287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3264 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
199 aa  410  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.15 
 
 
188 aa  157  7e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.71 
 
 
188 aa  155  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.55 
 
 
192 aa  148  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.19 
 
 
180 aa  145  6e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  43.39 
 
 
178 aa  144  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.84 
 
 
188 aa  144  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.77 
 
 
188 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  38.22 
 
 
181 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  37.17 
 
 
181 aa  129  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.64 
 
 
194 aa  128  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.83 
 
 
183 aa  128  7.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.62 
 
 
190 aa  125  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.95 
 
 
185 aa  125  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  37.37 
 
 
180 aa  125  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  39.89 
 
 
180 aa  123  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3049  dihydrofolate reductase  37.3 
 
 
177 aa  123  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.611041  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.15 
 
 
176 aa  123  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  37.97 
 
 
183 aa  123  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  37.17 
 
 
181 aa  122  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  38.42 
 
 
190 aa  122  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.13 
 
 
178 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.79 
 
 
187 aa  118  7e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1753  dihydrofolate reductase  34.57 
 
 
182 aa  117  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  37.23 
 
 
178 aa  116  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  37.23 
 
 
189 aa  114  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.97 
 
 
193 aa  114  8.999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  34.31 
 
 
215 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  32.98 
 
 
185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.34 
 
 
188 aa  111  7.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25630  dihydrofolate reductase  35.82 
 
 
196 aa  111  8.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.258312 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.31 
 
 
204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.98 
 
 
204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5174  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.13 
 
 
187 aa  109  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  34.55 
 
 
199 aa  109  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  33.51 
 
 
188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  33.51 
 
 
188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  33.51 
 
 
188 aa  107  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.26 
 
 
189 aa  106  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  35.83 
 
 
181 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  31.86 
 
 
204 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  36.6 
 
 
179 aa  105  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.03 
 
 
187 aa  105  6e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.898411  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.17 
 
 
185 aa  105  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.08 
 
 
187 aa  104  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291407  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3362  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.87 
 
 
186 aa  104  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  33.85 
 
 
180 aa  104  9e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1605  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.13 
 
 
187 aa  103  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.184387  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3196  bifunctional deaminase-reductase-like  32.97 
 
 
182 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.34 
 
 
221 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.64 
 
 
182 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.17 
 
 
188 aa  102  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3935  deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
181 aa  102  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0619635  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  34.39 
 
 
183 aa  101  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3394  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.97 
 
 
182 aa  101  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.836759  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34 
 
 
192 aa  101  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3071  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.83 
 
 
188 aa  101  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  33.66 
 
 
198 aa  100  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.61 
 
 
201 aa  100  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.67 
 
 
187 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  31.28 
 
 
183 aa  99.8  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4888  deaminase-reductase domain-containing protein  34.55 
 
 
187 aa  99.8  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.600343 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5813  deaminase-reductase domain-containing protein  34.87 
 
 
188 aa  99.4  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6617  deaminase-reductase domain-containing protein  34.36 
 
 
188 aa  99  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3644  hypothetical protein  38.74 
 
 
190 aa  98.6  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2243  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.55 
 
 
184 aa  98.6  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0952608  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  33.33 
 
 
221 aa  98.2  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36 
 
 
221 aa  97.1  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3320  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.87 
 
 
182 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0471  deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
184 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0146314  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.17 
 
 
212 aa  96.3  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.47 
 
 
217 aa  95.9  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  33.51 
 
 
179 aa  95.9  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1267  deaminase-reductase domain-containing protein  32.6 
 
 
200 aa  95.5  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.924885  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4785  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.74 
 
 
195 aa  95.5  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  30.73 
 
 
178 aa  94.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4303  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.48 
 
 
208 aa  93.2  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.933393  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.98 
 
 
181 aa  92.8  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4552  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.16 
 
 
183 aa  92.8  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7858  hypothetical protein  29.02 
 
 
199 aa  92.8  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.95 
 
 
189 aa  92.4  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4298  deaminase-reductase domain-containing protein  32.26 
 
 
186 aa  91.7  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.943714 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.16 
 
 
183 aa  91.3  8e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.61 
 
 
187 aa  90.5  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  31.44 
 
 
176 aa  90.1  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3635  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
208 aa  90.1  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3631  deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
205 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4109  deaminase-reductase domain-containing protein  29.76 
 
 
195 aa  89.4  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3842  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.16 
 
 
189 aa  88.6  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1797  deaminase-reductase domain-containing protein  30.21 
 
 
219 aa  87.8  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558254  hitchhiker  0.000529334 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  32.28 
 
 
178 aa  87  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4932  deaminase-reductase domain-containing protein  38.46 
 
 
182 aa  86.7  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.916718  normal  0.605792 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.5 
 
 
204 aa  87  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.69 
 
 
182 aa  86.3  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4321  bifunctional deaminase-reductase-like  31.05 
 
 
172 aa  86.3  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2336  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.65 
 
 
185 aa  86.3  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00114514  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  33.16 
 
 
199 aa  85.5  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  30.2 
 
 
228 aa  85.5  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4307  bifunctional deaminase-reductase-like  35.37 
 
 
167 aa  85.5  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.912167  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1513  deaminase-reductase domain-containing protein  30.85 
 
 
187 aa  85.5  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>