268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2735 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2735  oxidoreductase molybdopterin binding protein  100 
 
 
415 aa  852    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.313353  hitchhiker  0.0000568946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1615  oxidoreductase molybdopterin binding  74.31 
 
 
414 aa  622  1e-177  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  72.61 
 
 
405 aa  616  1e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0561  sulfite dehydrogenase  68.14 
 
 
414 aa  594  1e-169  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  59.52 
 
 
409 aa  403  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1093  twin-arginine translocation pathway signal  55.73 
 
 
425 aa  393  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  54.55 
 
 
429 aa  392  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2988  oxidoreductase, molybdopterin binding  54.13 
 
 
425 aa  386  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3339  oxidoreductase molybdopterin binding  53.54 
 
 
406 aa  383  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.617225  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3664  oxidoreductase molybdopterin binding  53.54 
 
 
402 aa  383  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185653  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5873  oxidoreductase molybdopterin binding  54.46 
 
 
414 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  normal  0.20315 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0148  oxidoreductase molybdopterin binding  53.78 
 
 
437 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1238  oxidoreductase, molybdopterin binding  54.93 
 
 
418 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6594  oxidoreductase, molybdopterin binding  54.93 
 
 
418 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0853456 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  45.52 
 
 
431 aa  356  2.9999999999999997e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0911  putative sulfite oxidase  51.96 
 
 
437 aa  355  1e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.911487  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6198  oxidoreductase molybdopterin binding  54.33 
 
 
418 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2166  putative sulfite oxidase, dehydrogenase subunit(SoxC)  48.61 
 
 
424 aa  350  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7230  oxidoreductase molybdopterin binding  52.79 
 
 
406 aa  351  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0151  putative sulfite oxidase  50.56 
 
 
419 aa  348  8e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  45.02 
 
 
428 aa  344  1e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1504  sulfite oxidase SoxC, putative  50.89 
 
 
419 aa  345  1e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545192  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  45.02 
 
 
428 aa  344  1e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  0.00000538057 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2086  sulfite oxidase SoxC, putative  50.74 
 
 
431 aa  343  4e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.29998  normal  0.615224 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3676  sulfur dehydrogenase subunit SoxC  47.07 
 
 
427 aa  342  5e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4161  oxidoreductase molybdopterin binding  51.82 
 
 
430 aa  342  9e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0156  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  43.74 
 
 
453 aa  339  4e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000433271  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0587  oxidoreductase molybdopterin binding protein  49.57 
 
 
456 aa  340  4e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.271361  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1894  twin-arginine translocation pathway signal precursor  41.81 
 
 
427 aa  334  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4957  oxidoreductase molybdopterin binding  43.63 
 
 
431 aa  332  5e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2286  molybdopterin-binding oxidoreductase  49.55 
 
 
451 aa  330  3e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0386813  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3212  oxidoreductase molybdopterin binding  50.75 
 
 
423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1589  oxidoreductase molybdopterin binding  49.24 
 
 
445 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.45002  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4368  twin-arginine translocation pathway signal  46.48 
 
 
425 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1665  oxidoreductase molybdopterin binding  48.94 
 
 
449 aa  326  5e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4252  twin-arginine translocation pathway signal  46.2 
 
 
425 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3041  oxidoreductase, molybdopterin binding  48.49 
 
 
414 aa  323  3e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1518  oxidoreductase molybdopterin binding  49.54 
 
 
440 aa  319  7e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.883795  normal  0.831721 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2060  twin-arginine translocation pathway signal  46.25 
 
 
445 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000389133  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3258  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  47.72 
 
 
449 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0801  oxidoreductase, molybdopterin binding  44.14 
 
 
451 aa  300  4e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.325021  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3134  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  46.13 
 
 
448 aa  300  5e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0673188  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  47.71 
 
 
420 aa  295  8e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2631  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  45.27 
 
 
443 aa  286  7e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.492263  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3784  oxidoreductase molybdopterin binding  45.56 
 
 
457 aa  283  3.0000000000000004e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4155  oxidoreductase, molybdopterin binding  43.35 
 
 
430 aa  283  3.0000000000000004e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2802  oxidoreductase  45.02 
 
 
425 aa  282  9e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2438  putative sulfite oxidase molybdopterin subunit  44.67 
 
 
457 aa  279  5e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  33.23 
 
 
376 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  31.58 
 
 
372 aa  153  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  31.83 
 
 
414 aa  150  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.45 
 
 
415 aa  150  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000198483  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  31.85 
 
 
370 aa  149  8e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2981  putative molydopterin binding oxidoreductase  30.93 
 
 
420 aa  144  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  31.97 
 
 
369 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.32 
 
 
400 aa  139  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8530  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 
349 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.78 
 
 
415 aa  134  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0916  twin-arginine translocation pathway signal  32.83 
 
 
461 aa  132  9e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  29.5 
 
 
409 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5280  sulfite oxidase  31.29 
 
 
359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591678  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4081  twin-arginine translocation pathway signal  32.83 
 
 
461 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  29.26 
 
 
451 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  30.02 
 
 
402 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  29.32 
 
 
401 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  30.24 
 
 
403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3624  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.5 
 
 
411 aa  126  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564315  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.95 
 
 
453 aa  125  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  29.97 
 
 
405 aa  120  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  29.97 
 
 
405 aa  120  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  30 
 
 
361 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6939  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.94 
 
 
417 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  29.71 
 
 
414 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37938  predicted protein  29.55 
 
 
866 aa  117  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.590439  normal  0.879833 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  30.12 
 
 
401 aa  117  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  27.48 
 
 
410 aa  117  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  28.99 
 
 
403 aa  117  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3242  oxidoreductase molybdopterin binding  28.36 
 
 
410 aa  116  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.842559 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2864  sulfite oxidase  27.19 
 
 
363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  28.96 
 
 
402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  27.32 
 
 
412 aa  113  5e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000111038  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  27.79 
 
 
369 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  27.51 
 
 
407 aa  112  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  27.66 
 
 
369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  27.78 
 
 
406 aa  110  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  27.66 
 
 
369 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2781  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  28.53 
 
 
434 aa  109  7.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446362  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08058  sulfite oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02190)  27.7 
 
 
380 aa  107  5e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1622  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  30.52 
 
 
446 aa  106  9e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5267  oxidoreductase molybdopterin binding  29.94 
 
 
407 aa  106  9e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873576  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2874  twin-arginine translocation pathway signal  28.16 
 
 
457 aa  106  9e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  28.44 
 
 
402 aa  105  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1175  oxidoreductase molybdopterin binding  28.77 
 
 
408 aa  104  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000118836 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  29.71 
 
 
426 aa  103  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  27.61 
 
 
400 aa  103  7e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0981  oxidoreductase molybdopterin binding  27.92 
 
 
408 aa  103  7e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.036164  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4929  oxidoreductase, molybdopterin-binding  28.02 
 
 
414 aa  103  8e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  27.75 
 
 
412 aa  102  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_3554  predicted protein  27.09 
 
 
375 aa  102  9e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.298587  normal  0.425378 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3083  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  27.67 
 
 
417 aa  102  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>