87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3393 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3393  Alpha-N-arabinofuranosidase  100 
 
 		 350 aa  725    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.179766 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0353  Alpha-N-arabinofuranosidase  50.32 
 
 		 340 aa  336  3.9999999999999995e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3081  Alpha-N-arabinofuranosidase  45.69 
 
 		 347 aa  300  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.174999 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2025  Alpha-N-arabinofuranosidase  42.54 
 
 		 376 aa  283  2.0000000000000002e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.620669  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1366  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.66 
 
 		 648 aa  248  1e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2237  glycoside hydrolase family 43  43.71 
 
 		 349 aa  238  1e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.572744  normal  0.998954 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0791  Alpha-L-arabinofuranosidase  39.71 
 
 		 607 aa  237  3e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.570389  normal  0.122086 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  37.04 
 
 		 580 aa  230  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2157  glycoside hydrolase family 43  38.03 
 
 		 627 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000434172  hitchhiker  0.0029689 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1547  putative beta-xylosidase  39.87 
 
 		 344 aa  226  4e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.000000631807  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3395  glycoside hydrolase family 43  39.94 
 
 		 355 aa  226  7e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2529  Alpha-N-arabinofuranosidase  41.12 
 
 		 355 aa  221  9.999999999999999e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0997912 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.57 
 
 		 466 aa  221  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2083  glycoside hydrolase family protein  38.82 
 
 		 634 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000179948  decreased coverage  0.0000000321687 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  42.9 
 
 		 507 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1979  glycoside hydrolase family protein  38.82 
 
 		 634 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00334232  hitchhiker  0.000434537 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1996  glycoside hydrolase family protein  38.82 
 
 		 634 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000718487  hitchhiker  0.0000398389 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3926  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.81 
 
 		 353 aa  219  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0161  alpha-N-arabinofuranosidase 2  40.58 
 
 		 316 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0165  alpha-N-arabinofuranosidase 2  40.58 
 
 		 316 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0160  alpha-N-arabinofuranosidase 2  40.26 
 
 		 316 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0162  alpha-N-arabinofuranosidase 2  40.26 
 
 		 316 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.41 
 
 		 316 aa  216  2.9999999999999998e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0168  alpha-N-arabinofuranosidase 2  40.26 
 
 		 316 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2050  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.95 
 
 		 628 aa  215  8e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03050  predicted beta-xylosidase  39.16 
 
 		 340 aa  211  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2151  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.24 
 
 		 392 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.923723  normal  0.103273 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4015  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.77 
 
 		 316 aa  205  7e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.374265 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0787  Alpha-L-arabinofuranosidase  36.69 
 
 		 362 aa  204  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000245228  normal  0.585497 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28680  predicted beta-xylosidase  39.56 
 
 		 341 aa  204  2e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1392  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.18 
 
 		 315 aa  203  4e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.973164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1858  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.14 
 
 		 505 aa  202  5e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2053  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.99 
 
 		 315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2055  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.31 
 
 		 369 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1984  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.2 
 
 		 378 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.807412  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2077  glycoside hydrolase family protein  37.54 
 
 		 377 aa  197  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000183532 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0777  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.14 
 
 		 314 aa  195  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1990  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.87 
 
 		 378 aa  195  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291978 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2154  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.36 
 
 		 315 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0709531  normal  0.0185421 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1983  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.23 
 
 		 333 aa  189  5e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131157  hitchhiker  0.000323815 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1991  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.23 
 
 		 333 aa  189  5e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535361  hitchhiker  0.0025818 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02533  glycosyl hydrolase, family 43, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01660)  36.51 
 
 		 329 aa  189  7e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2078  glycoside hydrolase family protein  35.51 
 
 		 333 aa  187  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000171617 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0501  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.58 
 
 		 426 aa  178  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1165  normal  0.486336 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6193  glycoside hydrolase family 43  35.31 
 
 		 502 aa  170  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1082  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.15 
 
 		 517 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.286531 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  30.67 
 
 		 2073 aa  158  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4199  glycoside hydrolase family 43  26.13 
 
 		 1278 aa  92  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1544  putative beta-xylosidase  28.78 
 
 		 710 aa  76.6  0.0000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.099307  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1302  putative beta-xylosidase  26.36 
 
 		 713 aa  75.5  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  25.42 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  27.25 
 
 		 384 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  31.49 
 
 		 495 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  26.58 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4284  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.02 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  24.84 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  24.18 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  24.51 
 
 		 524 aa  56.2  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  27.9 
 
 		 306 aa  54.7  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  27.42 
 
 		 472 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2813  glycoside hydrolase family 43  26.02 
 
 		 331 aa  54.7  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  25.17 
 
 		 537 aa  53.9  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  21.91 
 
 		 341 aa  53.1  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2732  glycoside hydrolase family 43  24.52 
 
 		 315 aa  53.1  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  25.32 
 
 		 522 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  22.61 
 
 		 501 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  22.65 
 
 		 345 aa  51.2  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  23.87 
 
 		 334 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  25.74 
 
 		 345 aa  50.8  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0989  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.6 
 
 		 334 aa  50.4  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0127699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.16 
 
 		 346 aa  50.4  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  24.63 
 
 		 699 aa  50.1  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  21.99 
 
 		 319 aa  49.7  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2371  glycoside hydrolase family 43  25.69 
 
 		 293 aa  50.1  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2654  glycoside hydrolase family 43  24.48 
 
 		 299 aa  49.3  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.435311  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3750  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.73 
 
 		 319 aa  47.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407758  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  23.22 
 
 		 540 aa  47.8  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  24.15 
 
 		 525 aa  47.4  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4281  glycoside hydrolase family protein  28.71 
 
 		 304 aa  47  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394059  normal  0.201547 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  22.36 
 
 		 535 aa  45.4  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2156  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.42 
 
 		 352 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000116592  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  21.75 
 
 		 325 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  21.01 
 
 		 855 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  22.49 
 
 		 357 aa  44.3  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  23.62 
 
 		 545 aa  43.1  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  22.09 
 
 		 330 aa  42.7  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>