More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2826 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  100 
 
 
382 aa  749  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  67.11 
 
 
385 aa  488  1e-137  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  66.31 
 
 
397 aa  479  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3865  chromate transporter  65.43 
 
 
390 aa  470  1e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2622  chromate transporter  62.04 
 
 
393 aa  455  1e-127  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  64.88 
 
 
394 aa  451  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3251  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  65.85 
 
 
390 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  62.27 
 
 
396 aa  447  1e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  65.3 
 
 
390 aa  446  1e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5954  chromate transporter  64.99 
 
 
390 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0766957 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5590  chromate transporter  64.99 
 
 
390 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0555  chromate transporter  65.85 
 
 
401 aa  442  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6455  chromate transporter  64.19 
 
 
390 aa  440  1e-122  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  62.8 
 
 
396 aa  439  1e-122  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1521  chromate transporter  65.07 
 
 
401 aa  439  1e-122  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  65.07 
 
 
401 aa  438  1e-122  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  62.8 
 
 
396 aa  439  1e-122  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  62.53 
 
 
396 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1206  chromate transporter  62.4 
 
 
398 aa  435  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405124  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  60.11 
 
 
392 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  60.37 
 
 
392 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  58.91 
 
 
395 aa  419  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2503  chromate transporter  61.64 
 
 
399 aa  413  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  57 
 
 
392 aa  414  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1803  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  60.99 
 
 
400 aa  403  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1211  chromate transport protein  68.24 
 
 
187 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1212  chromate transport protein  64.2 
 
 
188 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1494  chromate transport protein  68.24 
 
 
187 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1495  chromate transport protein  64.2 
 
 
188 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  32.88 
 
 
389 aa  196  6e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  37.61 
 
 
383 aa  196  7e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3318  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.85 
 
 
393 aa  195  9e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.966219 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.15 
 
 
404 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2467  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.59 
 
 
391 aa  191  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4108  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.62 
 
 
472 aa  189  8e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.59 
 
 
379 aa  182  6e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  34.85 
 
 
382 aa  182  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.74 
 
 
386 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  1.35911e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  33.7 
 
 
379 aa  179  9e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2996  chromate transporter  32.39 
 
 
376 aa  176  5e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000942409  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.37 
 
 
387 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  33.51 
 
 
393 aa  176  9e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.11 
 
 
387 aa  175  1e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4416  chromate transporter  29.79 
 
 
376 aa  174  2e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1382  chromate transporter  34.53 
 
 
376 aa  172  8e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1239  chromate transporter  28.83 
 
 
442 aa  167  4e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.132611  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3911  chromate transporter  33.77 
 
 
388 aa  159  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00929243  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1601  chromate transporter  30.17 
 
 
443 aa  159  9e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646731  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  31.94 
 
 
428 aa  152  7e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3191  chromate transporter  30.03 
 
 
483 aa  152  8e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0924  chromate transporter  33.24 
 
 
358 aa  152  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.376436 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0081  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.35 
 
 
450 aa  151  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.826612 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43910  Chromate transporter  28.31 
 
 
453 aa  150  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4886  chromate transporter  29.31 
 
 
456 aa  150  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3384  chromate transporter  28.44 
 
 
456 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2247  chromate transporter  28.9 
 
 
453 aa  149  6e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0538278  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1226  chromate transporter  30.61 
 
 
418 aa  149  8e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4665  putative chromate transporter  27.42 
 
 
463 aa  149  1e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154177  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5157  chromate transporter  28.21 
 
 
456 aa  147  4e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0723  chromate transporter  28.99 
 
 
408 aa  147  4e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4100  chromate transporter  30.17 
 
 
454 aa  147  4e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.343432 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11551  chromate transporter  30.03 
 
 
412 aa  146  5e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0167365 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4365  chromate transporter  27.17 
 
 
455 aa  146  7e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6524  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  27.98 
 
 
420 aa  146  7e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12381  chromate transporter  29.51 
 
 
408 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0443  chromate transporter  29.01 
 
 
412 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1753  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.34 
 
 
467 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0092  chromate transporter  29.63 
 
 
428 aa  145  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  1.19825e-05 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2688  chromate transporter  31.87 
 
 
378 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1891  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.34 
 
 
469 aa  144  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.861826 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2144  chromate transporter  29.72 
 
 
447 aa  143  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1475  chromate transporter  28.34 
 
 
467 aa  143  5e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.215191 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3555  chromate transporter  28.04 
 
 
454 aa  142  8e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2679  chromate transporter  29.36 
 
 
443 aa  141  2e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0450  chromate transporter  28.38 
 
 
456 aa  141  2e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3820  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.63 
 
 
395 aa  141  2e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0284197  normal  0.135489 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2674  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.32 
 
 
441 aa  140  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3159  chromate transporter  27.72 
 
 
450 aa  140  5e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896141  normal  0.125861 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2556  chromate transporter  28.26 
 
 
450 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0100116 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  28.39 
 
 
416 aa  138  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3067  chromate transporter  30.48 
 
 
452 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0932406  normal  0.975583 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5759  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.31 
 
 
457 aa  139  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4194  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.37 
 
 
469 aa  138  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5828  chromate transport protein chrA  27.96 
 
 
463 aa  138  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.42625  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4736  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.2 
 
 
471 aa  137  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6162  chromate transporter  26.42 
 
 
466 aa  136  7e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0139  chromate transporter  29.82 
 
 
462 aa  135  2e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3060  chromate transporter  29.2 
 
 
449 aa  134  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.904181  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2332  putative chromate transport protein  31.09 
 
 
417 aa  134  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00115086  normal  0.80205 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4248  chromate transporter  27.63 
 
 
450 aa  134  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2237  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.93 
 
 
469 aa  133  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3349  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.83 
 
 
441 aa  133  7e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.102603 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3775  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.22 
 
 
352 aa  132  9e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2533  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.77 
 
 
348 aa  132  1e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3337  chromate transporter  28.23 
 
 
454 aa  131  2e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3131  chromate transporter  28.23 
 
 
454 aa  131  2e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6097  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.97 
 
 
469 aa  131  2e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.25 
 
 
415 aa  128  1e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3651  chromate transporter  26.01 
 
 
469 aa  128  1e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.947336 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3583  chromate transporter  28.34 
 
 
460 aa  128  2e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35339  normal  0.0786793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>