More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2938 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2938  modification methylase, HemK family  100 
 
 
282 aa  583  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.557385  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4319  modification methylase, HemK family  57.34 
 
 
286 aa  341  9e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173015  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09408  putative protoporphyrinogen oxidase  41.54 
 
 
282 aa  218  1e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.506099  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0020  HemK family modification methylase  42.18 
 
 
285 aa  217  2e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1783  modification methylase, HemK family  41.13 
 
 
281 aa  216  2.9999999999999998e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5054  HemK family modification methylase  41.33 
 
 
284 aa  209  5e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.244317  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2176  modification methylase, HemK family  41.2 
 
 
288 aa  201  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697869  normal  0.919129 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0202  protoporphyrinogen oxidase  40 
 
 
287 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2220  modification methylase, HemK family  40.38 
 
 
286 aa  196  5.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.018393 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0614  methylase of polypeptide chain release factor  43.84 
 
 
271 aa  178  1e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0156  HemK family modification methylase  37.72 
 
 
293 aa  163  3e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1783  methylase of polypeptide chain release factor  36.9 
 
 
330 aa  151  2e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  36.68 
 
 
284 aa  145  9e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  32.98 
 
 
304 aa  145  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0794  protoporphyrinogen oxidase  37.67 
 
 
277 aa  143  3e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1724  HemK family modification methylase  34.57 
 
 
278 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0688898  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1076  HemK family modification methylase  38.46 
 
 
276 aa  140  3e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.260993  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.19 
 
 
286 aa  140  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1581  methylase of polypeptide chain release factor  39.06 
 
 
275 aa  139  3.9999999999999997e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  37.61 
 
 
280 aa  137  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  36.3 
 
 
288 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  36.8 
 
 
302 aa  135  5e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  36.14 
 
 
301 aa  135  5e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0616  modification methylase, HemK family  34.84 
 
 
359 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1694  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.96 
 
 
296 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.886603  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1490  modification methylase HemK  36.4 
 
 
296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2448  modification methylase, HemK family  30.04 
 
 
361 aa  133  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1070  modification methylase, HemK family  32.58 
 
 
288 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.31401  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  35.47 
 
 
285 aa  132  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0851  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.31 
 
 
297 aa  132  6e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0252199  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  34.85 
 
 
284 aa  132  9e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2722  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.58 
 
 
283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2396  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  33.33 
 
 
282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000357803  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0435  modification methylase HemK  34.46 
 
 
286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  37.22 
 
 
262 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.25 
 
 
299 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355762  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  33.46 
 
 
284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  30.86 
 
 
279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000613381  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2998  HemK family modification methylase  31.01 
 
 
288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.29427  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1732  putative protein methyltransferase  35.77 
 
 
274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409026  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0147  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.84 
 
 
280 aa  127  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.131703  normal  0.172297 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2779  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.1 
 
 
313 aa  126  5e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.159929  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1585  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.71 
 
 
297 aa  125  9e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123528  normal  0.907026 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  38.57 
 
 
285 aa  125  9e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3321  modification methylase, HemK family  33.96 
 
 
288 aa  125  9e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000192098  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  35.51 
 
 
285 aa  125  9e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  34.25 
 
 
270 aa  125  9e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.08 
 
 
286 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.044842  normal  0.135184 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  33.59 
 
 
289 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3434  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.25 
 
 
293 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004202  Polypeptide chain release factor methylase  32.38 
 
 
284 aa  124  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2596  HemK family modification methylase  32.31 
 
 
280 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944902  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0509  HemK family modification methylase  32.31 
 
 
280 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3551  HemK family modification methylase  33.91 
 
 
285 aa  122  6e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2889  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.46 
 
 
280 aa  122  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.479944 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0481  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.31 
 
 
280 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.589534 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  33.21 
 
 
279 aa  122  8e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  40.38 
 
 
284 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  36.47 
 
 
285 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  36.4 
 
 
289 aa  120  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  32.71 
 
 
278 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1651  HemK family modification methylase  31.66 
 
 
280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.790861  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1259  modification methylase, HemK family  29.23 
 
 
285 aa  119  4.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0145638 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1425  modification methylase HemK  31.46 
 
 
297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0413  HemK family modification methylase  33.59 
 
 
280 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2191  HemK family modification methylase  33.83 
 
 
278 aa  119  7.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.961515  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2790  modification methylase, HemK family  33.1 
 
 
280 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2153  HemK family modification methylase  33.83 
 
 
278 aa  119  7.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.200302  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.7 
 
 
285 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2931  hemK protein  31.58 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1425  modification methylase, HemK family  35.71 
 
 
289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949307  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  32.95 
 
 
275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3849  HemK family modification methylase  30.5 
 
 
283 aa  116  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000350241  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0453  HemK family modification methylase  31.88 
 
 
288 aa  115  6e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1206  modification methylase, HemK family  29.6 
 
 
303 aa  115  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3930  modification methylase, HemK family  29.82 
 
 
286 aa  115  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4851  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0439  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.21 
 
 
280 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.490288 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2177  HemK family modification methylase  28.85 
 
 
587 aa  115  6e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000299232  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0942  HemK family modification methylase  34.29 
 
 
278 aa  115  7.999999999999999e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.452604 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  32.85 
 
 
274 aa  115  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2467  HemK family methyltransferase  28.85 
 
 
587 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.222509  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0293  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.23 
 
 
290 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1807  HemK family modification methylase  31.09 
 
 
276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.371396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2476  HemK family modification methylase  34.65 
 
 
284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  34.6 
 
 
295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1673  HemK family modification methylase  33.92 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0452249  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2903  methyltransferase protein  33.21 
 
 
306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.907973  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2800  modification methylase, HemK family  32.61 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.668211 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  33.21 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3596  modification methylase HemK  31.8 
 
 
280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.900559 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  32.31 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1755  hemK protein  34.86 
 
 
286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114264  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0166  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  26.83 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01251  hypothetical protein  31.27 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0325  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.84 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.109217 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0690  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.33 
 
 
285 aa  113  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2113  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.91 
 
 
281 aa  114  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.197793  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3505  HemK family modification methylase  31.52 
 
 
289 aa  113  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216122  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5028  HemK family modification methylase  34.72 
 
 
283 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.497663  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1807  modification methylase, HemK family  36.61 
 
 
255 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.314516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>