277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2479 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2479  nitrogen-fixing NifU domain protein  100 
 
 
200 aa  403  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40084  normal  0.245689 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4882  nitrogen-fixing NifU domain protein  70.05 
 
 
198 aa  277  7e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436115  normal  0.113106 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0722  nitrogen-fixing NifU domain protein  50.25 
 
 
198 aa  188  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0513742 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0365  thioredoxin-related protein  50.77 
 
 
191 aa  185  3e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299726  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1676  NifU domain-containing protein  39.9 
 
 
299 aa  150  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.663631  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01075  NifU-like domain protein  40.21 
 
 
305 aa  148  6e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2934  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.08 
 
 
183 aa  148  6e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0974289 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1955  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.46 
 
 
299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16693  predicted protein  42.56 
 
 
195 aa  135  4e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0531  NifU domain-containing protein  39.15 
 
 
184 aa  131  6.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241454  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30771  predicted protein  41.58 
 
 
206 aa  130  9e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.777457  normal  0.560204 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3091  nitrogen-fixing NifU-like  39.36 
 
 
187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.758224  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2095  Scaffold protein Nfu/NifU  40.86 
 
 
187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.724202  normal  0.959854 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0889  NifU domain-containing protein  39.89 
 
 
186 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0368383  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1075  NifU domain-containing protein  38.83 
 
 
191 aa  129  3e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152457  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0865  nitrogen-fixing NifU-like  39.67 
 
 
187 aa  129  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0779261 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3531  nitrogen-fixing NifU-like  40.64 
 
 
183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3028  NifU domain-containing protein  37.23 
 
 
187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0019  scaffold protein Nfu/NifU  39.47 
 
 
189 aa  126  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.01661  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2279  NifU domain-containing protein  38.25 
 
 
186 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.473385  normal  0.588083 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2900  Scaffold protein Nfu/NifU  39.06 
 
 
187 aa  124  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2839  hypothetical protein  39.67 
 
 
187 aa  123  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0061746  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76567  predicted protein  37.24 
 
 
242 aa  122  3e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000975228 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2214  nitrogen-fixing NifU  37.16 
 
 
186 aa  120  9e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.731458  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2071  nitrogen-fixing NifU-like protein  38.14 
 
 
190 aa  120  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0389413  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2380  scaffold protein Nfu/NifU-like protein  38.86 
 
 
192 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0153  scaffold protein Nfu/NifU  38.86 
 
 
190 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0800  nitrogen-fixing NifU, C-terminal  39.27 
 
 
186 aa  117  9e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00447  NifU-related protein (AFU_orthologue; AFUA_1G04680)  35.27 
 
 
326 aa  117  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215741  normal  0.563754 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1823  scaffold protein Nfu/NifU  40.31 
 
 
186 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.266684  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4037  nitrogen-fixing NifU-like  38.54 
 
 
189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1775  NifU domain-containing protein  39.78 
 
 
185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.126577  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0140  NifU-related protein  37.31 
 
 
190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0134  NifU-related protein  37.31 
 
 
190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00825478  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3394  Scaffold protein Nfu/NifU  36.46 
 
 
188 aa  115  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4429  Scaffold protein Nfu/NifU  36.65 
 
 
187 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.021918  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0202  NifU domain-containing protein  37.1 
 
 
186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.419863  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0463  nitrogen-fixing NifU-like  38.42 
 
 
188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3611  scaffold protein Nfu/NifU  37.3 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0247  nitrogen-fixing NifU-like  37.16 
 
 
188 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3394  scaffold protein Nfu/NifU  36.65 
 
 
187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.252706 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0040  putative nifU protein  37.04 
 
 
189 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15873  normal  0.567558 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3522  Scaffold protein Nfu/NifU  36.46 
 
 
188 aa  111  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.128195  normal  0.0920185 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3198  scaffold protein Nfu/NifU  36.46 
 
 
188 aa  111  6e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.113842  normal  0.941743 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0036  Scaffold protein Nfu/NifU  36.27 
 
 
188 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0024  Scaffold protein Nfu/NifU  36.79 
 
 
188 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.419851 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0009  nitrogen-fixing NifU  36.02 
 
 
190 aa  107  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.964123  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0036  scaffold protein Nfu/NifU  34.87 
 
 
188 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0881083  hitchhiker  0.0000181724 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01900  iron ion homeostasis-related protein, putative  39.11 
 
 
309 aa  106  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1170  NifU family protein  35.9 
 
 
192 aa  106  2e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.841091  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0430  hypothetical protein  36.13 
 
 
186 aa  105  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255854  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0988  nitrogen-fixing NifU-like  36 
 
 
195 aa  105  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82838  predicted protein  33.16 
 
 
254 aa  105  4e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0133189  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0457  Scaffold protein Nfu/NifU  35.33 
 
 
188 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0817  NifU-like domain-containing protein  33.87 
 
 
180 aa  100  2e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.946784  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0016  nitrogen-fixing NifU-like  35.29 
 
 
191 aa  100  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00443934  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0585  nitrogen-fixing NifU-like  34.78 
 
 
188 aa  99.4  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0644  scaffold protein Nfu/NifU  34.9 
 
 
188 aa  92  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.728561 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1051  scaffold protein Nfu/NifU  37.7 
 
 
187 aa  91.7  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.906453  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1865  nitrogen-fixing NifU-like  30.85 
 
 
186 aa  86.3  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0701  nitrogen-fixing NifU-like  28.27 
 
 
186 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0260  NifU domain-containing protein  51.43 
 
 
74 aa  73.9  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0962  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.74 
 
 
81 aa  73.2  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1070  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.89 
 
 
76 aa  67.8  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.83 
 
 
72 aa  65.5  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03110  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.54 
 
 
74 aa  65.1  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1408  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.06 
 
 
73 aa  65.1  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.510061  normal  0.98694 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3034  nitrogen-fixing NifU-like  42.47 
 
 
76 aa  64.3  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0074  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.95 
 
 
87 aa  64.3  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  45.98 
 
 
103 aa  63.2  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3484  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.65 
 
 
74 aa  62.8  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000024465  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2796  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.83 
 
 
73 aa  62.8  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000131696  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3441  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  41.1 
 
 
79 aa  62.4  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1752  NifU-like protein  44.93 
 
 
81 aa  62.4  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.354649  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04381  NifU-like protein  44.3 
 
 
81 aa  62.8  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.725479  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0414  NifU-like protein  44.3 
 
 
81 aa  62.8  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04691  NifU-like protein  44.3 
 
 
81 aa  62.8  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04711  NifU-like protein  44.93 
 
 
81 aa  62.4  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.265709  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2023  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.47 
 
 
81 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1414  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.44 
 
 
73 aa  62  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.68572e-21 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1466  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.66 
 
 
73 aa  62  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04791  NifU-like protein  44.3 
 
 
81 aa  62  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20981  NifU-like protein  44.93 
 
 
81 aa  62  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1148  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.1 
 
 
79 aa  61.6  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.52272 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1119  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.1 
 
 
79 aa  61.6  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0723  NifU domain-containing protein  43.66 
 
 
76 aa  61.6  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.603746 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  44.29 
 
 
73 aa  61.2  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0399  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.22 
 
 
79 aa  60.8  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04161  NifU-like protein  44.93 
 
 
81 aa  60.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.43569  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2861  nitrogen-fixing NifU-like protein  41.03 
 
 
80 aa  61.2  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1632  NifU-like protein  50.68 
 
 
72 aa  60.5  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000186996  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2988  nitrogen-fixing NifU domain protein  24 
 
 
202 aa  60.5  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0796  NifU-like protein  43.48 
 
 
81 aa  60.1  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.077695  normal  0.023151 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3402  nitrogen-fixing NifU-like  41.89 
 
 
80 aa  60.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.168954 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1812  Fe-S cluster assembly protein NifU  46.38 
 
 
294 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1784  Fe-S cluster assembly protein NifU  46.38 
 
 
294 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3614  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.29 
 
 
73 aa  59.7  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187737  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0076  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.32 
 
 
73 aa  59.7  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2284  NifU domain-containing protein  44.78 
 
 
74 aa  59.7  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000278833  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12230  thioredoxin-like protein  44.29 
 
 
75 aa  59.7  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000175361  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>