23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2270 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2270  hypothetical protein  100 
 
 		 464 aa  948    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.328627  normal  0.114175 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3372  hypothetical protein  40.63 
 
 		 455 aa  357  2.9999999999999997e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.315393 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2584  hypothetical protein  24.04 
 
 		 446 aa  175  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000463942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0278  hypothetical protein  22.56 
 
 		 483 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1383  hypothetical protein  21.54 
 
 		 487 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229216  normal  0.586845 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1235  hypothetical protein  25.49 
 
 		 488 aa  136  9e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.212609  normal  0.0713151 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1366  hypothetical protein  24.93 
 
 		 481 aa  132  9e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0126  hypothetical protein  22.79 
 
 		 454 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0255441  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1664  hypothetical protein  24.72 
 
 		 484 aa  125  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0854698  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1274  hypothetical protein  23.89 
 
 		 492 aa  110  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000354045  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1393  hypothetical protein  21.04 
 
 		 495 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000104621  hitchhiker  0.000142618 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1196  hypothetical protein  23.81 
 
 		 417 aa  107  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3082  hypothetical protein  23.06 
 
 		 417 aa  107  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0210  hypothetical protein  23.21 
 
 		 444 aa  107  6e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2797  hypothetical protein  22.87 
 
 		 428 aa  101  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91225  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1666  hypothetical protein  20.69 
 
 		 468 aa  88.6  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0504  hypothetical protein  22.14 
 
 		 451 aa  83.2  0.000000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2721  hypothetical protein  22.97 
 
 		 489 aa  70.1  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1964  hypothetical protein  24.33 
 
 		 511 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.611513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4086  hypothetical protein  22.66 
 
 		 520 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0146157  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2169  hypothetical protein  24.59 
 
 		 513 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.992488 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3425  hypothetical protein  21 
 
 		 511 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.955641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2886  hypothetical protein  21.02 
 
 		 518 aa  44.7  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.770972  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>