More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2350 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  100 
 
 
220 aa  451  1e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5611  ABC transporter related  82.65 
 
 
220 aa  382  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650337  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0282  ABC transporter, ATP-binding protein  60.73 
 
 
223 aa  282  2e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  56.16 
 
 
234 aa  263  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_002950  PG0685  ABC transporter, ATP-binding protein  56.94 
 
 
219 aa  263  2e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246956 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  56.48 
 
 
225 aa  261  7e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4701  ABC transporter, ATP-binding protein  55.09 
 
 
230 aa  259  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4589  ABC transporter related protein  56.16 
 
 
225 aa  259  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00504379  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0329  putative ABC transport system, ATP-binding protein  55.09 
 
 
226 aa  257  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.292409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0367  ABC transporter, ATPase subunit  55 
 
 
240 aa  257  1e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0956  ABC transporter related  54.34 
 
 
229 aa  254  7e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4838  ABC transporter related  55.56 
 
 
225 aa  254  9e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3364  ABC transporter related  53.7 
 
 
243 aa  253  1e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0080  ABC transporter related  55 
 
 
235 aa  253  2e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.348241  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  54.63 
 
 
246 aa  253  2e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0573  ABC transporter, ATP-binding protein  53.7 
 
 
253 aa  252  3e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0095  ABC transporter related  55.45 
 
 
235 aa  252  4e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  57.41 
 
 
242 aa  251  5e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2864  ABC transporter related  52.78 
 
 
230 aa  250  9e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  55.56 
 
 
225 aa  250  1e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3501  ABC transporter related  52.31 
 
 
241 aa  250  1e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0898  ABC transporter related  52.78 
 
 
232 aa  249  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0308  ABC transporter ATP-binding protein  54.84 
 
 
237 aa  249  2e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0332817 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2850  ABC transporter related  53.7 
 
 
240 aa  249  3e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0723  ABC transporter-related protein  53.24 
 
 
240 aa  248  4e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2991  ABC transporter related  52.31 
 
 
246 aa  247  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1031  ABC transporter related  51.85 
 
 
246 aa  247  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3341  ABC transporter related  51.85 
 
 
247 aa  246  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1019  ABC transporter related  51.85 
 
 
247 aa  246  2e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0998  ABC transporter related  51.85 
 
 
247 aa  246  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1330  ABC transporter related  53.92 
 
 
235 aa  245  3e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.514657  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  53.24 
 
 
242 aa  244  6e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3692  ABC transporter, ATP-binding protein  51.85 
 
 
246 aa  243  1e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3159  ABC transporter related  51.85 
 
 
246 aa  243  2e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3260  ABC transporter related  51.85 
 
 
246 aa  243  2e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0863  ABC transporter related  51.85 
 
 
246 aa  243  2e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3722  ABC transporter related  51.85 
 
 
263 aa  243  2e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.323053 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  51.39 
 
 
237 aa  243  2e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  53.7 
 
 
230 aa  243  2e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  4.35089e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4072  ABC transporter related  51.39 
 
 
253 aa  242  3e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2406  ABC transporter related  52.31 
 
 
247 aa  241  7e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  52.05 
 
 
233 aa  240  1e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  53.24 
 
 
244 aa  239  3e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  52.05 
 
 
239 aa  239  3e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  51.39 
 
 
260 aa  238  7e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  50.93 
 
 
238 aa  236  1e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2119  ABC transporter, ATP-binding protein  58.06 
 
 
241 aa  236  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2239  ABC transporter related  51.64 
 
 
233 aa  236  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  50.46 
 
 
237 aa  236  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  53.24 
 
 
239 aa  236  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  49.55 
 
 
238 aa  235  3e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  52.78 
 
 
232 aa  235  4e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  50.69 
 
 
235 aa  235  4e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  50.93 
 
 
228 aa  234  5e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  50.91 
 
 
233 aa  233  1e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  50 
 
 
236 aa  233  1e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  50 
 
 
248 aa  233  1e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  50.46 
 
 
228 aa  233  1e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  50.93 
 
 
229 aa  234  1e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0471  ABC transporter related  51.39 
 
 
236 aa  233  2e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2827  ABC transporter-like protein protein  52.05 
 
 
254 aa  232  3e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  52.53 
 
 
230 aa  231  4e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04961  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 
228 aa  231  5e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2811  ABC transporter, ATP-binding protein  53.42 
 
 
223 aa  231  5e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0179867  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2199  ABC transporter, ATP-binding protein  53.88 
 
 
221 aa  231  5e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517578  hitchhiker  1.1345e-09 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  49.31 
 
 
227 aa  231  6e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1635  ABC transporter related  51.39 
 
 
229 aa  231  9e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2600  ABC transporter related  50 
 
 
227 aa  231  9e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  50.46 
 
 
230 aa  230  1e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3064  ABC transporter, ATP-binding protein  53.42 
 
 
227 aa  230  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  50.46 
 
 
244 aa  230  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  50.46 
 
 
253 aa  230  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  51.39 
 
 
658 aa  229  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2837  ABC transporter ATP-binding protein  53.42 
 
 
223 aa  229  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000357321  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3052  ABC transporter ATP-binding protein  53.42 
 
 
223 aa  229  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  50.68 
 
 
252 aa  229  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2771  ABC transporter, ATP-binding protein  53.42 
 
 
223 aa  229  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  49.54 
 
 
226 aa  229  3e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 
224 aa  228  4e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 
224 aa  228  4e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0747  ABC transporter related  50 
 
 
221 aa  228  5e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  50.93 
 
 
224 aa  228  6e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3506  ABC transporter, ATP-binding protein  52.78 
 
 
238 aa  228  6e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  49.54 
 
 
231 aa  228  6e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 
224 aa  227  8e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  49.54 
 
 
247 aa  227  9e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  49.54 
 
 
266 aa  227  9e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3083  ABC transporter, ATP-binding protein  53.42 
 
 
223 aa  227  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.760416  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 
224 aa  227  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  50.69 
 
 
255 aa  226  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  49.07 
 
 
253 aa  226  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  48.86 
 
 
224 aa  226  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  48.86 
 
 
224 aa  226  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  48.86 
 
 
224 aa  226  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0254  ABC transporter related  51.39 
 
 
241 aa  226  2e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  46.76 
 
 
291 aa  226  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  51.85 
 
 
241 aa  226  2e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
232 aa  225  3e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  52.79 
 
 
228 aa  225  3e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  48.85 
 
 
235 aa  225  3e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>