47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2373 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2373  hypothetical protein  100 
 
 		 619 aa  1244    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.651768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2831  hypothetical protein  35.7 
 
 		 605 aa  352  2e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1930  hypothetical protein  30 
 
 		 595 aa  261  3e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.171186  normal  0.0291599 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5660  hypothetical protein  28.66 
 
 		 588 aa  222  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4789  hypothetical protein  27.74 
 
 		 587 aa  219  1e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0838792  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3567  hypothetical protein  29.04 
 
 		 575 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.336155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3939  hypothetical protein  30.62 
 
 		 649 aa  193  7e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.462657  normal  0.150476 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3564  hypothetical protein  27.85 
 
 		 572 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1608  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.29 
 
 		 735 aa  127  7e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.435255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5664  hypothetical protein  30.29 
 
 		 382 aa  121  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1935  hypothetical protein  30.1 
 
 		 386 aa  97.1  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0240984 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0874  ICE-like protease  28.46 
 
 		 360 aa  76.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00749471  normal  0.127131 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7227  TonB-dependent receptor plug  25.41 
 
 		 875 aa  68.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0979  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.97 
 
 		 704 aa  65.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  22.98 
 
 		 1177 aa  63.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3693  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 881 aa  61.2  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000588542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0877  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.35 
 
 		 708 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111073  normal  0.182276 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0982  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.84 
 
 		 704 aa  58.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.819515  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  25.76 
 
 		 1102 aa  58.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  27.22 
 
 		 1109 aa  55.1  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  24.5 
 
 		 1154 aa  54.3  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  30.32 
 
 		 1127 aa  54.3  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1888  TonB-dependent receptor plug  23.5 
 
 		 1153 aa  53.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  27.27 
 
 		 1142 aa  51.6  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  23.86 
 
 		 1129 aa  50.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2764  TonB-dependent receptor plug  25.86 
 
 		 1103 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.533832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  29.32 
 
 		 1139 aa  50.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0305  TonB-dependent receptor plug  26.28 
 
 		 1219 aa  49.7  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.146192  hitchhiker  0.000760936 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  27.04 
 
 		 1154 aa  49.3  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  25.3 
 
 		 1142 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  24.24 
 
 		 1106 aa  48.5  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  22.36 
 
 		 1138 aa  48.5  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0659  hypothetical protein  26.32 
 
 		 888 aa  47.8  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0050  TonB-dependent receptor plug  28.69 
 
 		 902 aa  47.4  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  22.41 
 
 		 1166 aa  47.4  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4824  TonB-dependent receptor plug  24.5 
 
 		 1113 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00024385  hitchhiker  0.00000000773033 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  20.9 
 
 		 1144 aa  47  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2894  TonB-dependent receptor, plug  22.75 
 
 		 1237 aa  47  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.403551  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  25.39 
 
 		 1153 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  20.81 
 
 		 1148 aa  47  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0950  TonB-dependent receptor plug  24.1 
 
 		 1199 aa  46.6  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00543932  normal  0.368502 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  28 
 
 		 1179 aa  46.2  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  23.03 
 
 		 1116 aa  46.2  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3802  TonB-dependent receptor, plug  28.57 
 
 		 1211 aa  45.8  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  22.73 
 
 		 1152 aa  45.8  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  22.67 
 
 		 1097 aa  45.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  23.32 
 
 		 1102 aa  44.7  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>