More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3199 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1604  two component transcriptional regulator, AraC family  43.73 
 
 		 904 aa  766    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3199  two component transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 940 aa  1929    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157032  normal  0.236848 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0220  two component transcriptional regulator, AraC family  35.25 
 
 		 934 aa  579  1.0000000000000001e-163  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497584  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  37.97 
 
 		 1370 aa  369  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  37.5 
 
 		 1378 aa  360  9e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  38.25 
 
 		 1306 aa  357  5.999999999999999e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  35.01 
 
 		 1374 aa  350  9e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  36.27 
 
 		 1373 aa  341  2.9999999999999998e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  36.47 
 
 		 1374 aa  337  9e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  35.16 
 
 		 1366 aa  334  4e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  32.19 
 
 		 1418 aa  334  5e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  34.73 
 
 		 1340 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  32.55 
 
 		 1384 aa  327  8.000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  33.52 
 
 		 1366 aa  325  2e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  36.21 
 
 		 1397 aa  325  2e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  32.46 
 
 		 1373 aa  320  7e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  33.33 
 
 		 1335 aa  320  1e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  33.45 
 
 		 1347 aa  315  2.9999999999999996e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  35.2 
 
 		 1355 aa  313  1e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  32.04 
 
 		 1400 aa  313  1e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  35.15 
 
 		 1388 aa  312  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 1341 aa  309  2.0000000000000002e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  35.27 
 
 		 1343 aa  304  6.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6047  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  35.24 
 
 		 677 aa  302  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  34 
 
 		 1378 aa  300  7e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  32.33 
 
 		 1355 aa  299  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  33.88 
 
 		 1363 aa  298  2e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  32.18 
 
 		 1344 aa  296  2e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2723  histidine kinase  31.22 
 
 		 1347 aa  292  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  33.33 
 
 		 1324 aa  290  8e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2980  histidine kinase  34.7 
 
 		 1311 aa  288  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229379  normal  0.450681 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2318  histidine kinase  33.51 
 
 		 1298 aa  288  4e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  36.17 
 
 		 1278 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  32.94 
 
 		 1342 aa  284  5.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1754  histidine kinase  33.68 
 
 		 1344 aa  282  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.176495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  31.57 
 
 		 1349 aa  283  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4604  histidine kinase  34.44 
 
 		 663 aa  277  6e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1797  DNA-binding response regulator/sensor histidine kinase  29.98 
 
 		 961 aa  275  3e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  32.19 
 
 		 1334 aa  270  7e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1489  histidine kinase  31.01 
 
 		 1404 aa  266  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639294  normal  0.537564 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0756  sensory box sensor histidine kinase/DNA-binding response regulator  32.3 
 
 		 993 aa  263  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2019  histidine kinase  32.12 
 
 		 1316 aa  260  7e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523526  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1905  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  32.68 
 
 		 668 aa  260  1e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0295515  normal  0.210974 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1470  histidine kinase  29.48 
 
 		 1376 aa  258  4e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0500626  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  32.57 
 
 		 1313 aa  254  7e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0559  histidine kinase  31.83 
 
 		 1327 aa  248  4e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00477073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1562  histidine kinase  29.52 
 
 		 1296 aa  247  6.999999999999999e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.655639  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  29.68 
 
 		 1374 aa  244  7.999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  34.55 
 
 		 1202 aa  239  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 		 1153 aa  234  6e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359014  hitchhiker  0.0000017622 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0148  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.28 
 
 		 1048 aa  233  9e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3745  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 1010 aa  233  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.412805  hitchhiker  0.00597184 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.6 
 
 		 1426 aa  230  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  36.36 
 
 		 1180 aa  229  2e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.61 
 
 		 1711 aa  229  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 1299 aa  227  7e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  32.63 
 
 		 1427 aa  226  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  34.77 
 
 		 1156 aa  226  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1699  ATP-binding region, ATPase-like protein  30.84 
 
 		 1396 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170141  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 		 1383 aa  220  7.999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  29.3 
 
 		 1152 aa  220  8.999999999999998e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 		 1131 aa  220  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.49 
 
 		 1431 aa  217  7e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4318  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.23 
 
 		 322 aa  216  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0871118  normal  0.0590725 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.08 
 
 		 1415 aa  217  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 1118 aa  215  2.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000390432  normal  0.0407868 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.38 
 
 		 1559 aa  214  5.999999999999999e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.66 
 
 		 1390 aa  214  9e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0867  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.35 
 
 		 330 aa  213  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000788488 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.5 
 
 		 1390 aa  213  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.5 
 
 		 1390 aa  213  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 1385 aa  209  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  31.06 
 
 		 876 aa  208  4e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  27.3 
 
 		 1414 aa  207  6e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 		 1140 aa  207  9e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4489  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.01 
 
 		 334 aa  206  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  decreased coverage  0.000667621 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4608  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 1645 aa  205  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.284957  normal  0.407853 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.75 
 
 		 975 aa  204  9e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.817585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 1370 aa  203  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4411  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.48 
 
 		 1514 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0203527 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 		 1383 aa  203  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.88 
 
 		 1248 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 1003 aa  202  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.54 
 
 		 1051 aa  201  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4349  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.25 
 
 		 1514 aa  201  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 1002 aa  201  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4814  histidine kinase  30.86 
 
 		 919 aa  201  7.999999999999999e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00150972  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2687  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 		 1013 aa  200  9e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  33.78 
 
 		 1172 aa  199  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 1361 aa  195  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.16 
 
 		 1406 aa  194  9e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2406  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.6 
 
 		 1301 aa  193  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0691  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.26 
 
 		 335 aa  192  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0990716 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2084  sensor histidine kinase  29.13 
 
 		 816 aa  188  3e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.62 
 
 		 1646 aa  187  7e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 		 978 aa  187  8e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149383  normal  0.186346 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2074  sensor histidine kinase  28.93 
 
 		 816 aa  187  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.37 
 
 		 1631 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.14 
 
 		 1287 aa  185  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.54 
 
 		 1651 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>