More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3852 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
321 aa  667    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  45.55 
 
 
307 aa  295  7e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  42.41 
 
 
305 aa  261  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2030  glycosyl transferase family 2  40.42 
 
 
303 aa  239  4e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  hitchhiker  0.000668775 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  40.44 
 
 
298 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  35.93 
 
 
303 aa  179  4e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  37.59 
 
 
300 aa  177  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  36.68 
 
 
302 aa  168  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2356  glycosyl transferase family 2  31.04 
 
 
346 aa  161  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.934543  normal  0.35695 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  35.04 
 
 
320 aa  160  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  37.8 
 
 
305 aa  157  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  35.04 
 
 
314 aa  155  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  34.14 
 
 
355 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  29.93 
 
 
341 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  33.2 
 
 
337 aa  145  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3720  putative glycosyl transferase  32.11 
 
 
302 aa  143  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1643  glycosyl transferase family 2  32.75 
 
 
324 aa  143  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1310  glycosyl transferase family protein  32.21 
 
 
342 aa  142  7e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  31.29 
 
 
283 aa  139  7e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  32.24 
 
 
336 aa  139  7.999999999999999e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  31.85 
 
 
841 aa  138  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6387  glycosyl transferase family 2  30.83 
 
 
340 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0741751  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0584  glycosyl transferase family protein  30.41 
 
 
347 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0121583  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2173  glycosyl transferase family 2  30.16 
 
 
337 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  33.06 
 
 
279 aa  136  5e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0546  glycosyl transferase  30.83 
 
 
348 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483878  normal  0.249879 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2583  glycosyl transferase family 2  31.01 
 
 
330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1932  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 
359 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.506489  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 
318 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  31.39 
 
 
338 aa  132  5e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
346 aa  132  6e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  30.95 
 
 
345 aa  132  6e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0250  glycosyl transferase family 2  26.55 
 
 
344 aa  132  7.999999999999999e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000000444925  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
294 aa  129  7.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  29.7 
 
 
358 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0139  glycosyl transferase family protein  32.17 
 
 
319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412068  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  30.36 
 
 
838 aa  127  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  31.76 
 
 
290 aa  126  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  28.72 
 
 
328 aa  124  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  31 
 
 
322 aa  124  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  31.38 
 
 
401 aa  123  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  29.13 
 
 
722 aa  123  5e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  30.85 
 
 
327 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  29.73 
 
 
337 aa  122  8e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  31.56 
 
 
286 aa  122  9e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  29.28 
 
 
705 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12413  glycosyltransferase  28.34 
 
 
330 aa  121  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2705  glycosyl transferase family 2  32.28 
 
 
334 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520476 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  28.22 
 
 
288 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  29.5 
 
 
311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  31.33 
 
 
313 aa  120  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 
308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  30.28 
 
 
836 aa  119  6e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0313  rhamnosyl transferase related protein  29.75 
 
 
342 aa  119  7e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0691397 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2920  glycosyl transferase family protein  27.14 
 
 
339 aa  119  7e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  30.49 
 
 
282 aa  119  9e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  28.06 
 
 
360 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  31.47 
 
 
298 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  31.33 
 
 
334 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  31.69 
 
 
340 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0238  glycosyltransferase  26.06 
 
 
342 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00200202  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.26 
 
 
355 aa  116  6e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4006  glycosyl transferase family 2  26.27 
 
 
342 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  30.35 
 
 
291 aa  115  7.999999999999999e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6727  glycosyl transferase family protein  33.46 
 
 
319 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0684  glycosyl transferase family 2  29.57 
 
 
350 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.584656 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  30.56 
 
 
284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0462  glycosyl transferase family 2  29.48 
 
 
325 aa  114  3e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3136  glycosyl transferase family 2  30.65 
 
 
320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  30.71 
 
 
291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  28.12 
 
 
652 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1694  glycosyl transferase family protein  27.98 
 
 
340 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.128471  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 
311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  26.53 
 
 
310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1753  glycosyl transferase family protein  31.72 
 
 
297 aa  113  5e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.625707 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1725  putative rhamnosyltransferase  31.97 
 
 
311 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0378366  normal  0.370128 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1748  glycosyl transferase family protein  29.39 
 
 
300 aa  112  9e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3185  glycosyl transferase family protein  25.18 
 
 
297 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  30.68 
 
 
324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0564  glycosyl transferase family protein  26.51 
 
 
330 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 
489 aa  109  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4437  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
331 aa  108  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1328  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 
332 aa  108  9.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2223  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.4 
 
 
322 aa  108  1e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000156905 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2362  glycosyl transferase family 2  33.21 
 
 
335 aa  108  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  27.49 
 
 
327 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 
306 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  25.85 
 
 
318 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  29.37 
 
 
353 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3077  glycosyl transferase family protein  28.98 
 
 
313 aa  108  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.243281 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2875  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 
324 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  28.92 
 
 
306 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1700  glycosyl transferase family protein  29.07 
 
 
312 aa  106  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0275555 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  25.51 
 
 
318 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  25.51 
 
 
318 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 
318 aa  105  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  29.8 
 
 
317 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3779  glycosyl transferase family protein  29.33 
 
 
318 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  24.83 
 
 
318 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>