More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3422 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3422  peptide methionine sulfoxide reductase  100 
 
 		 220 aa  460  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  74.88 
 
 		 210 aa  319  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.306837  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1656  peptide methionine sulfoxide reductase  60.66 
 
 		 225 aa  256  3e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  55.37 
 
 		 184 aa  207  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1750  methionine sulfoxide reductase A  53.71 
 
 		 180 aa  195  5.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  57.76 
 
 		 228 aa  194  7e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  51.7 
 
 		 181 aa  193  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  54.07 
 
 		 197 aa  192  4e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  51.79 
 
 		 178 aa  191  5e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0847  methionine sulfoxide reductase A  56.65 
 
 		 177 aa  190  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6050  peptide methionine sulfoxide reductase  48.37 
 
 		 228 aa  190  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0375949  normal  0.155046 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1055  peptide methionine sulfoxide reductase  51.79 
 
 		 178 aa  190  2e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.300876  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2741  peptide methionine sulfoxide reductase  50.58 
 
 		 242 aa  189  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  51.74 
 
 		 182 aa  187  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1241  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  50.58 
 
 		 176 aa  186  2e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00589693  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2085  peptide methionine sulfoxide reductase  50.57 
 
 		 179 aa  186  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  52.63 
 
 		 183 aa  186  3e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  47.67 
 
 		 266 aa  186  3e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  53.94 
 
 		 176 aa  185  4e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3544  peptide methionine sulfoxide reductase  49.43 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  49.72 
 
 		 186 aa  182  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2636  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  44.62 
 
 		 301 aa  181  7e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000411372  normal  0.0277902 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0738  peptide methionine sulfoxide reductase  52.3 
 
 		 182 aa  181  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.931783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2452  methionine sulfoxide reductase A  55.94 
 
 		 158 aa  181  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2815  methionine sulfoxide reductase A  56.64 
 
 		 181 aa  180  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0725435  normal  0.0472359 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  51.72 
 
 		 186 aa  180  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2814  peptide methionine sulfoxide reductase  49.12 
 
 		 179 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  51.7 
 
 		 185 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2075  methionine sulfoxide reductase A  52.12 
 
 		 175 aa  179  4e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  49.71 
 
 		 181 aa  178  4.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0766611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3224  peptide methionine sulfoxide reductase  51.15 
 
 		 182 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1839  peptide methionine sulfoxide reductase  49.71 
 
 		 181 aa  178  5.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914253  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03638  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  48.57 
 
 		 181 aa  177  9e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.588348  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  47.43 
 
 		 182 aa  177  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0271  peptide methionine sulfoxide reductase  42.86 
 
 		 201 aa  177  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453594  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2559  peptide methionine sulfoxide reductase  46.56 
 
 		 211 aa  176  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.085304  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2946  peptide-methionine (S)-S-oxide reductase  46.56 
 
 		 198 aa  176  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0830  methionine sulfoxide reductase A  52.12 
 
 		 178 aa  175  6e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0328757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  49.71 
 
 		 208 aa  174  7e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3532  methionine sulfoxide reductase A  47.19 
 
 		 182 aa  174  7e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0197931 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1308  peptide methionine sulfoxide reductase  53.09 
 
 		 184 aa  174  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7117  peptide methionine sulfoxide reductase  48.02 
 
 		 204 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  46.33 
 
 		 184 aa  173  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0511  peptide methionine sulfoxide reductase  50.87 
 
 		 183 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340853  normal  0.134723 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4063  peptide methionine sulfoxide reductase  46.24 
 
 		 180 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00147413  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1044  peptide methionine sulfoxide reductase  44.02 
 
 		 211 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128569  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0074  peptide methionine sulfoxide reductase  49.71 
 
 		 177 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4817  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  45.93 
 
 		 184 aa  171  5.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0812  methionine sulfoxide reductase A  46.11 
 
 		 180 aa  171  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08631  peptide methionine sulfoxide reductase  44.94 
 
 		 179 aa  171  6.999999999999999e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.442698  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07826  hypothetical protein  42.06 
 
 		 219 aa  171  7.999999999999999e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3045  peptide methionine sulfoxide reductase  48.24 
 
 		 186 aa  171  7.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.735862  normal  0.359715 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5423  peptide methionine sulfoxide reductase  47.8 
 
 		 245 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.869651 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0784  methionine sulfoxide reductase A  49.15 
 
 		 195 aa  171  9e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.650631  normal  0.421282 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0714  peptide methionine sulfoxide reductase  49.14 
 
 		 277 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168728  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2588  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.26 
 
 		 301 aa  170  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3429  peptide methionine sulfoxide reductase  50.91 
 
 		 262 aa  170  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.737343  normal  0.0264207 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2632  methionine sulfoxide reductase A  46.47 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.712033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  49.09 
 
 		 180 aa  169  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3735  peptide methionine sulfoxide reductase  43.4 
 
 		 229 aa  169  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  48.84 
 
 		 209 aa  169  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  47.19 
 
 		 183 aa  170  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2184  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.82 
 
 		 301 aa  170  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2261  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.82 
 
 		 301 aa  170  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2393  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.82 
 
 		 301 aa  169  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0662  peptide methionine sulfoxide reductase  52.12 
 
 		 190 aa  169  4e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2491  peptide methionine sulfoxide reductase  48.57 
 
 		 185 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137451  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0356  peptide methionine sulfoxide reductase  48.57 
 
 		 185 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0154323  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0103  peptide methionine sulfoxide reductase  48.57 
 
 		 185 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0127961  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5903  protein-methionine-S-oxide reductase  41.79 
 
 		 199 aa  168  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.478627 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0725  peptide methionine sulfoxide reductase  47.7 
 
 		 186 aa  168  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.253534 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0714  methionine sulfoxide reductase A  49.43 
 
 		 186 aa  168  6e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0260056  normal  0.0517203 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0900  methionine-S-sulfoxide reductase  48.57 
 
 		 299 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0413553  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0897  methionine-S-sulfoxide reductase  48.57 
 
 		 287 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1857  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.33 
 
 		 301 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1058  peptide methionine sulfoxide reductase  48.57 
 
 		 293 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  51.88 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5961  methionine sulfoxide reductase A  48.52 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50461  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0655  peptide methionine sulfoxide reductase  48.57 
 
 		 287 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0461756  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1884  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.33 
 
 		 301 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0764  methionine sulfoxide reductase A  47.73 
 
 		 191 aa  166  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5355  methionine sulfoxide reductase A  47.54 
 
 		 247 aa  166  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.241935  normal  0.259253 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  45.93 
 
 		 180 aa  166  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5717  methionine sulfoxide reductase A  48.52 
 
 		 246 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210328  normal  0.517272 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1960  peptide methionine sulfoxide reductase  46.55 
 
 		 186 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.723901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2571  peptide methionine sulfoxide reductase  46.55 
 
 		 186 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1135  peptide methionine sulfoxide reductase  45.93 
 
 		 179 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2435  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.33 
 
 		 301 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.759859 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2619  peptide methionine sulfoxide reductase  46.55 
 
 		 186 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.79029  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  46.55 
 
 		 186 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697588  normal  0.995502 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3402  peptide methionine sulfoxide reductase  47.46 
 
 		 216 aa  165  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1517  methionine sulfoxide reductase A  48.24 
 
 		 236 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1447  peptide methionine sulfoxide reductase  44.83 
 
 		 182 aa  165  4e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1856  methionine sulfoxide reductase A  47.98 
 
 		 238 aa  165  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1172  peptide methionine sulfoxide reductase  47.62 
 
 		 175 aa  165  5e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0382873  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1891  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.33 
 
 		 302 aa  165  5e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.860262 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2598  peptide methionine sulfoxide reductase  47.13 
 
 		 180 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1169  peptide methionine sulfoxide reductase  46.07 
 
 		 243 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.745672 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2645  methionine sulfoxide reductase A  45 
 
 		 180 aa  164  6.9999999999999995e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1674  peptide methionine sulfoxide reductase  45.35 
 
 		 180 aa  164  8e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>