More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3473 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3473  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 
345 aa  716    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000213931  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3640  3-dehydroquinate synthase  68.33 
 
 
344 aa  482  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.280061 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0718  3-dehydroquinate synthase  52.8 
 
 
349 aa  343  2e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2812  3-dehydroquinate synthase  44.35 
 
 
355 aa  295  7e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105818  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1514  3-dehydroquinate synthase  43.95 
 
 
354 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.628425 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10553  3-dehydroquinate synthase  40.36 
 
 
358 aa  263  4e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1585  3-dehydroquinate synthase  42.38 
 
 
366 aa  251  1e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1247  3-dehydroquinate synthase  39.59 
 
 
353 aa  215  8e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1854  3-dehydroquinate synthase  39.12 
 
 
359 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0869188  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  41.56 
 
 
359 aa  212  9e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0786  3-dehydroquinate synthase  42.16 
 
 
360 aa  209  5e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0410044  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0995  3-dehydroquinate synthase  37.69 
 
 
369 aa  209  6e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0964  3-dehydroquinate synthase  37.38 
 
 
369 aa  209  6e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0087  3-dehydroquinate synthase  39.93 
 
 
345 aa  209  7e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0387598  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2358  3-dehydroquinate synthase  39.12 
 
 
367 aa  206  4e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0216034  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15571  3-dehydroquinate synthase  40.78 
 
 
372 aa  206  7e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.341963 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1241  3-dehydroquinate synthase  40.87 
 
 
361 aa  204  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  49.37 
 
 
362 aa  204  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  38.05 
 
 
366 aa  202  6e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  41.9 
 
 
376 aa  202  6e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  40.95 
 
 
372 aa  202  8e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2424  3-dehydroquinate synthase  34.78 
 
 
354 aa  201  9.999999999999999e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  47.68 
 
 
362 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  40.99 
 
 
368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1218  3-dehydroquinate synthase  37.7 
 
 
370 aa  200  3e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000176451  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  43.15 
 
 
368 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  41.88 
 
 
370 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  41.53 
 
 
368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2257  3-dehydroquinate synthase  42.81 
 
 
354 aa  197  3e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  41.87 
 
 
360 aa  197  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07421  3-dehydroquinate synthase  37.75 
 
 
368 aa  196  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00250573 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07971  3-dehydroquinate synthase  45.45 
 
 
370 aa  196  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.277449  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0787  3-dehydroquinate synthase  38.75 
 
 
388 aa  196  6e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  40.87 
 
 
368 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  42.18 
 
 
366 aa  195  8.000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  39.59 
 
 
359 aa  195  9e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1202  3-dehydroquinate synthase  38.18 
 
 
366 aa  195  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1438  3-dehydroquinate synthase  39.78 
 
 
346 aa  195  1e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000118856  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0116  3-dehydroquinate synthase  37.42 
 
 
368 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0690  3-dehydroquinate synthase  34.56 
 
 
355 aa  194  2e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5574  3-dehydroquinate synthase  41.03 
 
 
372 aa  193  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.751857  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  40.49 
 
 
368 aa  193  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0614  3-dehydroquinate synthase  42.35 
 
 
370 aa  193  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  38.44 
 
 
373 aa  193  4e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1265  3-dehydroquinate synthase  40.79 
 
 
348 aa  192  5e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  40.83 
 
 
359 aa  192  6e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1020  3-dehydroquinate synthase  45.41 
 
 
349 aa  192  7e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  41.84 
 
 
362 aa  192  8e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  43.59 
 
 
361 aa  192  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  38.61 
 
 
366 aa  192  9e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4545  3-dehydroquinate synthase  37.94 
 
 
352 aa  192  9e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1056  3-dehydroquinate synthase  38.49 
 
 
355 aa  192  9e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.859657  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  43.59 
 
 
363 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20809  3-dehydroquinate synthase  40.83 
 
 
431 aa  191  2e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  40.58 
 
 
359 aa  191  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  44.91 
 
 
365 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0296  3-dehydroquinate synthase  43.57 
 
 
359 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  42.65 
 
 
367 aa  190  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  42.65 
 
 
367 aa  191  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1820  3-dehydroquinate synthase  50 
 
 
360 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.774122  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  42.76 
 
 
370 aa  190  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  39.25 
 
 
358 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0696  3-dehydroquinate synthase  35.12 
 
 
352 aa  190  2.9999999999999997e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.701677  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0781  3-dehydroquinate synthase  36.73 
 
 
351 aa  190  2.9999999999999997e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  35 
 
 
366 aa  190  4e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  44.53 
 
 
365 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  44.53 
 
 
376 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  43.22 
 
 
359 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1441  3-dehydroquinate synthase  37.58 
 
 
361 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  42.32 
 
 
359 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  40.62 
 
 
368 aa  189  7e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  42.55 
 
 
359 aa  189  8e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  42.55 
 
 
359 aa  189  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  42.55 
 
 
359 aa  189  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  42.55 
 
 
359 aa  189  8e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  42.55 
 
 
359 aa  189  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  42.55 
 
 
359 aa  189  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  42.55 
 
 
359 aa  189  8e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1026  3-dehydroquinate synthase  34.54 
 
 
351 aa  188  9e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  42.86 
 
 
361 aa  188  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  40.22 
 
 
362 aa  188  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  44.53 
 
 
365 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  39.25 
 
 
358 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  39.59 
 
 
358 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0354  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  36.09 
 
 
593 aa  188  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  41.18 
 
 
358 aa  188  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  37.76 
 
 
359 aa  188  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1114  3-dehydroquinate synthase  39.64 
 
 
362 aa  188  1e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0407056  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  38.57 
 
 
359 aa  188  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  39.93 
 
 
359 aa  188  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3058  3-dehydroquinate synthase  36.36 
 
 
532 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0279861  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  43.17 
 
 
361 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1573  3-dehydroquinate synthase  36.31 
 
 
361 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  42.86 
 
 
359 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  38.91 
 
 
358 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  38.24 
 
 
366 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  38.24 
 
 
366 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  37.58 
 
 
367 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  36.76 
 
 
359 aa  187  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07551  3-dehydroquinate synthase  38.1 
 
 
363 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>