21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2329 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2329  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 		 343 aa  706    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000753035  normal  0.46134 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1512  glycoside hydrolase family 43  69.11 
 
 		 335 aa  468  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.416427 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3207  glycoside hydrolase family protein  36.13 
 
 		 337 aa  187  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.392595  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2371  glycoside hydrolase family 43  37.97 
 
 		 293 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1366  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.77 
 
 		 648 aa  178  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2654  glycoside hydrolase family 43  36.65 
 
 		 299 aa  147  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.435311  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  23.92 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  30.73 
 
 		 393 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3109  glycoside hydrolase family protein  24.48 
 
 		 348 aa  60.1  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  29.06 
 
 		 384 aa  59.7  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  24.43 
 
 		 540 aa  49.7  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  24.76 
 
 		 535 aa  49.7  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  25.57 
 
 		 545 aa  48.5  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  26.8 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  26.46 
 
 		 512 aa  47.8  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  20.15 
 
 		 464 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 		 636 aa  44.3  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  24.77 
 
 		 401 aa  43.9  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  24.48 
 
 		 537 aa  43.9  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  26.35 
 
 		 495 aa  42.7  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2047  glycoside hydrolase family protein  24.73 
 
 		 1112 aa  42.7  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000114958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>