158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2834 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2834  OsmC family protein  100 
 
 
138 aa  284  2.9999999999999996e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5001  OsmC family protein  60.43 
 
 
142 aa  165  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000117697  normal  0.483711 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3731  OsmC family protein  46.38 
 
 
139 aa  141  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.159888 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2638  hypothetical protein  46.72 
 
 
137 aa  134  4e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2047  OsmC family protein  48.87 
 
 
138 aa  130  7.999999999999999e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00638742  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1495  OsmC family protein  45.45 
 
 
141 aa  128  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0275  OsmC-like protein  42.86 
 
 
138 aa  124  3e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000021415  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0674  OsmC family protein  44.93 
 
 
137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.951893  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2578  OsmC family protein  44.53 
 
 
142 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0342  OsmC-like protein  46.67 
 
 
138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18197  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0756  hypothetical protein  42.22 
 
 
140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.182119 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3551  OsmC family protein  45.24 
 
 
140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0648  OsmC-like protein  47.37 
 
 
142 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000386556  normal  0.0907025 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1593  OsmC family protein  45.97 
 
 
141 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3763  OsmC-like protein  42.97 
 
 
140 aa  106  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.759493  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2356  OsmC family protein  44 
 
 
142 aa  105  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1232  OsmC/Ohr family protein  42.97 
 
 
154 aa  105  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000831828  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0194  OsmC-like protein  42.97 
 
 
140 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0197552  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0677  OsmC family protein  42.97 
 
 
140 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000026959  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1272  OsmC family protein  38.64 
 
 
136 aa  105  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.923187  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0644  OsmC family protein  42.97 
 
 
140 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000216559  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0914  OsmC-like protein  42.22 
 
 
139 aa  105  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0451  OsmC/Ohr family protein  40.3 
 
 
138 aa  104  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00446662  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0380  OsmC-like protein  42.98 
 
 
154 aa  104  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0303481  normal  0.204016 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0571  OsmC family protein  42.97 
 
 
140 aa  104  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000750944  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3355  OsmC family protein  43.75 
 
 
140 aa  104  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000566205  hitchhiker  0.00000500952 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0597  OsmC family protein  42.97 
 
 
140 aa  104  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000609045  normal  0.589115 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2706  OsmC family protein  42.97 
 
 
140 aa  104  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.935729 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0605  putative OsmC-like protein  43.75 
 
 
140 aa  103  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000773894  normal  0.148493 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2796  OsmC/Ohr family protein  37.98 
 
 
149 aa  103  9e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.122145  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0425  OsmC family protein  43.31 
 
 
140 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.864591 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1750  OsmC/Ohr family protein  42.97 
 
 
138 aa  102  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.597502  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3422  OsmC/Ohr family protein  42.97 
 
 
154 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042421  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0336  OsmC/Ohr family protein  42.97 
 
 
154 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.636644  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1197  OsmC/Ohr family protein  42.97 
 
 
154 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3415  OsmC/Ohr family protein  42.97 
 
 
154 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00702998  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1887  OsmC family protein  41.86 
 
 
140 aa  102  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000280458  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0458  OsmC family protein  43.31 
 
 
140 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0656635 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0455  OsmC family protein  43.31 
 
 
140 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.386718 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4778  OsmC family protein  43.31 
 
 
140 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.332624 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2420  OsmC/Ohr family protein  42.97 
 
 
140 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.473875  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2245  OsmC family protein  41.94 
 
 
136 aa  101  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.362297  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2607  OsmC/Ohr family protein  42.97 
 
 
133 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3241  OsmC/Ohr family protein  44.09 
 
 
141 aa  101  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.105127  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2842  OsmC family protein  44.09 
 
 
141 aa  101  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000324994  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1434  OsmC family protein  41.48 
 
 
138 aa  101  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3380  OsmC/Ohr family protein  42.97 
 
 
154 aa  100  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000435507  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0466  OsmC-like protein  40.77 
 
 
140 aa  100  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000604896  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1486  OsmC-like protein  38.41 
 
 
147 aa  100  9e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000320434  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0489  hypothetical protein  42.64 
 
 
148 aa  99.4  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00109519  normal  0.175356 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0953  OsmC-like protein  42.74 
 
 
139 aa  99.4  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2565  OsmC family protein  42.19 
 
 
140 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000000928304  normal  0.589052 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0365  OsmC family protein  42.64 
 
 
148 aa  99.8  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000167168  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0380  OsmC family protein  42.64 
 
 
148 aa  99.8  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00128775  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0408  OsmC-like protein  42.75 
 
 
140 aa  99  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000203576  normal  0.066657 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3942  OsmC family protein  42.86 
 
 
140 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08380  hypothetical protein  43.31 
 
 
140 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000457395 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0794  hypothetical protein  43.31 
 
 
140 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1013  OsmC family protein  41.59 
 
 
151 aa  97.8  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1564  OsmC family protein  35.11 
 
 
146 aa  97.8  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3860  OsmC family protein  43.55 
 
 
143 aa  97.8  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0525  OsmC family protein  41.04 
 
 
140 aa  96.7  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.477245 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0744  OsmC-like protein  42.96 
 
 
152 aa  96.7  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.747718 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2780  OsmC family protein  37.5 
 
 
138 aa  96.3  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000971962  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2326  OsmC family protein  40.58 
 
 
148 aa  95.9  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.556392 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5684  OsmC family protein  42.22 
 
 
150 aa  96.3  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000158569  normal  0.43813 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0597  OsmC/Ohr family protein  44.09 
 
 
140 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5110  OsmC-like protein  43.31 
 
 
140 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46090  OsmC family protein  41.13 
 
 
140 aa  95.5  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4576  OsmC-like protein  43.31 
 
 
140 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0631  OsmC family protein  41.13 
 
 
134 aa  93.2  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1163  OsmC family protein  37.4 
 
 
143 aa  93.2  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000507704 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02740  OsmC family protein  45.19 
 
 
130 aa  92  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2637  OsmC family protein  38.17 
 
 
158 aa  92.4  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3124  hypothetical protein  40.46 
 
 
140 aa  92.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200026  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0008  OsmC family protein  39.64 
 
 
138 aa  92.4  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1433  OsmC family protein  38.06 
 
 
138 aa  91.7  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000412943  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0008  OsmC family protein  38.74 
 
 
138 aa  91.7  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2833  OsmC family protein  39.5 
 
 
150 aa  89  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.63516  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1086  OsmC family protein  41.67 
 
 
149 aa  88.2  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1231  OsmC family protein  35.82 
 
 
139 aa  87.8  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000016936  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0645  OsmC family protein  40.3 
 
 
152 aa  87.8  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117468  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1064  OsmC family protein  41.41 
 
 
135 aa  87  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.156075  normal  0.0776132 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0249  hypothetical protein  44.44 
 
 
135 aa  87  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3944  hypothetical protein  44.44 
 
 
135 aa  86.3  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0732  OsmC-like protein  38.52 
 
 
149 aa  85.5  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0520  OsmC family protein  38.24 
 
 
149 aa  85.5  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4579  hypothetical protein  41.51 
 
 
135 aa  84.3  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0329282  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2006  hypothetical protein  36 
 
 
137 aa  83.6  7e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2309  OsmC-like protein  36 
 
 
137 aa  84  7e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.87552 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0153  OsmC family protein  35.25 
 
 
153 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.818803  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0111  OsmC family protein  36.45 
 
 
128 aa  82.8  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.174178  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0680  OsmC family protein  37.78 
 
 
149 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.444299  normal  0.178697 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3701  hypothetical protein  43.43 
 
 
135 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0659  OsmC family protein  37.78 
 
 
149 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0732219  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0930  OsmC family protein  37.5 
 
 
149 aa  82  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.169385  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3833  hypothetical protein  41.24 
 
 
134 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54216  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3770  hypothetical protein  41.24 
 
 
134 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.356475  normal  0.48627 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3736  hypothetical protein  41.24 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3662  hypothetical protein  41.24 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.511979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>