More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2410 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2410  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
331 aa  679    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.488157  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5120  glycosyl transferase family 2  66.46 
 
 
323 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3181  glycosyl transferase family 2  62.31 
 
 
318 aa  416  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  58.36 
 
 
317 aa  392  1e-108  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3117  glycosyl transferase family 2  57.42 
 
 
315 aa  392  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11238  putative glycosyltransferase  61.31 
 
 
317 aa  394  1e-108  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1792  b-glycosyltransferase  59.63 
 
 
324 aa  392  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.794906 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0111  glycosyl transferase family protein  58.58 
 
 
318 aa  385  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375009  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2023  glycosyl transferase family 2  58.9 
 
 
314 aa  387  1e-106  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2716  glycosyl transferase family 2  50.95 
 
 
319 aa  346  3e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0506  glycosyl transferase  47.34 
 
 
332 aa  305  6e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641026  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2281  glycosyl transferase family 2  46.78 
 
 
337 aa  293  2e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0390263  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1980  glycosyl transferase family protein  44.07 
 
 
323 aa  275  6e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1880  glycosyl transferase family 2  43.67 
 
 
325 aa  272  6e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00309208 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1703  glycosyl transferase family 2  43.2 
 
 
331 aa  269  5.9999999999999995e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0429  glycosyl transferase  43.98 
 
 
328 aa  264  1e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.541189  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2496  glycosyltransferase  42.12 
 
 
313 aa  264  2e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00712188  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1767  glycosyl transferase family 2  46.1 
 
 
331 aa  263  3e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1340  glycosyl transferase family protein  42.5 
 
 
318 aa  263  4e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275627  normal  0.171595 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1158  glycosyl transferase family 2  40.8 
 
 
324 aa  262  6.999999999999999e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1442  glycosyl transferase family protein  42.31 
 
 
312 aa  248  1e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23431  glycosyl transferase family protein  41.42 
 
 
342 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1087  glycosyltransferase  40.51 
 
 
320 aa  239  5e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0203  glycosyl transferase family protein  39.93 
 
 
314 aa  238  8e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16431  glycosyl transferase family protein  39.94 
 
 
321 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.713365  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19621  glycosyl transferase family protein  40.19 
 
 
320 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.217021  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  39.14 
 
 
319 aa  234  1.0000000000000001e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17261  glycosyl transferase family protein  38.41 
 
 
320 aa  233  3e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.503177  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17141  glycosyl transferase family protein  38.74 
 
 
320 aa  233  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.517229  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0411  glycosyl transferase family protein  38.64 
 
 
343 aa  232  6e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0403  glycosyl transferase family 2  38.31 
 
 
343 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0339  glycosyl transferase family protein  37.34 
 
 
320 aa  231  9e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1989  glycosyl transferase family protein  37.34 
 
 
320 aa  231  2e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17011  glycosyl transferase family protein  36.77 
 
 
320 aa  229  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.553457  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0061  glycosyl transferase family 2  40.59 
 
 
336 aa  229  7e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3397  glycosyl transferase family protein  40.92 
 
 
337 aa  227  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1551  glycosyl transferase family 2  37.62 
 
 
324 aa  224  2e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000748201  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1614  glycosyl transferase family protein  37.74 
 
 
324 aa  221  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4237  glycosyl transferase family 2  39.27 
 
 
337 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  hitchhiker  0.0000633175 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1041  glycosyl transferase family 2  37.83 
 
 
368 aa  217  2.9999999999999998e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2657  family 2 glycosyl transferase  39.4 
 
 
329 aa  216  2.9999999999999998e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3516  glycosyl transferase family 2  35.83 
 
 
314 aa  216  4e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000921398 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3450  glycosyl transferase family 2  35.86 
 
 
314 aa  216  4e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0464  glycosyl transferase  35.53 
 
 
310 aa  212  5.999999999999999e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4095  glycosyl transferase family protein  41.37 
 
 
335 aa  212  7.999999999999999e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864702  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2286  glycosyl transferase family protein  36.57 
 
 
325 aa  211  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.398997  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2892  glycosyl transferase family protein  37.46 
 
 
329 aa  211  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0153758 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4415  glycosyl transferase family protein  39.41 
 
 
339 aa  209  6e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.645048 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0623  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.84 
 
 
316 aa  208  9e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1793  glycosyl transferase family 2  34.21 
 
 
313 aa  208  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3095  glycosyl transferase family 2  34.23 
 
 
341 aa  207  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4198  glycosyl transferase family protein  37.13 
 
 
358 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.797946  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4382  glycosyl transferase family 2  38.94 
 
 
336 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4444  glycosyl transferase family 2  38.94 
 
 
336 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.412924 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0445  glycosyl transferase family 2  34.87 
 
 
334 aa  207  3e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0359  glycosyl transferase family protein  38.67 
 
 
568 aa  206  6e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143693  normal  0.385412 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2754  glycosyl transferase family 2  36.51 
 
 
318 aa  205  8e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.412494  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1005  glycosyl transferase family protein  36.77 
 
 
344 aa  204  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3834  glycosyl transferase family protein  35.83 
 
 
314 aa  204  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2585  glycosyl transferase family protein  37.17 
 
 
316 aa  204  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0635  glycosyl transferase family 2  33.88 
 
 
310 aa  202  5e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0605  glycosyl transferase  33.44 
 
 
310 aa  202  9e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0228  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.86 
 
 
320 aa  198  9e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.421511  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0404  glycosyl transferase family 2  35.86 
 
 
320 aa  198  9e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0210127 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3622  glycosyl transferase family protein  35.18 
 
 
398 aa  197  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00095064 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0689  glycosyl transferase family protein  32.57 
 
 
312 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0955  glycosyl transferase family 2  33.12 
 
 
338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254585  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0656  glycosyl transferase family protein  34.74 
 
 
329 aa  196  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0760  glycosyl transferase family protein  39.07 
 
 
343 aa  192  5e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.057751 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2203  glycosyl transferase family 2  34.31 
 
 
315 aa  192  9e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3480  glycosyl transferase family protein  33.55 
 
 
336 aa  192  9e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.324933 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1671  glycosyl transferase family 2  33.22 
 
 
310 aa  192  9e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000135664  normal  0.123031 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1411  glycosyltransferase transmembrane protein  37.91 
 
 
302 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1106  glycosyl transferase family 2  33.44 
 
 
338 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.263485  normal  0.233647 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3114  glycosyl transferase family protein  35 
 
 
334 aa  189  8e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.482779  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1772  putative glycosyltransferase transmembrane protein  32.24 
 
 
347 aa  182  7e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.437602  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1596  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.56 
 
 
240 aa  164  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2553  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.24 
 
 
237 aa  161  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1174  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 
240 aa  160  3e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.254871 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2690  glycosyl transferase family protein  33.23 
 
 
337 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125609  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3151  glycosyl transferase family 2  36.84 
 
 
243 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0539097  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.91 
 
 
322 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1271  glycosyltransferase  36.77 
 
 
237 aa  152  8e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1832  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  30.32 
 
 
327 aa  151  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2078  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  30.94 
 
 
327 aa  151  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18360  putative glycosyl transferase  33.55 
 
 
339 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.70098  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02180  undecaprenyl phosphate-L-Ara4FN transferase  31.25 
 
 
322 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1404  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
322 aa  150  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2399  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.25 
 
 
322 aa  150  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.911848  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2549  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.25 
 
 
322 aa  151  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.25 
 
 
322 aa  150  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02139  hypothetical protein  31.25 
 
 
322 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2145  glycosyl transferase family 2  35.56 
 
 
249 aa  150  3e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0368252 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0280  glycosyl transferase family 2  32.58 
 
 
312 aa  150  3e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2611  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  30 
 
 
327 aa  150  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2842  glycosyl transferase family protein  33.55 
 
 
340 aa  149  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2155  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.31 
 
 
326 aa  150  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3696  glycosyl transferase family protein  31.95 
 
 
312 aa  149  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.785719  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2408  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  30.92 
 
 
322 aa  149  5e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1592  putative glycosyl transferase  33.55 
 
 
339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.357089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>