More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3110 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3110  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
325 aa  667    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5246  glycosyl transferase family protein  46.13 
 
 
348 aa  266  5e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0170348 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5040  glycosyl transferase family 2  39.01 
 
 
323 aa  247  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.0567661 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5590  glycosyl transferase family 2  41.09 
 
 
328 aa  245  6e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4384  glycosyl transferase family protein  42.64 
 
 
328 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6397  glycosyl transferase family protein  42.19 
 
 
333 aa  229  6e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.441453  normal  0.138484 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5443  glycosyl transferase family protein  41.51 
 
 
333 aa  226  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.966664  hitchhiker  0.00908127 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  40.24 
 
 
344 aa  226  6e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  40.24 
 
 
344 aa  226  6e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5649  glycosyl transferase family protein  41.25 
 
 
333 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0900976  normal  0.264223 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1382  glycosyl transferase family protein  41.56 
 
 
333 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6447  glycosyl transferase family protein  41.56 
 
 
333 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0237769  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6038  glycosyl transferase family protein  41.38 
 
 
333 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.738252 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3168  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.56 
 
 
333 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1987  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.56 
 
 
333 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3039  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.56 
 
 
333 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200076  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1386  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.56 
 
 
333 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.343804  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2274  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.56 
 
 
333 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.102891  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1298  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.56 
 
 
333 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.472979  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1010  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.56 
 
 
333 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.374388  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2643  family 2 glycosyl transferase  34.51 
 
 
321 aa  146  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0716  HAD family hydrolase  36.64 
 
 
501 aa  126  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.358199  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11260  histidinol-phosphate phosphatase family protein  30.94 
 
 
499 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130521  normal  0.23358 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4035  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
344 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1570  hydrolase, HAD-superfamily, subfamily IIIA  36.25 
 
 
498 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.892629  normal  0.0176466 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4024  glycosyl transferase family protein  32.51 
 
 
322 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3182  glycosyl transferase family 2  32.32 
 
 
322 aa  110  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3169  glycosyl transferase family 2  33.75 
 
 
344 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0456  hydrolase, HAD-superfamily, subfamily IIIA  33.02 
 
 
499 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  30.99 
 
 
305 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  27.84 
 
 
528 aa  99.8  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2081  glycosyl transferase  29.92 
 
 
316 aa  99.4  7e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  31.13 
 
 
305 aa  99.4  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  27.4 
 
 
309 aa  97.8  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16631  glycosyl transferase family protein  28.96 
 
 
314 aa  98.2  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.505772 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1221  glycosyltransferase  31.37 
 
 
310 aa  97.1  4e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.628351  normal  0.475099 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 
924 aa  91.7  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3194  glycosyl transferase family 2  30.36 
 
 
455 aa  89  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0156  glycosyl transferase family protein  26.29 
 
 
310 aa  89  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  23.76 
 
 
337 aa  88.6  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0760  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
303 aa  88.6  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08131  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 
303 aa  89  1e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0300  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 
322 aa  87.8  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2064  glycosyl transferase family protein  27.57 
 
 
322 aa  88.2  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.346015  normal  0.195007 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1248  glycosyltransferase  30.08 
 
 
310 aa  88.2  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0573246  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3149  glycosyl transferase family protein  31.64 
 
 
753 aa  88.2  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  29.72 
 
 
333 aa  88.2  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3632  glycosyl transferase family 2  29.15 
 
 
310 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2476  glycosyl transferase family 2  29.15 
 
 
310 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0466  glycosyl transferase family protein  32.39 
 
 
302 aa  87  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0600433  unclonable  0.0000113237 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1959  glycosyl transferase family 2  31.34 
 
 
321 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  31.23 
 
 
301 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07881  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 
310 aa  86.7  5e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.111057  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08121  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
303 aa  85.9  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4887  family 2 glycosyl transferase  28.95 
 
 
312 aa  85.9  9e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0883  glycosyl transferase family protein  29.75 
 
 
310 aa  85.9  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.178472 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0155  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 
298 aa  85.1  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  25.51 
 
 
310 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3671  glycosyl transferase family 2  31.34 
 
 
300 aa  85.1  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  30.5 
 
 
272 aa  84.3  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2893  glycosyl transferase family 2  29.92 
 
 
312 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10111  glycosyl transferase family protein  27.05 
 
 
310 aa  82.8  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0906885 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08321  glycosyl transferase family protein  26.86 
 
 
305 aa  82.4  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.389273  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  31.66 
 
 
328 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0884  b-glycosyltransferase  31.53 
 
 
283 aa  82.4  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030368  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2889  glycosyltransferase-like  25.83 
 
 
316 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2811  glycosyl transferase family 2  30.71 
 
 
307 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.104457 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
477 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  34.1 
 
 
792 aa  79.7  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2354  glycosyl transferase family protein  32.56 
 
 
297 aa  79.3  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.358669  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  30.73 
 
 
700 aa  79.3  0.00000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4928  glycosyl transferase family 2  32.88 
 
 
513 aa  79  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3930  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 
413 aa  78.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.555455  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  27.85 
 
 
304 aa  77.8  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5057  glycosyl transferase family protein  28.78 
 
 
470 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3392  glycosyl transferase family protein  25.88 
 
 
287 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3045  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 
305 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.144194  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1842  glycosyl transferase family 2  30.09 
 
 
884 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0962  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 
302 aa  77.4  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153227  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1299  glycosyl transferase family protein  32.66 
 
 
470 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0628268 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  25.23 
 
 
754 aa  77  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 
260 aa  77  0.0000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  30.85 
 
 
270 aa  76.6  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3678  glycosyl transferase family 2  31.2 
 
 
289 aa  76.6  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
703 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  25.11 
 
 
1739 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4811  glycosyl transferase family protein  30.05 
 
 
296 aa  75.9  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0562573  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1272  glycosyl transferase family 2  31.12 
 
 
306 aa  75.5  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.294715  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  31.6 
 
 
335 aa  75.5  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  25.69 
 
 
525 aa  74.7  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0379  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 
891 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 
311 aa  73.9  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  29.74 
 
 
337 aa  73.9  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2989  family 2 glycosyl transferase  28.48 
 
 
322 aa  73.6  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4143  glycosyl transferase family protein  32.71 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.89997 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  31.05 
 
 
345 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1147  glycosyl transferase family 2  29.22 
 
 
338 aa  72.8  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.466774  hitchhiker  0.00852999 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2063  glycosyl transferase family 2  29.22 
 
 
321 aa  71.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4588  glycosyl transferase family protein  26.4 
 
 
307 aa  71.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.151626  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  26.87 
 
 
312 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>