More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2435 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2435  3-dehydroquinate dehydratase, type II  100 
 
 		 142 aa  291  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.476649 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2796  3-dehydroquinate dehydratase, type II  74.64 
 
 		 138 aa  231  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.396749  normal  0.170402 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0128  3-dehydroquinate dehydratase, type II  63.97 
 
 		 137 aa  194  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.297868  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2345  3-dehydroquinate dehydratase, type II  63.24 
 
 		 137 aa  190  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.660798  normal  0.653044 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0067  3-dehydroquinate dehydratase, type II  62.96 
 
 		 139 aa  176  7e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463951  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2703  3-dehydroquinate dehydratase  57.04 
 
 		 145 aa  171  2.9999999999999996e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0204  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.47 
 
 		 147 aa  166  9e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2174  3-dehydroquinate dehydratase, type II  61.15 
 
 		 140 aa  166  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11973  3-dehydroquinate dehydratase  52.17 
 
 		 144 aa  163  9e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1731  3-dehydroquinate dehydratase  55.71 
 
 		 141 aa  160  5.0000000000000005e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  59.56 
 
 		 158 aa  157  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01135  Catabolic 3-dehydroquinase (EC 4.2.1.10)(3-dehydroquinate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P05147]  54.35 
 
 		 153 aa  157  6e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2690  3-dehydroquinate dehydratase  55 
 
 		 150 aa  155  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000775969  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3174  3-dehydroquinate dehydratase  56.83 
 
 		 153 aa  154  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.715681 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3145  3-dehydroquinate dehydratase  55.4 
 
 		 146 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35351  normal  0.502836 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1784  3-dehydroquinate dehydratase  55.07 
 
 		 147 aa  154  6e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851396 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3376  3-dehydroquinate dehydratase  55.47 
 
 		 147 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0570  3-dehydroquinate dehydratase  55.15 
 
 		 150 aa  151  2.9999999999999998e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3022  3-dehydroquinate dehydratase  55.32 
 
 		 147 aa  150  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00285164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3121  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.33 
 
 		 149 aa  150  8e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5453  3-dehydroquinate dehydratase  52.14 
 
 		 147 aa  149  8.999999999999999e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.747889  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0932  3-dehydroquinate dehydratase  54.01 
 
 		 151 aa  149  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  54.01 
 
 		 160 aa  149  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  53.28 
 
 		 151 aa  149  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.01 
 
 		 145 aa  149  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  53.1 
 
 		 146 aa  148  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0211  3-dehydroquinate dehydratase  53.68 
 
 		 156 aa  148  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3637  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.11 
 
 		 142 aa  149  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0845  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.29 
 
 		 145 aa  148  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  53.85 
 
 		 145 aa  148  3e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00170  3-dehydroquinate dehydratase  55.97 
 
 		 179 aa  148  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0088  3-dehydroquinate dehydratase  55.56 
 
 		 161 aa  148  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03924  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase) (Type II DHQase)  52.63 
 
 		 146 aa  147  4e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.252405  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0768  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 167 aa  147  5e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000317323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0200  3-dehydroquinate dehydratase  52.94 
 
 		 156 aa  147  5e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  51.49 
 
 		 150 aa  147  6e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2491  3-dehydroquinate dehydratase  51.06 
 
 		 147 aa  147  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254685  normal  0.906535 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0189  3-dehydroquinate dehydratase  52.21 
 
 		 156 aa  146  9e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0530  3-dehydroquinate dehydratase  52.11 
 
 		 145 aa  146  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0784  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 173 aa  145  1.0000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.559355  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  51.75 
 
 		 159 aa  145  1.0000000000000001e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1044  3-dehydroquinate dehydratase  53.52 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.983383  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0948  3-dehydroquinate dehydratase  54.14 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00455713  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0506  3-dehydroquinate dehydratase  51.41 
 
 		 145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0941  3-dehydroquinate dehydratase  52.7 
 
 		 178 aa  145  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  54.07 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0586  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0571  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0511  3-dehydroquinate dehydratase  54.48 
 
 		 144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3520  3-dehydroquinate dehydratase  54.48 
 
 		 144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002198  3-dehydroquinate dehydratase II  54.48 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0180031  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1896  3-dehydroquinate dehydratase  53.19 
 
 		 193 aa  144  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0482  3-dehydroquinate dehydratase  53.19 
 
 		 193 aa  144  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.644593  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  51.11 
 
 		 152 aa  144  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  53.28 
 
 		 151 aa  145  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1610  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 		 148 aa  144  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0468975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0045  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.94 
 
 		 144 aa  145  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152368  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0849  3-dehydroquinate dehydratase  53.19 
 
 		 151 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5032  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 151 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2207  3-dehydroquinate dehydratase  53.19 
 
 		 151 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  53.52 
 
 		 145 aa  144  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1753  3-dehydroquinate dehydratase  53.19 
 
 		 151 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111772  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0892  3-dehydroquinate dehydratase  53.19 
 
 		 151 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396481  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0512  3-dehydroquinate dehydratase  52.52 
 
 		 146 aa  144  5e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0246  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.09 
 
 		 156 aa  144  5e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04071  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 		 147 aa  144  5e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3348  3-dehydroquinate dehydratase  51.08 
 
 		 144 aa  144  5e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  51.05 
 
 		 162 aa  144  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0579  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 		 193 aa  144  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2893  3-dehydroquinate dehydratase  51.75 
 
 		 146 aa  143  6e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  52.08 
 
 		 193 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  51.43 
 
 		 142 aa  143  7.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1397  3-dehydroquinate dehydratase  50.34 
 
 		 154 aa  143  8.000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000192408  normal  0.601404 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3692  3-dehydroquinate dehydratase  52.52 
 
 		 150 aa  143  8.000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.526895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1476  3-dehydroquinate dehydratase  51.35 
 
 		 178 aa  143  8.000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.657033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3499  3-dehydroquinate dehydratase  51.06 
 
 		 207 aa  143  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3467  3-dehydroquinate dehydratase  51.09 
 
 		 149 aa  143  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5193  3-dehydroquinate dehydratase  51.82 
 
 		 151 aa  143  9e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  52.82 
 
 		 146 aa  143  9e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0421  3-dehydroquinate dehydratase  51.06 
 
 		 207 aa  143  9e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1505  3-dehydroquinate dehydratase  49.29 
 
 		 159 aa  143  9e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1280  3-dehydroquinate dehydratase  51.06 
 
 		 150 aa  142  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3798  3-dehydroquinate dehydratase  52.24 
 
 		 146 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000334533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3854  3-dehydroquinate dehydratase  52.24 
 
 		 146 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.31735  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0364  3-dehydroquinate dehydratase  48.25 
 
 		 159 aa  142  1e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0718569  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2500  3-dehydroquinate dehydratase  51.06 
 
 		 150 aa  142  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.263847  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4964  3-dehydroquinate dehydratase  51.09 
 
 		 151 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222066 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3464  3-dehydroquinate dehydratase  51.06 
 
 		 150 aa  142  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3980  3-dehydroquinate dehydratase  52.24 
 
 		 146 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3284  3-dehydroquinate dehydratase  51.06 
 
 		 150 aa  142  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2778  3-dehydroquinate dehydratase  51.77 
 
 		 150 aa  142  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2104  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 148 aa  142  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0230  3-dehydroquinate dehydratase  48.92 
 
 		 160 aa  142  1e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3502  3-dehydroquinate dehydratase  51.06 
 
 		 150 aa  142  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248237  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0470  3-dehydroquinate dehydratase  52.24 
 
 		 146 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000102213  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2834  3-dehydroquinate dehydratase  53.68 
 
 		 149 aa  142  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0506337  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2299  3-dehydroquinate dehydratase  47.97 
 
 		 159 aa  142  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.926726  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5304  3-dehydroquinate dehydratase  51.09 
 
 		 151 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0668  3-dehydroquinate dehydratase  53.73 
 
 		 156 aa  142  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0511  3-dehydroquinate dehydratase  53.73 
 
 		 144 aa  142  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>