More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3793 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  90.65 
 
 		 446 aa  810    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 428 aa  875    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  54.69 
 
 		 471 aa  476  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6629  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  47.39 
 
 		 458 aa  416  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0935269 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  41.12 
 
 		 462 aa  332  5e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  39.85 
 
 		 706 aa  292  9e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  41.13 
 
 		 706 aa  289  7e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  44.85 
 
 		 334 aa  245  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  36.08 
 
 		 617 aa  232  1e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.51 
 
 		 542 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  33.01 
 
 		 605 aa  225  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  33.17 
 
 		 1421 aa  224  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  35.89 
 
 		 331 aa  220  3e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  42.22 
 
 		 306 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  39.6 
 
 		 582 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  36.12 
 
 		 581 aa  212  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  33.25 
 
 		 404 aa  209  7e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  33.25 
 
 		 1276 aa  209  8e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2365  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.59 
 
 		 308 aa  209  1e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  43.03 
 
 		 306 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  39.69 
 
 		 361 aa  203  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  45.66 
 
 		 539 aa  198  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.58 
 
 		 373 aa  196  7e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.74 
 
 		 406 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.74 
 
 		 406 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  33.05 
 
 		 391 aa  191  2e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  32.34 
 
 		 515 aa  187  3e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  31 
 
 		 687 aa  186  5e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.06 
 
 		 746 aa  185  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.43 
 
 		 818 aa  182  7e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12541  Tfp pilus assembly protein PilF  30.71 
 
 		 442 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.34619  hitchhiker  0.00140851 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  35.21 
 
 		 547 aa  179  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.86 
 
 		 357 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  36.78 
 
 		 371 aa  175  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0214  TPR repeat-containing protein  35.77 
 
 		 308 aa  176  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  30.13 
 
 		 425 aa  174  2.9999999999999996e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.54 
 
 		 738 aa  174  3.9999999999999995e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  31.5 
 
 		 649 aa  173  5e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28 
 
 		 1022 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  29.47 
 
 		 804 aa  170  4e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.47 
 
 		 784 aa  170  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.75 
 
 		 988 aa  169  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  26.03 
 
 		 1694 aa  169  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.61 
 
 		 1056 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  28.17 
 
 		 927 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.45 
 
 		 1056 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.09 
 
 		 343 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  44.32 
 
 		 233 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 		 4079 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.86 
 
 		 878 aa  153  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 		 450 aa  150  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  37.3 
 
 		 750 aa  149  1.0000000000000001e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  28.23 
 
 		 4489 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  24.09 
 
 		 543 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  27.14 
 
 		 750 aa  146  8.000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.38 
 
 		 810 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  29.39 
 
 		 392 aa  145  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.1 
 
 		 778 aa  144  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  34.96 
 
 		 352 aa  144  3e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  32.6 
 
 		 349 aa  143  6e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4974  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 		 422 aa  143  8e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2752  TPR repeat-containing protein  26.37 
 
 		 556 aa  142  9e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0761228  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  33.2 
 
 		 356 aa  138  1e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  31.56 
 
 		 1007 aa  136  7.000000000000001e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2529  TPR repeat-containing protein  35.53 
 
 		 243 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3056  TPR repeat-containing protein  31.85 
 
 		 543 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1773  TPR repeat-containing protein  32.34 
 
 		 318 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  23.39 
 
 		 1979 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1798  TPR repeat-containing protein  38.07 
 
 		 211 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.53381e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  35.19 
 
 		 280 aa  134  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0147  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 306 aa  133  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  27.05 
 
 		 1192 aa  133  5e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  24.4 
 
 		 562 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  30.98 
 
 		 284 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1228  TPR repeat-containing protein  35.59 
 
 		 297 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  23.98 
 
 		 564 aa  132  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 		 634 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2023  TPR domain-containing protein  30.1 
 
 		 369 aa  130  5.0000000000000004e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000313787  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  41.24 
 
 		 376 aa  129  8.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  27.59 
 
 		 1056 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  23.9 
 
 		 730 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.46 
 
 		 784 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.78 
 
 		 839 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.92 
 
 		 707 aa  127  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  24.27 
 
 		 711 aa  126  8.000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  33.04 
 
 		 1240 aa  126  9e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.89 
 
 		 397 aa  125  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  34.7 
 
 		 1827 aa  124  3e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0543  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.32 
 
 		 248 aa  124  3e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 		 594 aa  124  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  23.48 
 
 		 465 aa  123  5e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 		 292 aa  124  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2200  TPR domain-containing protein  25.67 
 
 		 695 aa  123  6e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  32.03 
 
 		 3035 aa  123  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.24 
 
 		 632 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3982  TPR repeat-containing protein  30.8 
 
 		 305 aa  122  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.588459  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3025  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 		 239 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.11 
 
 		 261 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  34.11 
 
 		 260 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  31.6 
 
 		 1094 aa  120  3e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>