More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3074 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1305  glycosyl transferase family 51  46.33 
 
 		 767 aa  675    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.551332 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0981  hypothetical protein  45.91 
 
 		 786 aa  690    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3220  glycosyl transferase family 51  45.32 
 
 		 785 aa  690    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259437  normal  0.206704 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1915  glycosyl transferase family 51  47.91 
 
 		 815 aa  729    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.70734 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4764  glycosyl transferase family 51  55.54 
 
 		 850 aa  935    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193555  normal  0.0626376 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5029  glycosyl transferase family 51  47.46 
 
 		 765 aa  687    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0176  glycosyltransferase  47.04 
 
 		 762 aa  685    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.368405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3131  glycosyltransferase  47.46 
 
 		 759 aa  675    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47312  normal  0.698693 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3074  glycosyl transferase family 51  100 
 
 		 854 aa  1776    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.846458 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1474  glycosyl transferase family 51  42.11 
 
 		 772 aa  590  1e-167  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0249209  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0889  glycosyl transferase family protein  42.26 
 
 		 768 aa  591  1e-167  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1888  glycosyltransferase  43.1 
 
 		 743 aa  575  1.0000000000000001e-162  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03455  penicillin-binding protein 1A  41.08 
 
 		 773 aa  566  1e-160  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0388  glycosyl transferase family 51  40.3 
 
 		 740 aa  525  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6609  glycosyl transferase family 51  38.47 
 
 		 794 aa  488  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.911258  normal  0.0344936 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0274  penicillin-binding protein, 1A family  39.24 
 
 		 783 aa  479  1e-133  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0794  penicillin-binding protein 1A, putative  38.63 
 
 		 786 aa  475  1e-132  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  38.71 
 
 		 762 aa  433  1e-120  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3899  peptidoglycan glycosyltransferase  36.79 
 
 		 821 aa  434  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4618  glycosyl transferase family protein  35.98 
 
 		 728 aa  429  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4875  peptidoglycan glycosyltransferase  36.17 
 
 		 850 aa  429  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1674  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.12 
 
 		 846 aa  427  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.339847  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3770  peptidoglycan glycosyltransferase  36.66 
 
 		 870 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345724  normal  0.277872 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4244  peptidoglycan glycosyltransferase  36.79 
 
 		 857 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  38.13 
 
 		 752 aa  426  1e-117  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2081  glycosyl transferase family protein  37.12 
 
 		 846 aa  426  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45351  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2469  glycosyl transferase family protein  37.85 
 
 		 846 aa  426  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5146  peptidoglycan glycosyltransferase  35.9 
 
 		 732 aa  426  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.725403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1252  glycosyltransferase  35.73 
 
 		 776 aa  425  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4361  peptidoglycan glycosyltransferase  37.5 
 
 		 857 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.885871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1120  glycosyl transferase family 51  35.55 
 
 		 907 aa  419  1e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5259  peptidoglycan glycosyltransferase  36.68 
 
 		 743 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1659  peptidoglycan glycosyltransferase  37.04 
 
 		 862 aa  422  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0514214  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5014  peptidoglycan glycosyltransferase  36.55 
 
 		 743 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0205014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3108  peptidoglycan glycosyltransferase  36.68 
 
 		 743 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4006  peptidoglycan glycosyltransferase  37.5 
 
 		 857 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237546  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5993  peptidoglycan glycosyltransferase  36.65 
 
 		 858 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  37.18 
 
 		 730 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0392  peptidoglycan glycosyltransferase  36.07 
 
 		 742 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.431383 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4259  peptidoglycan glycosyltransferase  36.94 
 
 		 888 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.990931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2197  putative penicillin-binding 1 (peptidoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  36.95 
 
 		 838 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633683  decreased coverage  0.00350534 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2061  glycosyl transferase family protein  35.18 
 
 		 810 aa  413  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2055  1A family penicillin-binding protein  37.32 
 
 		 839 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.635838  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3229  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  37.32 
 
 		 844 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.258839  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2346  penicillin-binding protein  37.32 
 
 		 844 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1451  penicillin-binding protein  37.32 
 
 		 928 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.49387  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2324  1A family penicillin-binding protein  37.37 
 
 		 787 aa  414  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3113  penicillin-binding protein  37.32 
 
 		 839 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.988566  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2329  glycosyl transferase family protein  37.06 
 
 		 801 aa  415  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.212398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1363  penicillin-binding protein  37.32 
 
 		 844 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4835  peptidoglycan glycosyl transferase  36.89 
 
 		 826 aa  415  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191037  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1080  penicillin-binding protein  37.32 
 
 		 844 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366397  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  37.05 
 
 		 760 aa  411  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3455  peptidoglycan glycosyltransferase  36.3 
 
 		 787 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  36.89 
 
 		 755 aa  411  1e-113  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2013  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.97 
 
 		 834 aa  412  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.155902 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0887  peptidoglycan glycosyltransferase  36.4 
 
 		 841 aa  409  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  35.93 
 
 		 774 aa  405  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  36.49 
 
 		 750 aa  399  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1773  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  35.53 
 
 		 698 aa  385  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.488731  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  30.58 
 
 		 795 aa  328  2.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0354  penicillin-binding protein 1A  30 
 
 		 841 aa  321  3e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.75585  normal  0.103015 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  30.31 
 
 		 777 aa  317  6e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3133  1A family penicillin-binding protein  30.39 
 
 		 796 aa  316  9.999999999999999e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4406  1A family penicillin-binding protein  30.48 
 
 		 818 aa  313  1e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000928316  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4231  penicillin-binding protein 1A  30.95 
 
 		 748 aa  309  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0387  1A family penicillin-binding protein  30.92 
 
 		 797 aa  309  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495893  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0290  1A family penicillin-binding protein  30.85 
 
 		 797 aa  308  3e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308967  normal  0.891054 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0366  1A family penicillin-binding protein  30.92 
 
 		 797 aa  308  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.941804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0306  1A family penicillin-binding protein  30.67 
 
 		 797 aa  306  7e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2720  penicillin-binding protein 1A  30.88 
 
 		 797 aa  306  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0315  1A family penicillin-binding protein  30.67 
 
 		 795 aa  306  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.640379 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0956  hypothetical protein  28.09 
 
 		 794 aa  304  5.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0987  hypothetical protein  28.09 
 
 		 794 aa  304  6.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3734  1A family penicillin-binding protein  30.38 
 
 		 797 aa  303  8.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3603  penicillin-binding protein, 1A family  30 
 
 		 799 aa  303  9e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00689676  hitchhiker  0.000000108854 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2752  1A family penicillin-binding protein  30.38 
 
 		 797 aa  303  1e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3201  1A family penicillin-binding protein  30.38 
 
 		 797 aa  303  1e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3763  1A family penicillin-binding protein  30.38 
 
 		 797 aa  303  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.763292  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3705  1A family penicillin-binding protein  30.38 
 
 		 797 aa  303  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3486  penicillin-binding protein 1A  30.92 
 
 		 796 aa  301  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2802  1A family penicillin-binding protein  30.25 
 
 		 797 aa  301  4e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.437708  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3029  1A family penicillin-binding protein  30.49 
 
 		 797 aa  301  5e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1752  1A family penicillin-binding protein  30.25 
 
 		 770 aa  300  6e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0010  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1A  30.4 
 
 		 797 aa  300  6e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000754529  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1298  1A family penicillin-binding protein  29.06 
 
 		 833 aa  299  1e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.144183  normal  0.788784 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1936  penicillin-binding protein, 1A family  30.46 
 
 		 790 aa  299  2e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  29.29 
 
 		 830 aa  298  3e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3274  penicillin-binding protein 1A  29.79 
 
 		 792 aa  298  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5782  penicillin-binding protein 1A  27.94 
 
 		 823 aa  296  9e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  30.26 
 
 		 827 aa  296  1e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2462  penicillin-binding protein 1A  30.45 
 
 		 791 aa  295  2e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0754  penicillin-binding protein, 1A family  28.11 
 
 		 818 aa  295  3e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000281003  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66670  penicillin-binding protein 1A  27.69 
 
 		 823 aa  293  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2266  1A family penicillin-binding protein  29.23 
 
 		 819 aa  293  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2799  1A family penicillin-binding protein  29.79 
 
 		 796 aa  292  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0729  1A family penicillin-binding protein  29.09 
 
 		 794 aa  291  3e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.239456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0698  penicillin-binding protein, 1A family  29.2 
 
 		 779 aa  291  4e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3195  1A family penicillin-binding protein  29.48 
 
 		 773 aa  291  5.0000000000000004e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45310  Penicillin binding protein 1A  28.68 
 
 		 819 aa  288  4e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>