171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2956 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2956  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 358 aa  729    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.199366  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4679  permease YjgP/YjgQ family protein  63.31 
 
 		 360 aa  480  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1198  permease  46.94 
 
 		 359 aa  355  6.999999999999999e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00112188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0027  permease YjgP/YjgQ family protein  45.81 
 
 		 357 aa  321  9.999999999999999e-87  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  41.13 
 
 		 360 aa  299  4e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1429  permease YjgP/YjgQ family protein  36.67 
 
 		 367 aa  265  8e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.398459  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6917  permease YjgP/YjgQ family protein  35.73 
 
 		 359 aa  245  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186439  normal  0.723746 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0044  permease YjgP/YjgQ family protein  33.43 
 
 		 362 aa  226  6e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.484166  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1984  permease YjgP/YjgQ family protein  36.83 
 
 		 358 aa  216  7e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00860  hypothetical protein  34.45 
 
 		 359 aa  204  1e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  29.01 
 
 		 361 aa  169  5e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  29.36 
 
 		 359 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  26.36 
 
 		 360 aa  150  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  27.57 
 
 		 359 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  26.23 
 
 		 387 aa  144  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  27.37 
 
 		 360 aa  139  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  26.37 
 
 		 360 aa  137  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  27.91 
 
 		 358 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0106  permease YjgP/YjgQ family protein  23.88 
 
 		 356 aa  95.9  8e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  22.68 
 
 		 358 aa  95.5  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  24.52 
 
 		 360 aa  94.7  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  24.73 
 
 		 1061 aa  94  4e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0112  permease YjgP/YjgQ family protein  24.07 
 
 		 370 aa  93.6  5e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.378963  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  23.42 
 
 		 360 aa  93.2  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  23.73 
 
 		 395 aa  93.2  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1510  permease YjgP/YjgQ family protein  23.73 
 
 		 396 aa  93.2  6e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161428 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  23.8 
 
 		 395 aa  93.2  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  23.84 
 
 		 359 aa  92.8  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  24.86 
 
 		 1061 aa  92.4  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  23.14 
 
 		 360 aa  91.3  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  23.56 
 
 		 391 aa  89.7  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  24.36 
 
 		 792 aa  89  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  22.91 
 
 		 356 aa  87.4  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  20.85 
 
 		 356 aa  85.1  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  22.65 
 
 		 1111 aa  84.7  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  23.33 
 
 		 1096 aa  82.8  0.000000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  20.83 
 
 		 359 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  20.87 
 
 		 371 aa  82.4  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  20.94 
 
 		 359 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  21.28 
 
 		 434 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  21.05 
 
 		 391 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  22.87 
 
 		 374 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  25.89 
 
 		 391 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  23.62 
 
 		 388 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  23.62 
 
 		 389 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  21.63 
 
 		 359 aa  74.3  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  22.25 
 
 		 364 aa  73.9  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  22.68 
 
 		 389 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  19.27 
 
 		 392 aa  72.4  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  22.75 
 
 		 1040 aa  72  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1044  hypothetical protein  20.22 
 
 		 357 aa  70.1  0.00000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000929765  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1542  hypothetical protein  22.55 
 
 		 362 aa  69.3  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  22.74 
 
 		 384 aa  68.6  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  19.35 
 
 		 365 aa  68.2  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2733  permease YjgP/YjgQ family protein  22.34 
 
 		 360 aa  65.5  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.193527  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  24.18 
 
 		 418 aa  65.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1462  permease YjgP/YjgQ family protein  32.03 
 
 		 495 aa  64.7  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  23.62 
 
 		 364 aa  64.7  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  22.61 
 
 		 382 aa  63.5  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  23.86 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  20.5 
 
 		 1153 aa  62.8  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  21.11 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0764  permease YjgP/YjgQ family protein  22.7 
 
 		 360 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27721 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  21.11 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2199  YjgP/YjgQ family protein  22.56 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1788  permease  28.05 
 
 		 483 aa  61.2  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  22.48 
 
 		 401 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1855  permease YjgP/YjgQ family protein  22.56 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  22.04 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  23.36 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  22.69 
 
 		 362 aa  60.1  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0679  permease YjgP/YjgQ family protein  25.81 
 
 		 350 aa  59.7  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  22.77 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  20.26 
 
 		 394 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  22.12 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0048  permease YjgP/YjgQ  23.69 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2837  permease YjgP/YjgQ family protein  22.95 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.240939  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0318  permease YjgP/YjgQ family protein  20.44 
 
 		 363 aa  56.6  0.0000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.341931 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1121  permease YjgP/YjgQ family protein  22.55 
 
 		 376 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.182226 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16801  putative permease  21.61 
 
 		 403 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.636863 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1949  permease, putative  19.63 
 
 		 359 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000528059  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0678  hypothetical protein  21.11 
 
 		 362 aa  54.7  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0912  permease YjgP/YjgQ family protein  20.72 
 
 		 352 aa  54.7  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1211  permease YjgP/YjgQ family protein  20.71 
 
 		 362 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000556533 
 
 
-
 
NC_004310  BR0686  hypothetical protein  21.11 
 
 		 362 aa  53.5  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  20.55 
 
 		 359 aa  53.9  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  21.61 
 
 		 401 aa  53.9  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0876  hypothetical membrane spanning protein  18.54 
 
 		 355 aa  53.5  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2900  permease  22.31 
 
 		 376 aa  53.5  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.675827  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1247  permease  21.02 
 
 		 386 aa  53.5  0.000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0496  permease YjgP/YjgQ  22.92 
 
 		 414 aa  53.1  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  23.32 
 
 		 395 aa  53.1  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1544  permease YjgP/YjgQ family protein  21.99 
 
 		 376 aa  53.1  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  23.12 
 
 		 395 aa  52.8  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0201  permease-like  24.05 
 
 		 353 aa  53.1  0.000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1678  permease YjgP/YjgQ  20.88 
 
 		 365 aa  52.8  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.626554 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5099  permease YjgP/YjgQ family protein  21.37 
 
 		 362 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.624296  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2464  permease YjgP/YjgQ  22.13 
 
 		 360 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0984614  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1067  permease YjgP/YjgQ family protein  20.16 
 
 		 362 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183228 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1141  putative permease  18.36 
 
 		 355 aa  52.4  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>