252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3624 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3624  oxidoreductase molybdopterin binding protein  100 
 
 
411 aa  848  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564315  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3242  oxidoreductase molybdopterin binding  69.44 
 
 
410 aa  595  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.842559 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6939  oxidoreductase molybdopterin binding protein  68.69 
 
 
417 aa  587  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2874  twin-arginine translocation pathway signal  57.14 
 
 
457 aa  498  1e-140  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0005  molybdopterin oxidoreductase family protein  52.18 
 
 
412 aa  422  1e-117  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0031  molybdopterin oxidoreductase family protein  52.18 
 
 
412 aa  422  1e-117  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.589272  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0007  molybdopterin oxidoreductase family protein  51.08 
 
 
416 aa  417  1e-115  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1175  oxidoreductase molybdopterin binding  50.85 
 
 
408 aa  410  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  1.18836e-05 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0981  oxidoreductase molybdopterin binding  50.85 
 
 
408 aa  406  1e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.036164  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2981  putative molydopterin binding oxidoreductase  50.74 
 
 
420 aa  402  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4081  twin-arginine translocation pathway signal  48.82 
 
 
461 aa  395  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0916  twin-arginine translocation pathway signal  48.58 
 
 
461 aa  395  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0007  oxidoreductase, molybdopterin binding  48.42 
 
 
408 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0715  oxidoreductase, molybdopterin-binding  49.39 
 
 
408 aa  390  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0007  oxidoreductase molybdopterin binding protein  48.18 
 
 
408 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  5.59992e-07 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0007  oxidoreductase molybdopterin binding  48.18 
 
 
408 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.01327 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  41.45 
 
 
451 aa  322  6e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  47.4 
 
 
453 aa  321  1e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  36.89 
 
 
361 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5280  sulfite oxidase  33.87 
 
 
359 aa  187  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591678  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  30.94 
 
 
412 aa  184  2e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  1.11038e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  32.7 
 
 
403 aa  182  6e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4929  oxidoreductase, molybdopterin-binding  32.3 
 
 
414 aa  180  3e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  31.42 
 
 
426 aa  179  7e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  31.84 
 
 
410 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1622  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  32.77 
 
 
446 aa  178  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  32.87 
 
 
414 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3083  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  35.26 
 
 
417 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741387  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1978  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.73 
 
 
416 aa  176  7e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.956228  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  32.49 
 
 
402 aa  171  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  30.94 
 
 
409 aa  170  5e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  31.3 
 
 
401 aa  169  9e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  33.05 
 
 
406 aa  168  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11777  hypothetical protein  33.69 
 
 
367 aa  167  5e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.78626e-15  hitchhiker  6.08481e-12 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.73 
 
 
415 aa  165  2e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  1.98483e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  33.24 
 
 
414 aa  164  2e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  33.24 
 
 
370 aa  163  5e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  31.2 
 
 
369 aa  162  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  32.86 
 
 
405 aa  160  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  32.86 
 
 
405 aa  160  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  30.61 
 
 
369 aa  159  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  32.2 
 
 
401 aa  159  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  30.32 
 
 
369 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  32.35 
 
 
369 aa  157  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  30.03 
 
 
412 aa  158  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1487  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.21 
 
 
406 aa  157  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  30.58 
 
 
403 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.75 
 
 
400 aa  155  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2864  sulfite oxidase  29.73 
 
 
363 aa  155  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0035  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  33.14 
 
 
406 aa  155  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.7902  normal  0.133868 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2692  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.58 
 
 
408 aa  154  3e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339066  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5267  oxidoreductase molybdopterin binding  31.05 
 
 
407 aa  150  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873576  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  30.24 
 
 
402 aa  150  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1599  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.54 
 
 
409 aa  149  1e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  30.97 
 
 
402 aa  149  1e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  31.82 
 
 
372 aa  147  4e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  32.32 
 
 
376 aa  146  8e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0055  oxidoreductase molybdopterin binding  31.58 
 
 
417 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  29.26 
 
 
407 aa  144  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.18 
 
 
415 aa  143  6e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2728  oxidoreductase molybdopterin binding  33.82 
 
 
409 aa  140  4e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  34.88 
 
 
407 aa  140  5e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486287  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1504  sulfite oxidase SoxC, putative  32.12 
 
 
419 aa  137  4e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545192  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.82 
 
 
400 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3018  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  32.94 
 
 
405 aa  136  6e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2781  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  29.78 
 
 
434 aa  135  1e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446362  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  32.93 
 
 
409 aa  135  1e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  33.33 
 
 
428 aa  134  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  31.52 
 
 
429 aa  134  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  33.33 
 
 
428 aa  134  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  5.38057e-06 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2086  sulfite oxidase SoxC, putative  31.5 
 
 
431 aa  133  6e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.29998  normal  0.615224 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0156  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  30.52 
 
 
453 aa  132  1e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  4.33271e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5873  oxidoreductase molybdopterin binding  32.63 
 
 
414 aa  132  1e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  normal  0.20315 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  30.92 
 
 
431 aa  131  2e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4161  oxidoreductase molybdopterin binding  30.39 
 
 
430 aa  130  5e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  32.12 
 
 
405 aa  129  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0813  sulfite:cytochrome C oxidoreductase subunit A  31.06 
 
 
379 aa  129  1e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0561  sulfite dehydrogenase  29.89 
 
 
414 aa  127  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2735  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.5 
 
 
415 aa  126  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.313353  hitchhiker  5.68946e-05 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  30.49 
 
 
420 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1093  twin-arginine translocation pathway signal  30.84 
 
 
425 aa  122  1e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2988  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.94 
 
 
425 aa  121  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0911  putative sulfite oxidase  30.21 
 
 
437 aa  120  4e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.911487  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2166  putative sulfite oxidase, dehydrogenase subunit(SoxC)  29.34 
 
 
424 aa  120  5e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1615  oxidoreductase molybdopterin binding  30.84 
 
 
414 aa  119  9e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2060  twin-arginine translocation pathway signal  26.79 
 
 
445 aa  119  1e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  3.89133e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0151  putative sulfite oxidase  29.15 
 
 
419 aa  118  2e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1518  oxidoreductase molybdopterin binding  27.93 
 
 
440 aa  118  2e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.883795  normal  0.831721 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3339  oxidoreductase molybdopterin binding  30.62 
 
 
406 aa  118  2e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.617225  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3664  oxidoreductase molybdopterin binding  30.34 
 
 
402 aa  116  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185653  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4368  twin-arginine translocation pathway signal  30.24 
 
 
425 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3212  oxidoreductase molybdopterin binding  28.61 
 
 
423 aa  115  2e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4957  oxidoreductase molybdopterin binding  29.04 
 
 
431 aa  114  2e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0148  oxidoreductase molybdopterin binding  29.22 
 
 
437 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3676  sulfur dehydrogenase subunit SoxC  27.82 
 
 
427 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0587  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.19 
 
 
456 aa  113  5e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.271361  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1238  oxidoreductase, molybdopterin binding  26.89 
 
 
418 aa  112  1e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6594  oxidoreductase, molybdopterin binding  26.89 
 
 
418 aa  112  1e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0853456 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44482  predicted protein  27.32 
 
 
600 aa  111  2e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00564143  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1665  oxidoreductase molybdopterin binding  30.63 
 
 
449 aa  111  2e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>