33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3364 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3364  Curlin associated repeat protein  100 
 
 		 241 aa  457  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.730228  normal  0.191795 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4724  hypothetical protein  34.82 
 
 		 470 aa  70.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3095  curlin associated  32 
 
 		 498 aa  62  0.000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.33683  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6066  Curlin associated repeat protein  32.79 
 
 		 578 aa  58.5  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0721  curlin-associated protein  28.4 
 
 		 502 aa  55.5  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000376706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3413  curlin-associated protein  28 
 
 		 502 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.602514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4677  Curlin associated repeat protein  31.27 
 
 		 392 aa  54.7  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119342  normal  0.286934 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3499  curlin-associated protein  29.44 
 
 		 496 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.95975  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4726  Curlin associated repeat protein  32.35 
 
 		 415 aa  53.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6064  Curlin associated repeat protein  34.35 
 
 		 453 aa  52  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1877  Curlin associated repeat protein  31.53 
 
 		 441 aa  46.6  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3136  curlin-associated protein  27.67 
 
 		 496 aa  46.2  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1254  curlin minor subunit  39 
 
 		 151 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0865  hypothetical protein  26.1 
 
 		 502 aa  45.4  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2090  curlin minor subunit  41.58 
 
 		 160 aa  45.4  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.230335 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1516  curlin-associated protein  31.08 
 
 		 552 aa  45.4  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.977405  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0876  curlin-associated protein  30.69 
 
 		 496 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0841  curlin-associated protein  30.69 
 
 		 496 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1239  curlin minor subunit  38 
 
 		 151 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.486052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1209  curlin minor subunit  38 
 
 		 151 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.524993  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2047  curlin minor subunit  38 
 
 		 151 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00247074  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2230  curlin minor subunit  38 
 
 		 151 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2364  curlin-associated protein  28.62 
 
 		 498 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0645  curlin-associated protein  29.55 
 
 		 503 aa  43.5  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572248  unclonable  0.0000000277194 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0864  Curlin associated repeat protein  30.16 
 
 		 496 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2604  Curlin associated repeat protein  41 
 
 		 151 aa  43.1  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1160  curlin minor subunit  41 
 
 		 151 aa  43.1  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.48235  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1161  curlin minor subunit  41 
 
 		 160 aa  43.1  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.627916  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01045  hypothetical protein  41 
 
 		 151 aa  43.1  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2558  curlin minor subunit  41 
 
 		 151 aa  43.1  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.361683 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1421  curlin minor subunit  41 
 
 		 160 aa  43.1  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.256433 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01038  curlin nucleator protein, minor subunit in curli complex  41 
 
 		 151 aa  43.1  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0376  curlin-associated protein  28.99 
 
 		 564 aa  42  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>