131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2680 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4349  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  61.41 
 
 		 1236 aa  747    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.165187 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  100 
 
 		 1206 aa  2445    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2604  Fibronectin type III domain protein  30.05 
 
 		 1302 aa  231  8e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.178054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  51.19 
 
 		 14944 aa  168  6.9999999999999995e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1146  hypothetical protein  37.94 
 
 		 1504 aa  166  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  55.32 
 
 		 1295 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2644  glycosy hydrolase family protein  50 
 
 		 601 aa  150  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2666  glycosy hydrolase family protein  45.16 
 
 		 970 aa  141  8.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0316  PA14  31.15 
 
 		 644 aa  141  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.914268  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  45.16 
 
 		 693 aa  140  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2778  PA14 domain protein  45.86 
 
 		 978 aa  127  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1092  PA14 domain protein  41.98 
 
 		 613 aa  127  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  42.36 
 
 		 812 aa  125  4e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  44.17 
 
 		 841 aa  124  8e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3712  Beta-galactosidase  45.65 
 
 		 1392 aa  123  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173046  normal  0.0203648 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1581  PA14 domain protein  40.65 
 
 		 969 aa  121  7.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  39.13 
 
 		 1479 aa  120  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2672  glycosy hydrolase family protein  44.29 
 
 		 1193 aa  118  7.999999999999999e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947842  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2448  PA14 domain protein  39.43 
 
 		 1141 aa  117  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  38.86 
 
 		 693 aa  116  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2340  hypothetical protein  25.29 
 
 		 898 aa  116  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  46.56 
 
 		 4465 aa  115  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  44.09 
 
 		 2334 aa  111  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  44.12 
 
 		 918 aa  111  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2969  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  43.36 
 
 		 558 aa  108  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00836901  hitchhiker  0.00161075 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  38.41 
 
 		 904 aa  106  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2289  glycosy hydrolase family protein  40.29 
 
 		 1069 aa  105  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3093  PA14 domain protein  40.46 
 
 		 569 aa  104  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4791  PA14 domain protein  51.55 
 
 		 2252 aa  103  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.45455  normal  0.215304 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1268  PA14 domain-containing protein  39.53 
 
 		 578 aa  103  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.29777 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  40.82 
 
 		 1193 aa  102  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2403  PA14 domain protein  33.54 
 
 		 1172 aa  101  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  31.84 
 
 		 3802 aa  100  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  37.31 
 
 		 1424 aa  100  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1073  discoidin domain-containing protein  39.76 
 
 		 2142 aa  98.2  9e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.742063  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.37 
 
 		 760 aa  97.4  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1687  PA14 domain-containing protein  40.52 
 
 		 584 aa  96.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000321103 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  33.52 
 
 		 886 aa  94.7  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5704  PA14 domain protein  42.67 
 
 		 423 aa  94.4  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573228 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4152  glycoside hydrolase family protein  40 
 
 		 831 aa  90.1  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198899  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  32 
 
 		 766 aa  87.8  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6292  PA14 domain protein  33.72 
 
 		 1314 aa  87.8  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.237878 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2750  YD repeat protein  33.97 
 
 		 2447 aa  87.4  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.24 
 
 		 765 aa  86.3  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  31.75 
 
 		 361 aa  80.9  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0383  PA14 domain protein  34.42 
 
 		 578 aa  81.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0135238 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1278  leucine rich repeat domain-containing protein  35.26 
 
 		 1465 aa  80.5  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0180436  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1489  F5/8 type C domain-containing protein  34.62 
 
 		 1687 aa  79.7  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3221  glycoside hydrolase family protein  33.99 
 
 		 995 aa  78.2  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179721 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1621  PA14 domain-containing protein  45.24 
 
 		 654 aa  78.2  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.459309  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  24.67 
 
 		 1024 aa  77.4  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0948  YD repeat protein  33.12 
 
 		 2215 aa  77.8  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.784395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5086  hypothetical protein  43.04 
 
 		 421 aa  76.3  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6876  Hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 		 547 aa  76.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2485  Protein of unknown function DUF1588  29.05 
 
 		 778 aa  74.7  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.474006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4158  hypothetical protein  40.91 
 
 		 508 aa  73.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0491983 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.43 
 
 		 1064 aa  73.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0451  sulfatase  31.08 
 
 		 719 aa  72.8  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0156  glycosyl hydrolase family 31 protein  27.91 
 
 		 1108 aa  69.7  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0105603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0019  PA14 domain protein  32.14 
 
 		 2392 aa  69.3  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000236303 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  36.59 
 
 		 1293 aa  69.3  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2374  hypothetical protein  34.11 
 
 		 772 aa  68.6  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.447497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2763  hypothetical protein  44.05 
 
 		 1117 aa  67.8  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2856  hypothetical protein  44.05 
 
 		 1117 aa  67.8  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00658326  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2419  Beta-glucosidase  35.29 
 
 		 849 aa  66.6  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.326586  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01638  glucan 1,4-beta-glucosidase  32.43 
 
 		 889 aa  66.2  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2256  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  42.31 
 
 		 496 aa  65.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.532736 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1781  Beta-glucosidase  29.8 
 
 		 906 aa  65.5  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2575  Parallel beta-helix repeat protein  41.03 
 
 		 495 aa  65.1  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  33.08 
 
 		 966 aa  65.1  0.000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.2 
 
 		 790 aa  65.1  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3694  glycosyl hydrolase, family 3  28.48 
 
 		 772 aa  64.3  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.923315  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2185  Beta-glucosidase  30 
 
 		 884 aa  64.3  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2257  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  41.03 
 
 		 496 aa  64.3  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.719772 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2868  PKD domain containing protein  42.17 
 
 		 687 aa  63.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2960  PKD domain containing protein  42.35 
 
 		 687 aa  63.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6850  Hemolysin-type calcium-binding region  37.66 
 
 		 565 aa  63.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3153  Beta-glucosidase  31.39 
 
 		 913 aa  63.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139372  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  30.46 
 
 		 1455 aa  63.2  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3883  glycoside hydrolase family 3 protein  29.46 
 
 		 875 aa  63.2  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.128454  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3170  glycosyl hydrolase, family 3  29.33 
 
 		 897 aa  62.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.541746  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3318  beta-glucosidase  28.57 
 
 		 913 aa  62.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00176622  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3227  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  41.56 
 
 		 537 aa  62.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.751454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1610  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.98 
 
 		 964 aa  62.4  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2005  Beta-glucosidase  33.33 
 
 		 882 aa  62.4  0.00000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346494  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1929  Beta-glucosidase  30.39 
 
 		 882 aa  62.4  0.00000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2979  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  40.26 
 
 		 541 aa  61.6  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.461822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2973  PKD domain containing protein  35.92 
 
 		 586 aa  61.6  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.234709  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2624  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  39.08 
 
 		 950 aa  61.6  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3035  glycoside hydrolase family protein  28.67 
 
 		 913 aa  61.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  0.109477 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3432  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  41.18 
 
 		 964 aa  61.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0164906 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2574  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  41.33 
 
 		 497 aa  61.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.053652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1842  hyaluronoglucosaminidase domain-containing protein  39.22 
 
 		 248 aa  59.7  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  34.32 
 
 		 850 aa  59.7  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4027  parallel beta-helix repeat-containing protein  22.32 
 
 		 644 aa  59.3  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.644383  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1960  PA14 domain protein  30.5 
 
 		 204 aa  59.7  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.372065  hitchhiker  0.00673603 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6426  hypothetical protein  22.01 
 
 		 708 aa  58.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4245  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.82 
 
 		 1072 aa  57  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1313  hypothetical protein  35.71 
 
 		 451 aa  57.4  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6231  hypothetical protein  22.37 
 
 		 709 aa  56.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126959 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>