More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2186 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
248 aa  504  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0361624 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.89 
 
 
248 aa  343  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154391  normal  0.241568 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.45 
 
 
253 aa  331  6e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3335  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.13 
 
 
246 aa  306  2.0000000000000002e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.68 
 
 
246 aa  293  2e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.809389  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.22 
 
 
252 aa  280  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2238  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.06 
 
 
317 aa  277  1e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.68 
 
 
247 aa  272  3e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.269971  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.56 
 
 
264 aa  270  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.76 
 
 
247 aa  270  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01927  putative oxidoreductase  53.82 
 
 
252 aa  266  2e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.160278  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.47 
 
 
244 aa  258  7e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365065 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.47 
 
 
244 aa  258  7e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.48 
 
 
244 aa  257  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.78 
 
 
240 aa  255  4e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148916  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0112  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.83 
 
 
244 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2470  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.26 
 
 
244 aa  249  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3907  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.21 
 
 
246 aa  249  4e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.267776 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1627  oxidoreductase  51.21 
 
 
255 aa  249  4e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4845  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.4 
 
 
252 aa  248  5e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.61 
 
 
245 aa  248  5e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.553727  normal  0.0273902 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.44 
 
 
245 aa  248  7e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2737  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.85 
 
 
245 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.51 
 
 
244 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.28 
 
 
244 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0125509  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
244 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.44 
 
 
245 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.880926  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.42 
 
 
240 aa  228  5e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  0.684579 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2416  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.46 
 
 
255 aa  228  8e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0691518 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.36 
 
 
246 aa  226  3e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0323  clavaldehyde dehydrogenase  50.2 
 
 
245 aa  224  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.869868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5731  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
246 aa  221  6e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.836966 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.36 
 
 
245 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.31 
 
 
246 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.83 
 
 
247 aa  218  5e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.248634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0179  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.83 
 
 
247 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0188  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.83 
 
 
247 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.212596  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.86 
 
 
246 aa  218  8.999999999999998e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1575  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.86 
 
 
246 aa  218  8.999999999999998e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0588  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.06 
 
 
247 aa  216  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.622721  normal  0.233653 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2185  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.47 
 
 
237 aa  214  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.756927  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.12 
 
 
248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.172179  normal  0.840489 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0635  putative short-chain dehydrogenase/reductase  49 
 
 
246 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.660542  normal  0.0297002 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4636  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.67 
 
 
254 aa  207  9e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.08 
 
 
248 aa  206  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297747  hitchhiker  0.00314525 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.12 
 
 
249 aa  201  7e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1086  Short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity  43.21 
 
 
247 aa  201  8e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.144372  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4325  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.04 
 
 
241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4057  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 
239 aa  196  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4141  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.53 
 
 
243 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000420  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  44.44 
 
 
239 aa  194  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.637186  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05303  oxidoreductase  44.44 
 
 
239 aa  194  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 
246 aa  193  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0101774  normal  0.961149 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4937  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.91 
 
 
239 aa  194  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.396795  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 
239 aa  192  5e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
243 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.853199  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.57 
 
 
243 aa  189  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.39 
 
 
252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 
247 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.340445  normal  0.365193 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
249 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410897  normal  0.168063 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.82 
 
 
259 aa  186  3e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.62 
 
 
239 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0184  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.49 
 
 
239 aa  181  7e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33490  short-chain alcohol dehydrogenase  38.46 
 
 
247 aa  181  7e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.343117  normal  0.392445 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05318  hypothetical protein similar to nonribosomal peptide synthetase 10 (Broad)  40.16 
 
 
1270 aa  181  1e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.556036  normal  0.849429 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0676  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
254 aa  179  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00917144  normal  0.0792915 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2243  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.81 
 
 
184 aa  175  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000317715  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0362  hypothetical protein  37.4 
 
 
257 aa  174  8e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0338  hypothetical protein  37.4 
 
 
257 aa  174  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41 
 
 
242 aa  174  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.186526  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0916  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.15 
 
 
246 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.41 
 
 
230 aa  171  6.999999999999999e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.07 
 
 
256 aa  170  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.27 
 
 
255 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
258 aa  168  7e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
261 aa  168  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268545  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2888  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
257 aa  166  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0119499 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1571  Short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity  38.17 
 
 
243 aa  167  2e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06330  oxidoreductase  36.89 
 
 
243 aa  166  2.9999999999999998e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.646831  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47104  non ribosomal peptide synthase  36.18 
 
 
1367 aa  166  4e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.08 
 
 
231 aa  166  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.08 
 
 
231 aa  166  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.459049  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.46 
 
 
243 aa  164  9e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.138701 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1841  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.43 
 
 
250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00165114  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0951  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.27 
 
 
261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 
254 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.495407 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206138  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2461  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.8 
 
 
242 aa  161  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.162516  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
239 aa  159  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.785555  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0250  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.45 
 
 
240 aa  159  4e-38  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.183431  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3769  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.85 
 
 
247 aa  157  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.13 
 
 
261 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0676  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.58 
 
 
253 aa  156  2e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.153885 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.31 
 
 
239 aa  156  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.175599  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.84 
 
 
241 aa  156  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 
258 aa  155  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3922  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 
250 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4316  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 
267 aa  155  7e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.691417  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.17 
 
 
249 aa  154  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.863639  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.17 
 
 
253 aa  152  4e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.542817  normal  0.89387 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>