More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2684 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2684  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 101 aa  205  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245912  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_002950  PG1570  rhodanese-like domain-containing protein  46.39 
 
 		 127 aa  95.9  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  43.82 
 
 		 116 aa  80.1  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0039  phage shock protein E  40.82 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  44.87 
 
 		 116 aa  75.1  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  45.68 
 
 		 130 aa  73.6  0.0000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  40.66 
 
 		 129 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  40.24 
 
 		 116 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4394  phage shock protein E  34.69 
 
 		 108 aa  72  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  47.06 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0323  rhodanese domain-containing protein  34 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000826672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3701  rhodanese domain-containing protein  34.69 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000331812  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  38 
 
 		 131 aa  72  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  47.06 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0318  rhodanese domain-containing protein  34.69 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000262088  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  31.13 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1391  rhodanese domain-containing protein  41.46 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000425573  hitchhiker  0.000000000236853 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1456  rhodanese domain-containing protein  41.46 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00260172  hitchhiker  0.000336538 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3904  rhodanese domain-containing protein  35.37 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000089939  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1581  Rhodanese domain protein  41.67 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0432262  hitchhiker  0.00000000099869 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3105  phage shock protein E  41.46 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0320  rhodanese domain-containing protein  33.67 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000759321  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1444  rhodanese domain-containing protein  41.46 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000545636  hitchhiker  0.00000000189127 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2872  rhodanese domain-containing protein  40.48 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0499006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0326  rhodanese domain-containing protein  33.67 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000194442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2797  rhodanese domain-containing protein  40.48 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000100597  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0322  rhodanese domain-containing protein  33.67 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000003033  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0327  Rhodanese domain protein  33.67 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000770666  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  47.76 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  41.18 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3528  rhodanese domain-containing protein  31.63 
 
 		 112 aa  67  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000546152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2777  rhodanese domain-containing protein  38.89 
 
 		 138 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000237337  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2832  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 109 aa  67  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018114 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  49.3 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  44.93 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2476  rhodanese domain-containing protein  43.04 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3397  phage shock protein E  32.65 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  50 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  44.58 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  41.18 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  42.31 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  43.84 
 
 		 363 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  40.26 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1901  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  46.38 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  51.47 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  44.93 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  37.11 
 
 		 167 aa  65.1  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3504  rhodanese domain-containing protein  51.47 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.64144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2652  rhodanese-like protein  39.33 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  41.56 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  37.63 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  40.58 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  41.89 
 
 		 189 aa  63.9  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2691  rhodanese domain-containing protein  42.47 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1561  rhodanese domain-containing protein  45.83 
 
 		 188 aa  63.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.229111 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2742  Rhodanese domain protein  39.33 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  40.58 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  40.58 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  40.58 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  40.58 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  40.58 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  40.58 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  40.58 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  36.59 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  34.94 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3835  rhodanese domain-containing protein  36.73 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2837  Rhodanese domain protein  40.45 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114953  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  39.24 
 
 		 423 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0281  Rhodanese domain protein  39.76 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.161319 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  40.58 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  40.58 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  42.5 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  42.67 
 
 		 459 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  38.55 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  42.67 
 
 		 459 aa  62  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  42.67 
 
 		 459 aa  62  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  41.56 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1829  rhodanese domain-containing protein  38.55 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835748  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4024  rhodanese domain-containing protein  38.55 
 
 		 225 aa  62  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125541  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  33.33 
 
 		 280 aa  61.2  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3083  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  47.62 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  38.75 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  42.42 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1612  rhodanese domain-containing protein  34.52 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0487868  hitchhiker  0.00165935 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5402  rhodanese domain-containing protein  43.28 
 
 		 221 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.172427 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  40.85 
 
 		 470 aa  60.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  48.21 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5313  rhodanese-like protein  43.28 
 
 		 221 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  37.35 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0984  rhodanese domain-containing protein  41.79 
 
 		 192 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5692  rhodanese domain-containing protein  43.28 
 
 		 221 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  46.38 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1706  Rhodanese domain protein  42.65 
 
 		 190 aa  60.5  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0369363  normal  0.872619 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  41.46 
 
 		 361 aa  60.1  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  41.77 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  44.16 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0153  coenzyme A disulfide reductase, putative  32.22 
 
 		 565 aa  59.7  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3040  rhodanese domain-containing protein  36.84 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00420401  normal  0.0677639 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  42.47 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>