More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2738 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 241 aa  496  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  35.38 
 
 		 670 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  44.35 
 
 		 537 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  46.15 
 
 		 694 aa  118  7.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  46.96 
 
 		 510 aa  118  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  47.83 
 
 		 361 aa  115  8.999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  46.03 
 
 		 620 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  34.58 
 
 		 517 aa  112  5e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  44.07 
 
 		 656 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  44.27 
 
 		 424 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  44 
 
 		 509 aa  110  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  30.57 
 
 		 505 aa  108  7.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  46.6 
 
 		 464 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  36.42 
 
 		 412 aa  107  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  45.87 
 
 		 239 aa  106  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  46.15 
 
 		 463 aa  105  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  40.77 
 
 		 459 aa  105  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  41.74 
 
 		 525 aa  105  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  47.01 
 
 		 640 aa  105  8e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  41.41 
 
 		 586 aa  104  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  41.22 
 
 		 641 aa  104  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  43.86 
 
 		 594 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  43.1 
 
 		 1313 aa  100  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  29.67 
 
 		 704 aa  98.6  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  41.59 
 
 		 306 aa  97.1  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5270  OmpA/MotB domain protein  44.66 
 
 		 464 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  38.06 
 
 		 631 aa  97.4  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  32.54 
 
 		 427 aa  96.7  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0884  OmpA/MotB  42.31 
 
 		 464 aa  96.3  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138624  normal  0.799439 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 638 aa  96.3  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0772  OmpA/MotB  42.31 
 
 		 464 aa  95.5  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  39.62 
 
 		 230 aa  95.5  7e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  40.17 
 
 		 630 aa  95.5  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0046  OmpA/MotB domain protein  30.67 
 
 		 432 aa  94.4  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970824  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  30.81 
 
 		 673 aa  94.4  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  40.19 
 
 		 658 aa  93.6  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  39.82 
 
 		 364 aa  94.4  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0502  OmpA/MotB  42.31 
 
 		 463 aa  94  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  42.72 
 
 		 464 aa  94  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  35.71 
 
 		 648 aa  92.8  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0393  OmpA/MotB domain protein  50 
 
 		 399 aa  92.4  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  42.5 
 
 		 673 aa  92  8e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  41.12 
 
 		 217 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1976  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 		 441 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0260904  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  41.67 
 
 		 398 aa  90.5  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.19 
 
 		 217 aa  90.9  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1877  OmpA/MotB  42.31 
 
 		 434 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0777893 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  41.12 
 
 		 631 aa  90.5  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3590  OmpA/MotB  41.75 
 
 		 451 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  37.74 
 
 		 440 aa  89.7  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  39.62 
 
 		 218 aa  89.7  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  43.69 
 
 		 319 aa  89  7e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 217 aa  88.6  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  30.37 
 
 		 669 aa  88.2  9e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  37.5 
 
 		 415 aa  88.2  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  40.54 
 
 		 422 aa  88.2  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.92 
 
 		 407 aa  88.2  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  37.5 
 
 		 218 aa  87.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  41.9 
 
 		 214 aa  87  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  39.25 
 
 		 321 aa  86.7  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  42.99 
 
 		 320 aa  87  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2601  OmpA/MotB domain protein  39.81 
 
 		 403 aa  86.7  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.278208  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  41.18 
 
 		 228 aa  86.3  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1452  cysteine-rich repeat protein  36.75 
 
 		 1793 aa  86.3  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  35.46 
 
 		 224 aa  86.3  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  41.51 
 
 		 445 aa  86.3  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  39.82 
 
 		 729 aa  85.9  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  33.06 
 
 		 734 aa  85.9  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  39.62 
 
 		 243 aa  85.9  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1209  OmpA/MotB domain-containing protein  35.34 
 
 		 369 aa  85.9  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.469659  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3582  OmpA/MotB domain protein  40.57 
 
 		 366 aa  85.9  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.645571  normal  0.625301 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  41.18 
 
 		 228 aa  85.9  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0062  putative outer membrane lipoprotein  40 
 
 		 220 aa  85.5  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  36.79 
 
 		 388 aa  85.5  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  38.61 
 
 		 311 aa  85.1  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2385  OmpA/MotB domain protein  39.05 
 
 		 416 aa  85.1  9e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  40 
 
 		 466 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  38.61 
 
 		 310 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  38.61 
 
 		 310 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0202  OmpA/MotB domain-containing protein  42.73 
 
 		 194 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000181939  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5767  OmpA/MotB family protein  40.95 
 
 		 214 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00312455  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  38.61 
 
 		 310 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  41.9 
 
 		 215 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  39.25 
 
 		 506 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0236  OmpA/MotB  40.32 
 
 		 334 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906907  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  38.61 
 
 		 310 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  41.9 
 
 		 215 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  41.9 
 
 		 215 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2084  OmpA/MotB domain-containing protein  34.9 
 
 		 337 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000772765  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  38.68 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  40.2 
 
 		 218 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  37.07 
 
 		 668 aa  84  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  38.61 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5086  OmpA/MotB domain protein  42.45 
 
 		 533 aa  84  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  38.61 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  37.86 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  41.35 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  38.61 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  37.86 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  43.27 
 
 		 498 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>