More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3007 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3007  Patatin  100 
 
 		 331 aa  684    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5074  Patatin  53.4 
 
 		 332 aa  356  2.9999999999999997e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8092  Patatin  27.54 
 
 		 382 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.78 
 
 		 763 aa  89.4  8e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.93746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1354  patatin  26.41 
 
 		 386 aa  89  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408821  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8389  Patatin  29.77 
 
 		 399 aa  89  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4609  patatin  27.57 
 
 		 379 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.995151 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4143  patatin  27.57 
 
 		 379 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6204  Patatin  29.74 
 
 		 378 aa  86.3  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.80155 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  29.19 
 
 		 378 aa  85.1  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3896  patatin  25.77 
 
 		 379 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0966  patatin  24.26 
 
 		 379 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612585  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2023  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  27.44 
 
 		 757 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3204  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  27.44 
 
 		 757 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1333  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  27.44 
 
 		 757 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1046  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  27.44 
 
 		 757 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3076  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  27.44 
 
 		 757 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2313  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  27.44 
 
 		 757 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1418  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  27.44 
 
 		 757 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.767382  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2310  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  27.24 
 
 		 757 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0721  patatin  29.91 
 
 		 384 aa  79  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2756  patatin  25.46 
 
 		 377 aa  79  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  27.57 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4913  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.31 
 
 		 765 aa  77  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1856  patatin  25.98 
 
 		 400 aa  76.6  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  28.57 
 
 		 387 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5766  Patatin-like phospholipase domain-containing protein  29.74 
 
 		 378 aa  75.1  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3155  hypothetical protein  23.6 
 
 		 374 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0014  hypothetical protein  24.75 
 
 		 371 aa  74.7  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0014  hypothetical protein  24.75 
 
 		 371 aa  74.7  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0858  Patatin  24.8 
 
 		 399 aa  75.1  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  24.92 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2824  Patatin  28.27 
 
 		 357 aa  73.9  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.701199  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5937  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.88 
 
 		 777 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2547  patatin  23.53 
 
 		 375 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2085  patatin  27.46 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1500  Patatin  22.98 
 
 		 374 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000109081  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  25.88 
 
 		 410 aa  70.5  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2859  patatin  22.98 
 
 		 374 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0937  patatin  28.57 
 
 		 385 aa  70.5  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2876  patatin  22.98 
 
 		 374 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000103139  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3005  patatin  22.98 
 
 		 383 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000873649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1397  patatin  22.98 
 
 		 374 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0173142  normal  0.188155 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1344  patatin  22.98 
 
 		 374 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0073  Patatin  26.18 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1409  patatin  22.98 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  24.01 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0065  Patatin  27.53 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0196  patatin  26.01 
 
 		 429 aa  69.3  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2519  patatin  22.67 
 
 		 374 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.256378  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0853  patatin  27.09 
 
 		 382 aa  69.3  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000107118  unclonable  0.000000108981 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0900  phospholipase, patatin family  25.33 
 
 		 284 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22400  Patatin  27.8 
 
 		 343 aa  68.9  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2781  Patatin  29.36 
 
 		 306 aa  68.9  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.874776  normal  0.443511 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4797  patatin  26.51 
 
 		 389 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0803  phospholipase, patatin family  25.33 
 
 		 284 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.240564  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1394  Patatin  26.58 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5313  patatin  27.83 
 
 		 405 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  23.93 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0709  phospholipase  25 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.626659  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0653  phospholipase  25 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000540236  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0652  phospholipase  25 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0951235  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0660  patatin  25 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0745  phospholipase  25 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0574828  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4528  phospholipase, patatin family  24.67 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.430948  normal  0.279256 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0821  phospholipase, patatin family  25 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5960900000000002e-53 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0815  phospholipase, putative  25 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0555533  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2219  Patatin  24.41 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3155  transpatatin- like phospholipase domain-containing protein  25.32 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.382595 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4688  Patatin  28.57 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4527  patatin  26.96 
 
 		 405 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0502566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5712  patatin  26.96 
 
 		 405 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25761  normal  0.0781089 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  27.59 
 
 		 323 aa  67  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1160  hypothetical protein  22.88 
 
 		 374 aa  67  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5147  patatin  26.96 
 
 		 405 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.569515  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1392  patatin  24.05 
 
 		 379 aa  67  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3168  patatin  25.83 
 
 		 405 aa  67  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5327  patatin  26.11 
 
 		 418 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286703 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4147  Patatin  25 
 
 		 387 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4269  Patatin  23.51 
 
 		 420 aa  65.9  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.59934  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4379  Patatin  23.51 
 
 		 420 aa  65.9  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.227942 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1960  patatin  26.46 
 
 		 417 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.508656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1094  Patatin  29.36 
 
 		 381 aa  65.1  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.982413  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1407  patatin  27.76 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2865  patatin  22.22 
 
 		 374 aa  65.5  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.906951  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4579  patatin  24.9 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0151  patatin  23.51 
 
 		 442 aa  65.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2853  hypothetical protein  29.02 
 
 		 370 aa  65.1  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2410  Patatin  26.13 
 
 		 423 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648582  normal  0.741283 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0496  patatin  25.26 
 
 		 382 aa  64.3  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20180  hypothetical protein  27.35 
 
 		 376 aa  64.3  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.88981  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3124  patatin  26.96 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4052  patatin  24.8 
 
 		 375 aa  64.3  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4981  patatin  26.96 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0159  Patatin  25 
 
 		 358 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  24.32 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  27.57 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2722  hypothetical protein  28.57 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4614  patatin  26.29 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.758512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4153  Patatin  29.15 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0279461  normal  0.153113 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>