More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3221 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_0024  excinuclease ABC subunit C  56.1 
 
 		 596 aa  719    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3221  excinuclease ABC, C subunit  100 
 
 		 602 aa  1242    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.0605848 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0387  excinuclease ABC, C subunit  52.5 
 
 		 598 aa  647    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.971851 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1283  excinuclease ABC subunit C  54.12 
 
 		 596 aa  668    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04670  excinuclease ABC, C subunit  53.64 
 
 		 598 aa  666    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0175  excinuclease ABC, subunit C  51.51 
 
 		 596 aa  643    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.149834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5031  excinuclease ABC, C subunit  69.5 
 
 		 603 aa  879    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0726  excinuclease ABC subunit C  51.25 
 
 		 597 aa  648    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0477  excinuclease ABC, C subunit  48.76 
 
 		 615 aa  588  1e-166  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.966563  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1993  excinuclease ABC subunit C  47.35 
 
 		 599 aa  568  1e-161  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.589477 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0859  hypothetical protein  46.94 
 
 		 598 aa  552  1e-156  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00473 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  40.13 
 
 		 619 aa  472  1e-132  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  40.61 
 
 		 631 aa  473  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  40.92 
 
 		 629 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  39.7 
 
 		 616 aa  455  1e-127  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  38.78 
 
 		 628 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  39.23 
 
 		 627 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  39.9 
 
 		 615 aa  442  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  36.62 
 
 		 628 aa  427  1e-118  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  38.9 
 
 		 607 aa  412  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  38.66 
 
 		 594 aa  398  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  38.49 
 
 		 594 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  38.49 
 
 		 594 aa  397  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  38.49 
 
 		 594 aa  397  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  38.66 
 
 		 594 aa  395  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  38.49 
 
 		 594 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  38.22 
 
 		 591 aa  396  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  38.49 
 
 		 594 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  38.66 
 
 		 594 aa  396  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  38.49 
 
 		 594 aa  394  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  39.09 
 
 		 596 aa  394  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  38.66 
 
 		 594 aa  393  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  36.97 
 
 		 590 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  36.23 
 
 		 604 aa  379  1e-103  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  37.11 
 
 		 613 aa  374  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  34.93 
 
 		 641 aa  374  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  35.96 
 
 		 620 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  35.8 
 
 		 620 aa  371  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1145  excinuclease ABC, C subunit  36.97 
 
 		 594 aa  366  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0729  excinuclease ABC subunit C  36.32 
 
 		 594 aa  367  1e-100  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1222  excinuclease ABC subunit C  36.63 
 
 		 593 aa  367  1e-100  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.11085  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  34.98 
 
 		 624 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2709  excinuclease ABC subunit C  39.82 
 
 		 519 aa  367  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.890107  normal  0.0209335 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  34 
 
 		 601 aa  366  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  35.19 
 
 		 607 aa  366  1e-100  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  36.26 
 
 		 611 aa  365  1e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1205  excinuclease ABC subunit C  35.45 
 
 		 593 aa  365  2e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1227  excinuclease ABC subunit C  35.45 
 
 		 593 aa  365  2e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  34.7 
 
 		 607 aa  364  2e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  34.7 
 
 		 607 aa  363  4e-99  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  36.06 
 
 		 610 aa  363  4e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  36.63 
 
 		 613 aa  363  5.0000000000000005e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  35.41 
 
 		 599 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1280  excinuclease ABC subunit C  37.07 
 
 		 595 aa  363  5.0000000000000005e-99  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1544  excinuclease ABC, C subunit  34.44 
 
 		 659 aa  362  1e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.519608  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2526  excinuclease ABC subunit C  34.61 
 
 		 666 aa  360  3e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.775537  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  34.69 
 
 		 653 aa  359  7e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  34.62 
 
 		 656 aa  359  8e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  34.96 
 
 		 625 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0902  excinuclease ABC subunit C  34.91 
 
 		 658 aa  356  5e-97  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.839452  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  35.01 
 
 		 638 aa  356  6.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3041  excinuclease ABC subunit C  35.11 
 
 		 591 aa  355  1e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3014  excinuclease ABC, C subunit  34.28 
 
 		 675 aa  355  1e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1749  excinuclease ABC subunit C  38.62 
 
 		 527 aa  355  2e-96  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0671774  normal  0.123213 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  33.44 
 
 		 685 aa  354  2e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  34.07 
 
 		 628 aa  354  2.9999999999999997e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  36.02 
 
 		 610 aa  353  4e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2059  excinuclease ABC subunit C  34 
 
 		 692 aa  353  5e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0373675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15780  Excinuclease ABC subunit C  34.48 
 
 		 658 aa  352  1e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.160684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0936  excinuclease ABC subunit C  39.25 
 
 		 520 aa  352  1e-95  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0694942 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1044  excinuclease ABC, C subunit  36.57 
 
 		 616 aa  351  2e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00420676  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0044  excinuclease ABC, C subunit  34.83 
 
 		 613 aa  351  3e-95  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.101531  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  33.17 
 
 		 614 aa  350  5e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  34.69 
 
 		 588 aa  349  8e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0854  excinuclease ABC subunit C  37.61 
 
 		 526 aa  348  1e-94  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149188  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  33.98 
 
 		 613 aa  348  2e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1633  excinuclease ABC subunit C  34.14 
 
 		 705 aa  348  2e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.860828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  34.09 
 
 		 622 aa  346  7e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1093  excinuclease ABC subunit C  39.19 
 
 		 517 aa  346  8e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0158  excinuclease ABC subunit C  37.91 
 
 		 527 aa  345  1e-93  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15160  Excinuclease ABC subunit C  35.26 
 
 		 650 aa  345  1e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2975  excinuclease ABC, C subunit  34.09 
 
 		 708 aa  345  1e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.720202  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5206  excinuclease ABC, C subunit  32.59 
 
 		 649 aa  345  1e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2133  excinuclease ABC subunit C  35.07 
 
 		 604 aa  345  1e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00985622  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2359  excinuclease ABC, C subunit  32.09 
 
 		 671 aa  344  2e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.660798  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3337  excinuclease ABC subunit C  33.13 
 
 		 660 aa  344  2.9999999999999997e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0998705  hitchhiker  0.00117638 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6042  excinuclease ABC, C subunit  33.28 
 
 		 649 aa  344  2.9999999999999997e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1110  excinuclease ABC subunit C  34.92 
 
 		 641 aa  343  5e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.537728  normal  0.126972 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2194  excinuclease ABC, C subunit  33.44 
 
 		 684 aa  343  5.999999999999999e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.010209  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1823  excinuclease ABC subunit C  32.19 
 
 		 674 aa  343  5.999999999999999e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000135046 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1600  excinuclease ABC subunit C  37 
 
 		 527 aa  343  5.999999999999999e-93  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.0084899  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  35.22 
 
 		 617 aa  342  8e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  35.22 
 
 		 617 aa  342  8e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1060  excinuclease ABC subunit C  34.57 
 
 		 658 aa  341  2e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.41739  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3154  excinuclease ABC, C subunit  32.98 
 
 		 669 aa  340  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  33.61 
 
 		 599 aa  340  4e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1252  excinuclease ABC, C subunit  33.59 
 
 		 647 aa  340  4e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2478  excinuclease ABC, C subunit  34.82 
 
 		 652 aa  340  5e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.446818  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20070  Excinuclease ABC subunit C  33.39 
 
 		 703 aa  339  9e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0431256  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3109  excinuclease ABC subunit C  32.72 
 
 		 665 aa  339  9e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.116982  normal  0.254629 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>