160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3572 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3572  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  350  4e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0938  hypothetical protein  48.86 
 
 
183 aa  174  5e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03675  hypothetical protein  45.14 
 
 
182 aa  167  7e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3754  hypothetical protein  45.76 
 
 
184 aa  160  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182605  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0384  hypothetical protein  48.86 
 
 
186 aa  154  8e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0211901 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3443  hypothetical protein  42.29 
 
 
182 aa  149  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.879523 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1468  hypothetical protein  42.39 
 
 
187 aa  134  5e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200067  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2765  hypothetical protein  43.37 
 
 
194 aa  124  8.000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1332  hypothetical protein  43.92 
 
 
181 aa  122  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0104  hypothetical protein  43.26 
 
 
187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.805138  normal  0.943991 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0107  hypothetical protein  43.26 
 
 
187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0849  hypothetical protein  44.13 
 
 
203 aa  119  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0214356 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4270  hypothetical protein  40.56 
 
 
197 aa  117  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14931  hypothetical protein  41.11 
 
 
195 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0547  hypothetical protein  41.5 
 
 
142 aa  104  7e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0228  hypothetical protein  44.59 
 
 
139 aa  101  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2413  hypothetical protein  35.76 
 
 
168 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01598  hypothetical protein  40.82 
 
 
142 aa  99.4  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0478  hypothetical protein  37.08 
 
 
195 aa  99.8  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.594708 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0702  hypothetical protein  44.35 
 
 
137 aa  98.6  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0474  hypothetical protein  43.09 
 
 
137 aa  97.8  8e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3934  hypothetical protein  41.1 
 
 
142 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1490  hypothetical protein  44.19 
 
 
140 aa  95.1  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1493  hypothetical protein  44.19 
 
 
140 aa  94.7  6e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08831  hypothetical protein  38.98 
 
 
186 aa  94.4  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.152227  hitchhiker  0.0000304653 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46050  hypothetical protein  39.04 
 
 
142 aa  94  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1118  hypothetical protein  38.07 
 
 
190 aa  92.8  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.741307  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0881  hypothetical protein  36.91 
 
 
141 aa  93.2  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.569107  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1360  hypothetical protein  38.67 
 
 
190 aa  92.4  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.905628  normal  0.269877 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0464  hypothetical protein  39.86 
 
 
141 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00424113 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0431  hypothetical protein  39.19 
 
 
141 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4625  hypothetical protein  37.32 
 
 
148 aa  88.2  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0919  hypothetical protein  36.26 
 
 
188 aa  88.2  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.113823  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3568  hypothetical protein  38.03 
 
 
143 aa  87.8  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0558336  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08470  hypothetical protein  41.22 
 
 
140 aa  87.8  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000178452 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0802  hypothetical protein  41.22 
 
 
140 aa  87.8  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.994643  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0329  hypothetical protein  36.87 
 
 
187 aa  87.8  8e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.541566  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1258  hypothetical protein  43.75 
 
 
140 aa  86.7  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4772  hypothetical protein  39.19 
 
 
141 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.338274  normal  0.685574 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0461  hypothetical protein  39.19 
 
 
141 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335384  normal  0.121945 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09781  hypothetical protein  35.16 
 
 
188 aa  85.9  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.711198  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09801  hypothetical protein  34.07 
 
 
188 aa  85.1  4e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0689  hypothetical protein  36.11 
 
 
140 aa  85.1  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.885793  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4259  hypothetical protein  40.14 
 
 
178 aa  84.7  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2740  hypothetical protein  38.19 
 
 
140 aa  81.6  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0349  hypothetical protein  38.03 
 
 
136 aa  80.9  0.000000000000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10021  hypothetical protein  37.43 
 
 
187 aa  80.9  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.764651  normal  0.386426 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0831  hypothetical protein  34.97 
 
 
141 aa  80.5  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0646  hypothetical protein  36.64 
 
 
142 aa  80.1  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.191935  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2533  hypothetical protein  38.62 
 
 
141 aa  80.1  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0398  hypothetical protein  36.99 
 
 
172 aa  80.5  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.85997  normal  0.904592 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2084  hypothetical protein  38.89 
 
 
139 aa  79  0.00000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5103  hypothetical protein  36.09 
 
 
142 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.605175  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0431  hypothetical protein  35.61 
 
 
140 aa  79.3  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0111877 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0112  hypothetical membrane spanning protein  37.9 
 
 
139 aa  78.6  0.00000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2979  hypothetical protein  36.11 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0580  hypothetical protein  36.88 
 
 
138 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2569  hypothetical protein  36.11 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.83321 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3933  hypothetical protein  38.76 
 
 
178 aa  77.4  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4570  hypothetical protein  34.07 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3618  hypothetical protein  36.99 
 
 
148 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3722  hypothetical protein  37.4 
 
 
136 aa  76.6  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4233  hypothetical protein  33.56 
 
 
146 aa  76.6  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.225935 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2584  hypothetical protein  35.17 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681885  hitchhiker  0.00000000000477128 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3744  hypothetical protein  35.17 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3376  hypothetical protein  36.17 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0317356  hitchhiker  0.000000000730541 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0603  hypothetical protein  33.33 
 
 
142 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2151  hypothetical protein  40.15 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2728  hypothetical protein  34.48 
 
 
140 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0175  hypothetical protein  34.48 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0658  hypothetical protein  34.48 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.431582  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1862  hypothetical protein  40.15 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.521367  normal  0.897697 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0579  hypothetical protein  34.48 
 
 
140 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0625  hypothetical protein  34.48 
 
 
140 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2969  hypothetical protein  37.3 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0553  hypothetical protein  34.48 
 
 
140 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.65595  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3301  hypothetical protein  36 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0835749  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1825  hypothetical protein  34.93 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0349545 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0258  hypothetical protein  34.72 
 
 
141 aa  72.4  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0111  hypothetical protein  34.25 
 
 
139 aa  70.9  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0381  hypothetical protein  35.21 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905108  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4297  hypothetical protein  32.89 
 
 
143 aa  70.9  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.818431  normal  0.0309723 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1496  hypothetical protein  35.81 
 
 
146 aa  70.9  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0864427 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2862  hypothetical protein  34.03 
 
 
151 aa  70.5  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.333976 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2893  hypothetical protein  32.88 
 
 
165 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.337195  normal  0.917472 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1259  hypothetical protein  36.36 
 
 
148 aa  70.1  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0855  hypothetical protein  32.88 
 
 
178 aa  70.9  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275391  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1232  putative integral membrane protein  32.88 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3452  UPF0093 membrane protein  30.87 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0293  hypothetical protein  37.41 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1774  hypothetical protein  36.11 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.151606  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1495  hypothetical protein  36.11 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44802  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1215  hypothetical protein  34.48 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34192  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2065  hypothetical protein  33.1 
 
 
178 aa  68.6  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.101889  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0246  hypothetical protein  34.93 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.163595  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3207  hypothetical protein  36.43 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0101  hypothetical protein  33.56 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.761518  normal  0.0623119 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0119  hypothetical protein  35.86 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0394  hypothetical protein  30.28 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.776643  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0281  hypothetical protein  30.89 
 
 
138 aa  67.8  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.440714  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>