More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3061 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1822  ISPpu9, transposase  99.69 
 
 
451 aa  674    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  0.756779 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3061  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  682    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.197929  normal  0.542716 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3247  ISPpu9, transposase  99.69 
 
 
451 aa  674    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.155481  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3062  ISPpu9, transposase  99.69 
 
 
451 aa  674    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.231592  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5999  ISPpu9, transposase  99.69 
 
 
451 aa  674    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0408226  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5586  ISPpu9, transposase  99.69 
 
 
451 aa  674    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1941  ISPpu9, transposase  99.69 
 
 
451 aa  674    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.662635  normal  0.93243 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0286  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.79 
 
 
441 aa  158  9e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150235  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5544  transposase IS116/IS110/IS902  34.27 
 
 
440 aa  156  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.362719 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0024  transposase  32.49 
 
 
454 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4136  transposase  27.69 
 
 
446 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.888803 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0095  transposase  27.76 
 
 
333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.856813 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1976  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.97 
 
 
442 aa  139  6e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2570  ISPpu9, transposase  29.38 
 
 
442 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110868  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3381  ISPpu9, transposase  29.38 
 
 
442 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.372355 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3586  ISPpu9, transposase  29.38 
 
 
442 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1133  ISPpu9, transposase  29.38 
 
 
442 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0282142 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1260  ISPpu9, transposase  29.38 
 
 
442 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.469395 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4603  ISPpu9, transposase  29.38 
 
 
442 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.79364 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4791  ISPpu9, transposase  29.38 
 
 
442 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.271992 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3738  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.06 
 
 
453 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3127  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.25 
 
 
406 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0543  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.71 
 
 
402 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6342  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.84 
 
 
408 aa  98.2  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6341  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.84 
 
 
408 aa  98.2  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0725  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.71 
 
 
411 aa  97.8  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1903  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.69 
 
 
406 aa  97.8  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2321  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.04 
 
 
406 aa  95.5  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0197  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.04 
 
 
406 aa  95.5  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2322  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.04 
 
 
406 aa  95.5  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4362  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.08 
 
 
414 aa  86.7  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0000113167  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0589  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.08 
 
 
414 aa  86.7  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3851  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.08 
 
 
414 aa  86.7  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3853  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.08 
 
 
414 aa  86.7  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2709  ISAfe3, transposase  25.25 
 
 
408 aa  85.1  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1265  ISAfe3, transposase  25.25 
 
 
408 aa  85.1  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2432  ISAfe3, transposase  25.25 
 
 
408 aa  85.1  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1049  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.27 
 
 
542 aa  85.5  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0550  ISAfe3, transposase  25.25 
 
 
408 aa  85.1  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.227474  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3263  ISAfe3, transposase  25.25 
 
 
408 aa  85.1  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1110  ISAfe3, transposase  25.25 
 
 
408 aa  85.1  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2972  ISAfe3, transposase  25.25 
 
 
408 aa  85.1  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1142  ISAfe3, transposase  25.25 
 
 
408 aa  85.1  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0989  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.27 
 
 
540 aa  85.5  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7037  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1047  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.27 
 
 
540 aa  85.5  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1048  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.27 
 
 
540 aa  85.5  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2090  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.46 
 
 
378 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000104804  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3130  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.22 
 
 
378 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1287  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.95 
 
 
465 aa  76.3  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.324635  normal  0.577676 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0682  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.95 
 
 
466 aa  75.9  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0858  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.95 
 
 
466 aa  75.9  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.425839 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1282  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.95 
 
 
466 aa  75.9  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00124375  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4398  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.95 
 
 
466 aa  75.9  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2973  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.95 
 
 
466 aa  75.9  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0717724  normal  0.0172565 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4399  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.95 
 
 
466 aa  75.9  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0130  transposase IS116/IS110/IS902  28.07 
 
 
454 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1959  transposase IS116/IS110/IS902  26.35 
 
 
420 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.945198  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1408  transposase  24.73 
 
 
414 aa  74.3  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29398  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0087  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.6 
 
 
466 aa  73.6  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2232  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.6 
 
 
466 aa  73.6  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000585875  normal  0.443218 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2042  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.6 
 
 
466 aa  73.6  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.198929  normal  0.0124292 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3050  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.86 
 
 
407 aa  72.8  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.152535 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3147  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.86 
 
 
407 aa  72.8  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.166757  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2919  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.86 
 
 
407 aa  72.8  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000420337  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1178  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.86 
 
 
407 aa  72.8  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684459  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3328  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.86 
 
 
407 aa  72.8  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510687  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5410  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.86 
 
 
407 aa  72.8  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.198877 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1960  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.04 
 
 
411 aa  72.8  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.261169  normal  0.0163724 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0134  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.21 
 
 
435 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1407  transposase  25.09 
 
 
414 aa  70.9  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.31889  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1024  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.91 
 
 
412 aa  70.5  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2125  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.91 
 
 
412 aa  70.5  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2235  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.91 
 
 
444 aa  70.9  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2366  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.91 
 
 
412 aa  70.5  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.587886  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12452  transposase  23.94 
 
 
333 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.267636 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2124  transposase IS116/IS110/IS902  24.77 
 
 
412 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.29674  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3436  transposase IS116/IS110/IS902  24.61 
 
 
412 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1319  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.03 
 
 
423 aa  66.6  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.622627  normal  0.467675 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0957  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.03 
 
 
423 aa  66.6  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251834  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2362  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.03 
 
 
423 aa  66.6  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00127954  hitchhiker  0.00882366 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5136  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.03 
 
 
423 aa  66.6  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5208  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.03 
 
 
423 aa  66.6  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14300  transposase IS116/IS110/IS902  24.71 
 
 
392 aa  65.1  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3437  transposase IS116/IS110/IS902  24.3 
 
 
412 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.222755  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4122  transposase IS116/IS110/IS902  24.3 
 
 
412 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3494  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.03 
 
 
442 aa  62.8  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  0.207887 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4092  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.88 
 
 
343 aa  62  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.293783 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1223  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  24.39 
 
 
310 aa  60.8  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4035  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.71 
 
 
342 aa  60.5  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.327975  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4650  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.95 
 
 
342 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4399  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.95 
 
 
342 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2350  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.95 
 
 
342 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.467502  normal  0.925611 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4334  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.95 
 
 
342 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2696  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.95 
 
 
342 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000117153  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3759  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.71 
 
 
342 aa  60.5  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.076485  normal  0.271017 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3506  hypothetical protein  32.52 
 
 
350 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.194292  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1525  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.16 
 
 
342 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.554146  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0474  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.52 
 
 
350 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0599215 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3223  transposase  25.7 
 
 
248 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0327091  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1953  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.58 
 
 
378 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>