276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3214 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  100 
 
 
164 aa  318  9.999999999999999e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5023  ATP synthase F0, B subunit  58.67 
 
 
151 aa  176  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.203888  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  46.95 
 
 
164 aa  159  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  42.68 
 
 
164 aa  148  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  46.3 
 
 
165 aa  147  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0181  F0F1 ATP synthase subunit B  45.12 
 
 
167 aa  147  7e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1057  F0F1 ATP synthase subunit B  45.18 
 
 
166 aa  133  8e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1716  ATP synthase F0, B subunit  41.46 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000198199  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0063  ATP synthase F0 subunit B  37.2 
 
 
164 aa  119  9.999999999999999e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  36.42 
 
 
175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  36.08 
 
 
175 aa  107  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  37.97 
 
 
175 aa  105  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  36.71 
 
 
175 aa  105  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  35.9 
 
 
175 aa  103  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  36.08 
 
 
175 aa  101  6e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2707  F0F1 ATP synthase subunit B  37.97 
 
 
175 aa  94.4  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  30.92 
 
 
178 aa  80.5  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0313  ATP synthase F0, B subunit  35.95 
 
 
171 aa  80.5  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154955  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  33.55 
 
 
168 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  34.03 
 
 
167 aa  78.6  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  31.79 
 
 
194 aa  77.8  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  32.28 
 
 
164 aa  77.8  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  32.24 
 
 
162 aa  77  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  31.61 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  31.47 
 
 
171 aa  75.9  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  32.24 
 
 
179 aa  75.1  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  32.69 
 
 
179 aa  74.7  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  30.97 
 
 
168 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  34.15 
 
 
164 aa  74.3  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  30.97 
 
 
168 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  33.11 
 
 
174 aa  74.3  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2144  F0F1 ATP synthase subunit B  31.94 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0180  F0F1 ATP synthase subunit B  31.94 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  33.33 
 
 
166 aa  74.3  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5107  F0F1 ATP synthase subunit B  30.97 
 
 
168 aa  74.3  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.164846  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  32.93 
 
 
164 aa  73.9  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  30.97 
 
 
168 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  31.01 
 
 
193 aa  73.6  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5159  F0F1 ATP synthase subunit B  30.97 
 
 
168 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4992  F0F1 ATP synthase subunit B  30.97 
 
 
168 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.416511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5009  F0F1 ATP synthase subunit B  30.97 
 
 
168 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5400  F0F1 ATP synthase subunit B  30.97 
 
 
168 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95382e-52 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5551  F0F1 ATP synthase subunit B  30.97 
 
 
168 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0100473  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5431  F0F1 ATP synthase subunit B  30.97 
 
 
168 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  32.05 
 
 
179 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1428  ATP synthase F0, B subunit  30.87 
 
 
163 aa  73.6  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.221942  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  30.2 
 
 
172 aa  72.8  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4485  ATP synthase F0, B subunit  31.58 
 
 
175 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.594987  normal  0.141672 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  29.41 
 
 
200 aa  71.2  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  30.22 
 
 
173 aa  70.9  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  30.22 
 
 
173 aa  70.9  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3284  F0F1 ATP synthase subunit B  31.97 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294476  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3031  F0F1 ATP synthase subunit B  32.65 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0008  ATP synthase F0, B subunit  31.94 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.320711  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0036  F0F1 ATP synthase subunit B  31.97 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00144365  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3530  F0F1 ATP synthase subunit B  29.63 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037276 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3898  F0F1 ATP synthase subunit B  31.97 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18240  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  31.01 
 
 
192 aa  68.6  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.539535  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  31.29 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0367309  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  24.68 
 
 
206 aa  68.2  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0093  F0F1 ATP synthase subunit B  31.29 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0481406  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4874  F0F1 ATP synthase subunit B  32.12 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0118  F0F1 ATP synthase subunit B  31.29 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100936  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2953  F0F1 ATP synthase subunit B  31.29 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043981  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  31.29 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776663  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0859  F0F1 ATP synthase subunit B  31.69 
 
 
165 aa  67.4  0.00000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0732161  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6360  F0F1 ATP synthase subunit B  31.13 
 
 
156 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  27.52 
 
 
156 aa  67  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  30.23 
 
 
173 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  31.29 
 
 
156 aa  67  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000584216  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0368  F0F1 ATP synthase subunit B  32.59 
 
 
156 aa  67  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.685642  normal  0.393865 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2953  F0F1 ATP synthase subunit B  32.17 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193165  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0416  F0F1 ATP synthase subunit B  33.58 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.489173  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0183  F0F1 ATP synthase subunit B  32.17 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3312  F0F1 ATP synthase subunit B  32.17 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0288951  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3879  ATP synthase F0, B subunit  29.37 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000993244  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3359  F0F1 ATP synthase subunit B  32.17 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3011  F0F1 ATP synthase subunit B  32.17 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209415  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1591  F0F1 ATP synthase subunit B  32.17 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000339431  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3972  F0F1 ATP synthase subunit B  32.17 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.993966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4046  F0F1 ATP synthase subunit B  32.17 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0067  ATP synthase F0, B subunit  26.67 
 
 
175 aa  65.5  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0476  F0F1 ATP synthase subunit B  32.84 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.219933  normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0323  F0F1 ATP synthase subunit B  31.11 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.601696 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  30.07 
 
 
203 aa  64.7  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1873  F0F1-type ATP synthase, subunit b  31.88 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2141  ATP synthase F0, B subunit  32.43 
 
 
163 aa  63.9  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  29.22 
 
 
194 aa  63.9  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3309  F0F1 ATP synthase subunit B  26 
 
 
156 aa  63.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384998  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0022  ATP synthase F0, B subunit  30.22 
 
 
156 aa  63.2  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0311887  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73290  F0F1 ATP synthase subunit B  29.8 
 
 
156 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1068  ATP synthase F0, B subunit  30.92 
 
 
193 aa  62.4  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2873  F0F1 ATP synthase subunit B  29.01 
 
 
146 aa  62.8  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.405678  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0304  F0F1 ATP synthase subunit B  31.85 
 
 
156 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00801796 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  28.47 
 
 
203 aa  62.4  0.000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0110  F0F1 ATP synthase subunit B  30.37 
 
 
156 aa  62  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000261662  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2452  ATP synthase F0, B subunit  28.1 
 
 
194 aa  61.6  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  27.27 
 
 
166 aa  62  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3920  ATP synthase F0, B subunit  31.41 
 
 
182 aa  61.2  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  29.8 
 
 
189 aa  61.6  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>