More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2203 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2203  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 285 aa  583  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0328064 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0638  transcriptional regulator, AraC family  40.34 
 
 		 377 aa  106  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6150  transcriptional regulator, AraC family  33.55 
 
 		 381 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2274  AraC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 392 aa  94.7  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.567279 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3025  AraC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 390 aa  93.6  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000202158 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3167  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 406 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2495  AraC family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 379 aa  89.7  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.939158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2999  response regulator receiver/GGDEF/EAL domain-containing protein  33.33 
 
 		 404 aa  88.2  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000288968 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2599  transcriptional regulator, AraC family  37.9 
 
 		 373 aa  88.2  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2928  AraC family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 390 aa  87.8  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3057  AraC family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 389 aa  87.8  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161665  normal  0.0111828 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2491  response regulator receiver protein  32.65 
 
 		 379 aa  87  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00299433  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1391  AraC family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 379 aa  86.3  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2491  AraC family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 385 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4331  transcriptional regulator, AraC family  31.01 
 
 		 371 aa  84.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248399  normal  0.118283 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1306  transcriptional regulator, AraC family  43.01 
 
 		 390 aa  84.3  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3808  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1285  helix-turn-helix domain-containing protein  41.94 
 
 		 379 aa  82.8  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112275  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0802  AraC family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0633  transcriptional regulator, AraC family  38 
 
 		 362 aa  80.1  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.311928  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3234  helix-turn-helix domain-containing protein  41.94 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3410  transcriptional regulator, AraC family  39.77 
 
 		 359 aa  79  0.00000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.493578  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3165  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  34.41 
 
 		 389 aa  79  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1287  AraC family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 368 aa  78.6  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.537021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4113  transcriptional regulator, AraC family  33.93 
 
 		 375 aa  77.8  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.197438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1555  AraC family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.294968  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2262  transcriptional regulator, AraC family  32.74 
 
 		 335 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1634  AraC family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 380 aa  77  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3101  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30 
 
 		 389 aa  75.5  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.866891  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3858  AraC family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 393 aa  75.5  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0538  helix-turn-helix domain-containing protein  36.56 
 
 		 353 aa  74.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.214837  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2584  transcriptional regulator, AraC family  36.21 
 
 		 357 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160731  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0879  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 363 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1550  AraC family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 383 aa  73.2  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000434853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0312  AraC/XylS family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 347 aa  72.8  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0426  helix-turn-helix domain-containing protein  28.23 
 
 		 349 aa  72.4  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0607795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3809  transcriptional regulator, AraC family  32.12 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0920  AraC family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100818  normal  0.609356 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2407  transcriptional regulator, AraC family  29.57 
 
 		 399 aa  69.3  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.411749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0018  AraC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 358 aa  69.3  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2170  helix-turn-helix, AraC type  34.04 
 
 		 328 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0135  AraC family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0106255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0841  AraC family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 392 aa  68.2  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.271665 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3153  AraC family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 364 aa  67.4  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0537  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 349 aa  67.8  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.379134  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1276  transcriptional regulator AraC family  29.27 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0404  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 399 aa  67.8  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0906  helix-turn-helix domain-containing protein  29.46 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.472278 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1038  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  35.48 
 
 		 394 aa  66.2  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal  0.923131 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2612  AraC family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 349 aa  66.6  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3712  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 337 aa  65.9  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.660721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4302  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 269 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0876  AraC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00939857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3986  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  33.33 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.542106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0732  AraC family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.576299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0692  transcriptional regulator, AraC family  36.17 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3336  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 367 aa  62.8  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1147  response regulator receiver protein  30.19 
 
 		 397 aa  62.4  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2366  AraC family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 370 aa  62.4  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0180  AraC family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 378 aa  61.6  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.34579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4415  AraC family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.0031509  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0106  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  36.47 
 
 		 394 aa  60.5  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0664  AraC family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 422 aa  60.8  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  30.83 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00465  transcriptional regulator  36.78 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  30.83 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2982  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  24.78 
 
 		 398 aa  59.7  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  34 
 
 		 538 aa  59.7  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 1201 aa  59.7  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6144  transcriptional regulator, AraC family  32.95 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1109  hypothetical protein  26.56 
 
 		 352 aa  59.7  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0324  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 383 aa  59.3  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.645662 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2674  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100791 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4074  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.63505 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2642  transcriptional regulator, AraC family  30.09 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0027  transcriptional regulator, AraC family  37.08 
 
 		 412 aa  57  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2515  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  36.67 
 
 		 250 aa  57  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4301  transcriptional regulator, AraC family  45.16 
 
 		 286 aa  57  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220521  normal  0.797318 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2734  AraC family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 764 aa  56.6  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000030307  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10940  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 319 aa  57  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.725025  normal  0.984185 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0142  transcriptional regulator, AraC family  31.03 
 
 		 760 aa  57  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1004  putative transcriptional regulator  34.38 
 
 		 319 aa  57  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0134  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5587  transcriptional regulator, AraC family  34.44 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.425806  normal  0.825086 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  31.11 
 
 		 537 aa  56.2  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1772  transcriptional regulator, AraC family  32.95 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 338 aa  55.8  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19910  response regulator receiver protein  28.26 
 
 		 386 aa  55.8  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3159  AraC family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3782  AraC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0502919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4147  transcriptional regulator, AraC family  25.89 
 
 		 438 aa  55.8  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  normal  0.311664 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3787  transcriptional regulator  28 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1891  transcriptional regulator, AraC family  30.34 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0883  AraC family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 322 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4378  transcriptional regulator, AraC family  32.94 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0103943  hitchhiker  0.00146244 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3182  AraC family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000265571 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4952  helix-turn-helix domain-containing protein  27 
 
 		 292 aa  55.5  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017601  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5462  AraC family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 319 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139699 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>