More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2438 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2438  aminotransferase class V  100 
 
 		 398 aa  825    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.359117 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02090  hypothetical protein  40.99 
 
 		 380 aa  325  8.000000000000001e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.468544  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3040  aminotransferase, class V  40.77 
 
 		 381 aa  281  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130075  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1341  aminotransferase class V  38.66 
 
 		 377 aa  272  7e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2207  aminotransferase, class V  36.92 
 
 		 381 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0554  aminotransferase, class V  34.86 
 
 		 355 aa  212  7.999999999999999e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.721131  hitchhiker  0.00373299 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03589  aminotransferase, class V superfamily  32.39 
 
 		 393 aa  172  9e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.301675  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7397  Selenocysteine lyase  30.87 
 
 		 382 aa  164  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3773  aminotransferase class V  31.76 
 
 		 391 aa  159  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5353  aminotransferase class V  31.04 
 
 		 380 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.11849 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4343  selenocysteine lyase  30.45 
 
 		 384 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4490  aminotransferase class V  29.24 
 
 		 389 aa  143  5e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0650155 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4479  aminotransferase class V  29.84 
 
 		 384 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4498  aminotransferase class V  29.06 
 
 		 384 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  28.36 
 
 		 387 aa  125  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  29.06 
 
 		 381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  27.09 
 
 		 377 aa  120  6e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000223228  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2765  aminotransferase class V  25.26 
 
 		 379 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  26.87 
 
 		 377 aa  117  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45663  predicted protein  27.69 
 
 		 356 aa  116  6.9999999999999995e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  26.46 
 
 		 411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  23.68 
 
 		 368 aa  110  6e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5082  aminotransferase class V  27.94 
 
 		 402 aa  109  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000086974  normal  0.0923906 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  26.02 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1250  aminotransferase class V  28.07 
 
 		 372 aa  102  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1720  hypothetical protein  25.84 
 
 		 401 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0138813  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  28.08 
 
 		 378 aa  100  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25790  hypothetical protein  26.15 
 
 		 377 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.226944 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0911  aminotransferase, class V  26.08 
 
 		 379 aa  98.2  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  24.55 
 
 		 376 aa  97.8  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2203  hypothetical protein  26.41 
 
 		 377 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1533  aminotransferase class V  25.96 
 
 		 377 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.172669  normal  0.519626 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15030  cysteine desulfurase protein  27.48 
 
 		 377 aa  94.7  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4955  aminotransferase class V  24.55 
 
 		 387 aa  93.6  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3417  kynureninase  25.31 
 
 		 371 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.746937 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  26.3 
 
 		 374 aa  83.6  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1232  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.93 
 
 		 629 aa  82.4  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  26.72 
 
 		 367 aa  82.8  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0644  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  21.86 
 
 		 420 aa  82  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4470  kynureninase  27.3 
 
 		 416 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479013 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0822  kynureninase  26.51 
 
 		 416 aa  80.1  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.632925  hitchhiker  0.00000920194 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0679  kynureninase  28.78 
 
 		 413 aa  79.7  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5290  aminotransferase class V  28.57 
 
 		 380 aa  77.8  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00731204  normal  0.0470255 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17260  selenocysteine lyase  26.8 
 
 		 413 aa  77.8  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.118877  normal  0.0290981 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3724  aminotransferase, class V  24.55 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00735712 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3556  aminotransferase, class V  22.34 
 
 		 370 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.27 
 
 		 678 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0295  aminotransferase, class V  24.55 
 
 		 374 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361608 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  24.75 
 
 		 401 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1785  aminotransferase class V  29.53 
 
 		 347 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4796  aminotransferase class V  27.03 
 
 		 362 aa  74.3  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.688685 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1071  aminotransferase, class V  28.5 
 
 		 382 aa  74.3  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3782  aminotransferase class V  24.69 
 
 		 384 aa  73.9  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6148  aminotransferase class V  23.04 
 
 		 416 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.922128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  24.46 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2945  aminotransferase, class V  27.05 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.119234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1881  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  27.14 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000647321  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2385  aminotransferase class V  26.37 
 
 		 357 aa  73.6  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00212379  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.46 
 
 		 406 aa  73.2  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1969  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  23.63 
 
 		 406 aa  73.2  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0908482  hitchhiker  0.0000000737026 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2394  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  24.46 
 
 		 406 aa  72.8  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0201879  hitchhiker  0.000057861 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1984  aminotransferase class V  25.9 
 
 		 345 aa  72.4  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.817831  hitchhiker  0.0000368323 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1505  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  23.63 
 
 		 406 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000304018 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1486  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  23.63 
 
 		 406 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.199299  hitchhiker  0.000000000797081 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0719  kynureninase  26.46 
 
 		 418 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.76256  normal  0.281792 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4413  kynureninase  23.39 
 
 		 378 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1798  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  23.63 
 
 		 406 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228411  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  25.63 
 
 		 387 aa  72  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0617  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.04 
 
 		 621 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000358817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2626  kynureninase  26.06 
 
 		 417 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.830295  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0295  aminotransferase, class V  23.32 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000286273 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1586  putative L-cysteine/cystine lyase  25.38 
 
 		 400 aa  70.9  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2497  kynureninase  26.06 
 
 		 417 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.651765  normal  0.855444 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1470  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  23.38 
 
 		 406 aa  70.5  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.244975  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5203  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.36 
 
 		 941 aa  70.5  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  26.7 
 
 		 372 aa  70.5  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1896  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  24.18 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554851  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  23.14 
 
 		 412 aa  69.7  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  21.54 
 
 		 404 aa  69.7  0.00000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1762  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.23 
 
 		 572 aa  69.7  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1951  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  24.18 
 
 		 406 aa  69.7  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00128399  unclonable  0.0000000107568 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.64 
 
 		 406 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01649  selenocysteine lyase  24.18 
 
 		 406 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000238093  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1761  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  24.18 
 
 		 406 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00014755  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01639  hypothetical protein  24.18 
 
 		 406 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000164024  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  22.47 
 
 		 644 aa  69.3  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1473  kynureninase  27.67 
 
 		 409 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  23.8 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1377  aminotransferase, class V  23.87 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3589  kynureninase  24.92 
 
 		 453 aa  68.6  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.209302 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  25 
 
 		 415 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5192  kynureninase  32.28 
 
 		 409 aa  68.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.491737 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0407  aminotransferase, class V  25 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482772  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0352  kynureninase, putative  24.93 
 
 		 416 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.543237  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3922  aminotransferase class V  24.11 
 
 		 371 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2486  kynureninase  24.93 
 
 		 416 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0099  kynureninase  24.93 
 
 		 416 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0651  kynureninase  24.93 
 
 		 416 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.131802  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0300  aminotransferase class V  23.84 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  23.78 
 
 		 406 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>