More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3263 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3263  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 326 aa  671    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3344  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  63.08 
 
 		 327 aa  447  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.430093 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2426  transcriptional regulator, AraC family  62.27 
 
 		 326 aa  444  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971153  normal  0.0916341 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1229  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  62.85 
 
 		 327 aa  436  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.134279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3787  transcriptional regulator  59.81 
 
 		 321 aa  425  1e-118  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1330  transcriptional regulator, AraC family  50.93 
 
 		 326 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.521973  normal  0.989615 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3759  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  52.32 
 
 		 326 aa  365  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1778  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  51.38 
 
 		 325 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.545321  normal  0.0235367 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1489  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  49.53 
 
 		 323 aa  345  8e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.616641 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2301  transcriptional regulator  50.77 
 
 		 324 aa  342  5e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0634001 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0442  hypothetical protein  50.16 
 
 		 326 aa  337  9.999999999999999e-92  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1772  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  48.4 
 
 		 293 aa  317  1e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0120296 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1733  transcriptional regulator, AraC family  42.59 
 
 		 322 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1182  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  39.01 
 
 		 324 aa  251  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.904069 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2762  transcriptional regulator, AraC family  40.43 
 
 		 332 aa  242  7.999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0171097 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5208  transcriptional regulator, AraC family  43.48 
 
 		 324 aa  237  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000934033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4511  transcriptional regulator, AraC family  36.14 
 
 		 339 aa  223  4e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.64274 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2142  AraC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 324 aa  217  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1705  helix-turn-helix domain-containing protein  36.99 
 
 		 320 aa  216  5e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.29723  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2508  transcriptional regulator  31.72 
 
 		 336 aa  199  6e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.207874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01004  Transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  32.63 
 
 		 329 aa  199  7.999999999999999e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0283206  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2846  AraC family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1003  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 332 aa  195  7e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194559  hitchhiker  0.0000278765 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0860  AraC family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 348 aa  185  7e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1313  AraC family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 306 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4411  helix-turn-helix domain-containing protein  32.64 
 
 		 334 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321471  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4536  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 334 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1599  transcriptional regulator  32.33 
 
 		 361 aa  179  7e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.97604  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2599  AraC family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 343 aa  178  9e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0125  transcriptional regulator  32.34 
 
 		 325 aa  178  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0720  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 326 aa  176  6e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016714 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0920  AraC family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 334 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4697  transcriptional regulator  32.75 
 
 		 331 aa  175  9e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207414  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4194  AraC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 335 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0109567  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4121  helix-turn-helix, AraC type  31.6 
 
 		 334 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0189  transcriptional regulator, AraC family  32.18 
 
 		 360 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.166962 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4427  transcriptional regulator, AraC family  30.12 
 
 		 336 aa  172  9e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.326492  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0104  AraC family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 328 aa  171  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0622  transcriptional regulator  31.9 
 
 		 340 aa  172  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553854  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0897  transcriptional regulator  28.92 
 
 		 335 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2221  transcriptional regulator  30.72 
 
 		 330 aa  170  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4083  AraC family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 341 aa  169  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0474473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05287  transcriptional activator FtrA  32.67 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0564  AraC family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 285 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.682443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5008  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 332 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4869  AraC family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 337 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1246  AraC family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.481495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57630  AraC family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.963773 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1553  transcriptional regulator  33.47 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.741987 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3778  AraC family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3785  AraC family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 335 aa  163  3e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1501  transcriptional regulator  32.01 
 
 		 347 aa  163  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3712  transcriptional regulator  32.08 
 
 		 336 aa  163  4.0000000000000004e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.990015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0072  transcriptional regulator  28.92 
 
 		 347 aa  162  9e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000158985 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  30.88 
 
 		 313 aa  161  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0068  transcriptional regulator  29.82 
 
 		 347 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2573  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  30.88 
 
 		 345 aa  159  5e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0070  transcriptional regulator  28.31 
 
 		 347 aa  159  7e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.020859 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1643  transcriptional regulator, AraC family  31.34 
 
 		 351 aa  159  8e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.671722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5041  transcriptional regulator  27.59 
 
 		 331 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00544571 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3593  AraC family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 342 aa  157  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1918  transcriptional regulator, AraC family  30.19 
 
 		 327 aa  157  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4589  AraC family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3975  transcriptional regulator  33.6 
 
 		 337 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4316  transcriptional regulator, AraC family  30.15 
 
 		 320 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0314  AraC family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 322 aa  150  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2234  AraC family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.962439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3506  AraC family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.939341  normal  0.0589755 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 316 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 342 aa  146  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  27.3 
 
 		 330 aa  145  9e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3556  transcriptional regulator  29.87 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.253425 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2675  transcriptional regulator, AraC family  30.5 
 
 		 344 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307401  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1857  AraC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 338 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18222 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4788  AraC family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 344 aa  141  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5005  AraC family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.081564 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  28.1 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  26.96 
 
 		 341 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3467  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 323 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0954  transcriptional regulator, AraC family  28.96 
 
 		 346 aa  139  8.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  26.18 
 
 		 319 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1693  AraC family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4080  transcriptional regulator  26.2 
 
 		 348 aa  136  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  26.93 
 
 		 324 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0282  AraC family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 342 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1506  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 345 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.570084  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 333 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6323  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 345 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.879961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6981  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 345 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0671274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2808  transcriptional regulator, AraC family  24.92 
 
 		 330 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2995  transcriptional regulator, AraC family  27.24 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5976  transcriptional regulator  25.39 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557743  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2121  transcriptional regulator, AraC family  26.61 
 
 		 341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3383  transcriptional regulator  26.56 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.690138  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0974  helix-turn-helix domain-containing protein  26.93 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.998994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3394  transcriptional regulator  26.56 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3445  transcriptional regulator  26.56 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.68449 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>