More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3183 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3183  PfkB domain protein  100 
 
 
297 aa  610  1e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.208459  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1600  PfkB domain protein  52.56 
 
 
305 aa  295  5e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0562  PfkB domain protein  44.68 
 
 
299 aa  242  5e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4043  ribokinase-like domain-containing protein  39.93 
 
 
303 aa  236  3e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1904  ribokinase-like domain-containing protein  40 
 
 
306 aa  224  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0842808  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3763  PfkB domain protein  33.22 
 
 
301 aa  181  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00234329  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1054  ribokinase family sugar kinase  34.83 
 
 
300 aa  176  5e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553217  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0205  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  34.45 
 
 
298 aa  161  1e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0462  kinase, PfkB family  32.76 
 
 
300 aa  160  4e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0221  PfkB domain protein  32.99 
 
 
292 aa  159  5e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.349538  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1998  PfkB domain protein  32.23 
 
 
312 aa  152  5e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0367  ribokinase-like domain-containing protein  29.39 
 
 
296 aa  146  4.0000000000000006e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000567214 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3273  ribokinase-like domain-containing protein  33.45 
 
 
320 aa  146  5e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.225179  normal  0.109197 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2609  PfkB  35.66 
 
 
311 aa  144  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1796  PfkB  35.27 
 
 
293 aa  142  7e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000052274  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2838  fructokinase  31.96 
 
 
324 aa  142  9e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.050359  normal  0.34699 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0649  ribokinase-like domain-containing protein  32.63 
 
 
308 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0225975  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2522  putative fructokinase  31.94 
 
 
300 aa  139  7e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000987488  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0095  PfkB domain protein  36.04 
 
 
294 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2268  PfkB  32.53 
 
 
296 aa  129  6e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.985563  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0018  PfkB domain protein  27.7 
 
 
300 aa  125  7e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2911  PfkB domain protein  34.15 
 
 
320 aa  122  5e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3070  PfkB family of carbohydrate kinase  32.88 
 
 
305 aa  120  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4230  PfkB domain protein  30.45 
 
 
302 aa  119  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1550  carbohydrate kinase, PfkB family  28.12 
 
 
303 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1266  PfkB domain protein  28.12 
 
 
303 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.341209 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  28.04 
 
 
319 aa  104  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  29.81 
 
 
333 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2118  PfkB domain protein  27.16 
 
 
307 aa  101  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  29.01 
 
 
333 aa  99.4  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4605  PfkB domain protein  28.57 
 
 
329 aa  99  9e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2734  PfkB  26.61 
 
 
327 aa  99  9e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.228263  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  27.39 
 
 
304 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0033  PfkB domain protein  32.62 
 
 
294 aa  95.9  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.49998  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  27.12 
 
 
322 aa  94.4  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  26.73 
 
 
304 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  25.73 
 
 
325 aa  94.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  30.3 
 
 
311 aa  94.4  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1715  PfkB domain protein  30.04 
 
 
334 aa  92.4  8e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.189965 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  29.28 
 
 
307 aa  92.4  8e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  24.61 
 
 
323 aa  92.4  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  29.85 
 
 
307 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  28.43 
 
 
311 aa  91.3  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  29.3 
 
 
324 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  28.43 
 
 
317 aa  89.4  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  27.41 
 
 
323 aa  89  8e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  24.84 
 
 
308 aa  87.8  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  27.62 
 
 
304 aa  86.7  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1617  hypothetical protein  25.41 
 
 
628 aa  85.5  9e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  25.88 
 
 
323 aa  85.5  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  29.01 
 
 
298 aa  85.5  9e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  26.33 
 
 
306 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  26.52 
 
 
315 aa  84  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0744  PfkB domain protein  26.98 
 
 
311 aa  83.6  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  25.99 
 
 
323 aa  83.6  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1622  hypothetical protein  26.26 
 
 
628 aa  83.2  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  26.93 
 
 
313 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  26.83 
 
 
315 aa  82  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  24.17 
 
 
319 aa  81.3  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1030  PfkB domain protein  26.13 
 
 
329 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185699  normal  0.340834 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  31.2 
 
 
329 aa  81.3  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  26.03 
 
 
319 aa  80.5  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  26.42 
 
 
313 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0116  fructokinase  28 
 
 
324 aa  80.5  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.393597  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  26.03 
 
 
319 aa  80.5  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  23.72 
 
 
320 aa  80.5  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1118  PfkB domain protein  30.38 
 
 
316 aa  79.3  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59245  normal  0.875512 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3619  PfkB domain-containing protein  28.37 
 
 
309 aa  78.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2315  ribokinase-like domain-containing protein  27.63 
 
 
636 aa  77.8  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  26.35 
 
 
319 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  26.35 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  26.01 
 
 
319 aa  76.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5753  PfkB domain protein  25.57 
 
 
326 aa  75.9  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231801  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0534  ribokinase-like domain-containing protein  25.99 
 
 
293 aa  75.9  0.0000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.690237  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1421  PfkB  32.64 
 
 
284 aa  75.9  0.0000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0830137 
 
 
-
 
NC_003296  RS05325  sugar kinase protein  29.26 
 
 
307 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244562  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26450  sugar kinase, ribokinase  30.8 
 
 
317 aa  75.5  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.184834  normal  0.35054 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  26.82 
 
 
642 aa  75.5  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4203  aminoimidazole riboside kinase  27.45 
 
 
309 aa  75.5  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  26.01 
 
 
319 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2234  PfkB domain protein  26.38 
 
 
319 aa  74.7  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  32.47 
 
 
319 aa  74.7  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  26.01 
 
 
308 aa  74.3  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1516  ribokinase-like domain-containing protein  29.17 
 
 
312 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115005  normal  0.017116 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  25.49 
 
 
320 aa  73.9  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01731  putative carbohydrate kinase  26.01 
 
 
346 aa  73.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  24.76 
 
 
337 aa  73.6  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4312  aminoimidazole riboside kinase  25.68 
 
 
319 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3485  PfkB domain protein  26.18 
 
 
347 aa  73.6  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3008  PfkB domain protein  28.57 
 
 
343 aa  73.6  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.554278  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1060  PfkB  29.55 
 
 
312 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0025  ribokinase-like domain-containing protein  22.92 
 
 
307 aa  73.2  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.112625  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1540  ribokinase-like domain-containing protein  29.55 
 
 
312 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  25.61 
 
 
321 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  28.3 
 
 
306 aa  73.2  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7803  PfkB domain protein  25.24 
 
 
640 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0909  fructokinase  25.53 
 
 
314 aa  72.4  0.000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0720396  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0424  ribokinase-like domain-containing protein  25.9 
 
 
333 aa  72.4  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.808327  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18191  putative carbohydrate kinase  26.82 
 
 
332 aa  72.4  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  23.62 
 
 
290 aa  72.4  0.000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>