More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2980 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2318  histidine kinase  33.51 
 
 		 1298 aa  674    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1754  histidine kinase  36.73 
 
 		 1344 aa  643    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.176495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2980  histidine kinase  100 
 
 		 1311 aa  2715    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229379  normal  0.450681 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  36.31 
 
 		 1343 aa  728    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  30.54 
 
 		 1370 aa  542  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  28.94 
 
 		 1355 aa  535  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  29.43 
 
 		 1347 aa  528  1e-148  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  34.02 
 
 		 1378 aa  504  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  29.1 
 
 		 1374 aa  506  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  28.95 
 
 		 1355 aa  501  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  33.52 
 
 		 1373 aa  503  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1489  histidine kinase  29.24 
 
 		 1404 aa  499  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639294  normal  0.537564 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  27.99 
 
 		 1397 aa  490  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  26.72 
 
 		 1374 aa  486  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  27.45 
 
 		 1342 aa  482  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  29.19 
 
 		 1378 aa  481  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6047  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  46.68 
 
 		 677 aa  477  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  31.46 
 
 		 1384 aa  479  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4604  histidine kinase  48.35 
 
 		 663 aa  469  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  27.94 
 
 		 1363 aa  467  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2019  histidine kinase  27.17 
 
 		 1316 aa  464  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523526  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  32.13 
 
 		 1306 aa  463  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  34.26 
 
 		 1418 aa  462  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  27.48 
 
 		 1313 aa  457  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  27.68 
 
 		 1388 aa  454  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  31.42 
 
 		 1366 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  28.06 
 
 		 1335 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  27.2 
 
 		 1340 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  31.68 
 
 		 1400 aa  441  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  31 
 
 		 1334 aa  436  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0559  histidine kinase  25.7 
 
 		 1327 aa  431  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00477073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1905  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  47.95 
 
 		 668 aa  426  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0295515  normal  0.210974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  27.51 
 
 		 1349 aa  420  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  29.27 
 
 		 1373 aa  412  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  33 
 
 		 1324 aa  399  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  29.34 
 
 		 1526 aa  395  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2723  histidine kinase  26.76 
 
 		 1347 aa  388  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  34.84 
 
 		 1366 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  31.31 
 
 		 1278 aa  382  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  29.59 
 
 		 1344 aa  382  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1699  ATP-binding region, ATPase-like protein  27.25 
 
 		 1396 aa  369  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170141  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  25.65 
 
 		 1374 aa  353  2e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  26.05 
 
 		 1407 aa  341  5e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0220  two component transcriptional regulator, AraC family  35.66 
 
 		 934 aa  335  3e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497584  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  27.24 
 
 		 1414 aa  330  2.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1470  histidine kinase  27.31 
 
 		 1376 aa  325  3e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0500626  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3199  two component transcriptional regulator, AraC family  34.7 
 
 		 940 aa  305  3.0000000000000004e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157032  normal  0.236848 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 1341 aa  305  4.0000000000000003e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1764  sensor histidine kinase/response regulator  25.63 
 
 		 1093 aa  302  3e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.412354  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0921  histidine kinase  32.94 
 
 		 1105 aa  300  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615746 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1493  sensor histidine kinase/response regulator  25.21 
 
 		 1086 aa  295  3e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0890895  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.72 
 
 		 1431 aa  295  4e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.03 
 
 		 1426 aa  291  6e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2687  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.64 
 
 		 1013 aa  287  9e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  36.01 
 
 		 1427 aa  286  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 1385 aa  285  5.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.38 
 
 		 1415 aa  284  9e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 		 1361 aa  284  9e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 		 1131 aa  283  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0756  sensory box sensor histidine kinase/DNA-binding response regulator  32.84 
 
 		 993 aa  281  4e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 		 1711 aa  280  1e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.83 
 
 		 1390 aa  279  3e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.83 
 
 		 1390 aa  279  3e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.83 
 
 		 1390 aa  279  3e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0148  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 		 1048 aa  278  5e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  38.25 
 
 		 1152 aa  276  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1604  two component transcriptional regulator, AraC family  34.08 
 
 		 904 aa  277  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 		 1140 aa  277  1.0000000000000001e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.15 
 
 		 1118 aa  274  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000390432  normal  0.0407868 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  37.92 
 
 		 1299 aa  272  4e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_105  histidine kinase CheY-like domain protein  26.55 
 
 		 1070 aa  270  2e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 		 1002 aa  269  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.76 
 
 		 1153 aa  268  5.999999999999999e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359014  hitchhiker  0.0000017622 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4814  histidine kinase  36.45 
 
 		 919 aa  266  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00150972  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  37.22 
 
 		 1156 aa  266  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1562  histidine kinase  26.08 
 
 		 1296 aa  266  2e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.655639  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3745  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 		 1010 aa  265  4.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.412805  hitchhiker  0.00597184 
 
 
-
 
NC_002950  PG1797  DNA-binding response regulator/sensor histidine kinase  32.05 
 
 		 961 aa  264  6.999999999999999e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4411  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.5 
 
 		 1514 aa  263  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0203527 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.83 
 
 		 1406 aa  263  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  36.81 
 
 		 1202 aa  262  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4608  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 		 1645 aa  261  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.284957  normal  0.407853 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4349  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.5 
 
 		 1514 aa  261  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0275  histidine kinase  25.57 
 
 		 1070 aa  261  6e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.49 
 
 		 1631 aa  260  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  38.46 
 
 		 876 aa  259  2e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.59 
 
 		 1559 aa  260  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 		 1370 aa  258  4e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  34 
 
 		 1651 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.86 
 
 		 1383 aa  256  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.84 
 
 		 1287 aa  254  8.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.64 
 
 		 1051 aa  254  9.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 		 1383 aa  253  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 		 1003 aa  251  5e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3543  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.4 
 
 		 1498 aa  251  8e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.476146  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  36.61 
 
 		 1180 aa  249  3e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  24.41 
 
 		 1346 aa  248  4e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  34 
 
 		 1646 aa  244  7e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.42 
 
 		 1248 aa  242  2.9999999999999997e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  35.84 
 
 		 1172 aa  240  1e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>