More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2934 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 987 aa  2010    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  35.2 
 
 		 924 aa  483  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  33.47 
 
 		 874 aa  473  1e-132  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0349  TonB-dependent receptor  33.97 
 
 		 850 aa  459  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1490  TonB-dependent receptor, plug  32.29 
 
 		 948 aa  437  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  32.58 
 
 		 933 aa  426  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  30.93 
 
 		 918 aa  422  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3441  TonB-dependent receptor  33.11 
 
 		 843 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00117935  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2586  TonB-dependent receptor plug  32.55 
 
 		 924 aa  400  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427488  normal  0.0373084 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  31.02 
 
 		 947 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01941  TonB-dependent outer membrane receptor  33.26 
 
 		 784 aa  365  2e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2509  TonB-dependent receptor  31.54 
 
 		 803 aa  363  7.0000000000000005e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02222  putative TonB-dependent receptor  31.56 
 
 		 853 aa  361  4e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2718  TonB-dependent receptor  31.24 
 
 		 803 aa  356  1e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000743296 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01939  TonB-dependent outer membrane receptor  31.19 
 
 		 795 aa  354  4e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2484  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.88 
 
 		 800 aa  352  2e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104897  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0517  TonB-dependent receptor  31.45 
 
 		 817 aa  352  2e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.069894  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0415  TonB-dependent receptor  30.79 
 
 		 812 aa  349  1e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0145049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3540  TonB-dependent receptor  30.67 
 
 		 812 aa  348  3e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000560682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3139  TonB-dependent receptor  30.86 
 
 		 795 aa  347  8.999999999999999e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0252363  normal  0.788798 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0442  TonB-dependent receptor  31 
 
 		 797 aa  345  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126161  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3715  TonB-dependent receptor  30.67 
 
 		 812 aa  345  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000223353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3884  TonB-dependent receptor  31.57 
 
 		 797 aa  345  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000140414  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1708  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 817 aa  344  5e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0430  TonB-dependent receptor  30.88 
 
 		 797 aa  344  5e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000261093  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1344  ferric enterobactin receptor  29.75 
 
 		 788 aa  343  1e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  unclonable  0.00000000120084  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1279  TonB-dependent receptor  29.86 
 
 		 788 aa  342  2e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.0000000456142  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0456  TonB-dependent receptor  30.66 
 
 		 797 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000941597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01938  TonB-dependent outer membrane Receptor  31.27 
 
 		 799 aa  340  9e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2892  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  30.9 
 
 		 815 aa  339  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0932  TonB-dependent receptor, plug  30.22 
 
 		 840 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2290  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  31.86 
 
 		 800 aa  337  5e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000569019 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3011  TonB-dependent sideophore receptor, putative  30.92 
 
 		 821 aa  333  1e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659574  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3152  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 811 aa  332  2e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2657  TonB-dependent receptor plug  31.47 
 
 		 811 aa  331  3e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0512157  normal  0.824086 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2507  TonB-dependent receptor  31.19 
 
 		 842 aa  325  3e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1723  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 868 aa  323  9.999999999999999e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00128023  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1342  ferric enterobactin receptor  29.84 
 
 		 793 aa  321  3.9999999999999996e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127602  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04865  TonB-dependent outer membrane Receptor  30.28 
 
 		 811 aa  316  9.999999999999999e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2342  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 795 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 883 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0935  TonB-dependent receptor, plug  27.84 
 
 		 961 aa  304  7.000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2607  TonB-dependent siderophore receptor, putative  28.47 
 
 		 832 aa  303  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0816697  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2621  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 871 aa  302  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0702  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 948 aa  300  8e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.861146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3349  TonB-dependent receptor  30.06 
 
 		 815 aa  298  3e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7322  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 804 aa  296  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3801  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 800 aa  295  3e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01460  TonB-dependent receptor, putative  28.16 
 
 		 864 aa  295  4e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2818  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 853 aa  291  5.0000000000000004e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141379  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3580  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 		 835 aa  290  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0399  putative TonB-dependent siderophore receptor  29.17 
 
 		 818 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0393  putative TonB-dependent siderophore receptor  28.47 
 
 		 847 aa  288  5e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3081  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 857 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2931  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 870 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000063349  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1412  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 847 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2289  outer membrane protein  28.7 
 
 		 870 aa  283  1e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000176254  unclonable  0.000000033388 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30590  putative outer membrane receptor protein  26.23 
 
 		 884 aa  282  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.507511 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2031  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 849 aa  278  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  33 
 
 		 887 aa  278  4e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0959  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 858 aa  275  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0915  TonB-dependent receptor plug  27.38 
 
 		 842 aa  275  4.0000000000000004e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1028  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 861 aa  273  1e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.518933  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3218  putative TonB-dependent receptor for Fe  28.07 
 
 		 848 aa  273  2e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2592  TonB-dependent receptor plug  27.97 
 
 		 885 aa  270  8.999999999999999e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3096  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 851 aa  268  4e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1693  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 858 aa  268  5e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21630  TonB-dependent siderophore receptor  27.06 
 
 		 833 aa  267  7e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176382  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2896  putative TonB-dependent outer membrane receptor  27.69 
 
 		 867 aa  264  6e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000792676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1378  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 872 aa  260  7e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.571563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2417  TonB-dependent receptor, plug  27.97 
 
 		 823 aa  252  2e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02745  putative TonB-dependent outer membrane receptor  27.18 
 
 		 1015 aa  249  2e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02748  putative TonB-dependent outer membrane receptor  25.47 
 
 		 856 aa  243  1e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1934  TonB-dependent receptor plug  25.42 
 
 		 813 aa  236  1.0000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1061  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 867 aa  232  3e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3331  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 867 aa  230  9e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2276  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 		 873 aa  226  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1277  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 793 aa  204  6e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0868326  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2160  TonB-dependent receptor, plug  33.11 
 
 		 797 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00475664  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2260  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 852 aa  184  8.000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2318  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 879 aa  184  9.000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.488825 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2180  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 869 aa  172  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1586  TonB-dependent receptor plug  26.44 
 
 		 816 aa  169  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3992  TonB-dependent receptor plug  25.96 
 
 		 877 aa  144  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal  0.249271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  34.09 
 
 		 1082 aa  107  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  33.06 
 
 		 1064 aa  107  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2291  TonB-dependent receptor  23.03 
 
 		 922 aa  106  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.152669  normal  0.0285161 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1939  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 854 aa  106  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.246541 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  35.78 
 
 		 935 aa  106  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  35.78 
 
 		 935 aa  106  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  35.78 
 
 		 935 aa  106  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  29.35 
 
 		 1077 aa  104  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1769  TonB-dependent receptor plug  30.71 
 
 		 1085 aa  104  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  41.95 
 
 		 871 aa  104  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  42.78 
 
 		 861 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  37.38 
 
 		 930 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  37.38 
 
 		 930 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  35.51 
 
 		 933 aa  103  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  42.78 
 
 		 861 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  43.68 
 
 		 861 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>