transferase, group 1  22.58 
 
 		 389 aa  86.3  8e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0280  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 		 403 aa  85.9  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1819  hypothetical protein  23.33 
 
 		 388 aa  85.5  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000132371  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0299  putative glycosyl transferases  26.38 
 
 		 385 aa  84.7  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  27.44 
 
 		 783 aa  84.7  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1195  hypothetical protein  24.66 
 
 		 420 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.291365  normal  0.75436 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2340  glycosyl transferase, group 1  29.66 
 
 		 397 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107482  normal  0.0271805 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5260  glycosyltransferase  27.34 
 
 		 405 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1929  glycosyl transferase, group 1  30.22 
 
 		 409 aa  82.4  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4112  glycosyl transferase group 1  26.77 
 
 		 385 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2899  hypothetical protein  27.38 
 
 		 394 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.394156  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2529  hypothetical protein  31.28 
 
 		 376 aa  81.6  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  31.75 
 
 		 783 aa  81.3  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25661  hypothetical protein  25.88 
 
 		 741 aa  80.1  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2459  methyltransferase type 11  33.73 
 
 		 729 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.127037  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0087  glycosyltransferase  26.56 
 
 		 412 aa  76.3  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3311  glycosyl transferase, group 1  22.14 
 
 		 390 aa  75.9  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  28 
 
 		 814 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2380  hypothetical protein  22.17 
 
 		 434 aa  72.8  0.000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0254989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1400  Methyltransferase type 11  28.16 
 
 		 728 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.527052  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1496  Methyltransferase type 11  28.16 
 
 		 728 aa  70.5  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0542283  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2703  hypothetical protein  23.5 
 
 		 394 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0632784  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0199  hypothetical protein  23.9 
 
 		 754 aa  70.1  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0827  glycosyl transferase group 1  25.19 
 
 		 350 aa  69.7  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003539  glycosyltransferase  21.76 
 
 		 374 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0014  glycosyl transferase, group 1  29.03 
 
 		 378 aa  68.6  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.176484  normal  0.0193724 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0169  glycosyltransferase-like protein  24.4 
 
 		 751 aa  68.2  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.672061  normal  0.17945 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0258  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 		 388 aa  67.8  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0754  hypothetical protein  23.85 
 
 		 416 aa  66.2  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.200233  hitchhiker  0.000521831 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4319  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 		 903 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4021  glycosyl transferase group 1  25.92 
 
 		 382 aa  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2692  hypothetical protein  24.91 
 
 		 370 aa  64.7  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3973  hypothetical protein  29.22 
 
 		 372 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395913 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0649  putative glycosyltransferase  31.17 
 
 		 417 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.408248  normal  0.175721 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2279  glycosyl transferase, group 1  27.19 
 
 		 382 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1678  glycosyl transferase, group 1  25.18 
 
 		 373 aa  60.8  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1863  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.16 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3695  methyltransferase type 12  24.65 
 
 		 726 aa  58.9  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02222  hypothetical protein  22.89 
 
 		 375 aa  59.3  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6552  hypothetical protein  29.75 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4117  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0723713  hitchhiker  0.0000000981139 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4122  glycosyl transferase, group 1  31.06 
 
 		 393 aa  56.6  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0256  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  25 
 
 		 427 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188802  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0268  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.9 
 
 		 477 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0265  glycosyl transferase, group 1 family protein  25 
 
 		 427 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0259  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  25.9 
 
 		 477 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.636404  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1385  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 415 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1571  hypothetical protein  29.88 
 
 		 396 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.443604 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0257  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  24.55 
 
 		 411 aa  53.1  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0141248  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0266  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.55 
 
 		 411 aa  52.8  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0664  hypothetical protein  24.89 
 
 		 942 aa  52  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000150651  hitchhiker  0.00000068678 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2439  glycosyl transferase, group 1  26.34 
 
 		 388 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0171  hypothetical protein  27.47 
 
 		 391 aa  50.8  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1489  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 		 395 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113053  normal  0.618426 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1685  glycosyl transferase group 1  22.97 
 
 		 859 aa  49.7  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0520  phosphoserine aminotransferase, (psat)  26.9 
 
 		 401 aa  49.3  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  31.03 
 
 		 395 aa  49.3  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  42.65 
 
 		 382 aa  48.5  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1761  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 		 390 aa  46.6  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  24.16 
 
 		 386 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0324  glycosyl transferase, group 1  26.03 
 
 		 400 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.546563  normal  0.700296 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5018  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.82 
 
 		 377 aa  44.3  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.437821  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3661  glycosyl transferase group 1  35.9 
 
 		 388 aa  44.3  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3186  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 		 414 aa  43.9  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00148125  hitchhiker  0.0000469398 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4455  glycosyl transferase group 1  32.5 
 
 		 430 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1691  glycosyl transferase, group 1  24.44 
 
 		 550 aa  43.9  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2959  glycosyl transferase group 1  38.6 
 
 		 398 aa  43.5  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000811696 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0962  hypothetical protein  25.99 
 
 		 378 aa  43.5  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  23.01 
 
 		 370 aa  43.5  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4434  glycosyl transferase group 1  36.36 
 
 		 430 aa  43.1  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>