More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2149 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2149  monooxygenase FAD-binding protein  100 
 
 
391 aa  804    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.438269  normal  0.289576 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1494  monooxygenase, FAD-binding  26.54 
 
 
386 aa  133  6e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.379752  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2957  monooxygenase FAD-binding  22.73 
 
 
372 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.00000079656 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5341  monooxygenase FAD-binding protein  27.99 
 
 
418 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1462  monooxygenase FAD-binding  24.93 
 
 
390 aa  119  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000001589  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2036  monooxygenase FAD-binding  24.78 
 
 
388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1142  monooxygenase FAD-binding  25.82 
 
 
388 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000665044 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4094  FAD dependent oxidoreductase  27.62 
 
 
413 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.232539  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3892  monooxygenase FAD-binding protein  26.3 
 
 
396 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.116118  normal  0.359829 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4615  monooxygenase FAD-binding  25.48 
 
 
392 aa  112  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.992897  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1253  monooxygenase, FAD-binding  25.2 
 
 
388 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420129  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5899  monooxygenase FAD-binding  22.54 
 
 
398 aa  111  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196665 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2360  monooxygenase, FAD-binding protein  25.21 
 
 
400 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.175962  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0387  monooxygenase FAD-binding  25.74 
 
 
402 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2407  monooxygenase, FAD-binding  25.21 
 
 
400 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.254272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2496  putative oxidoreductase  24.54 
 
 
374 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5767  putative oxidoreductase transmembrane protein  25.41 
 
 
405 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117987  normal  0.249872 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2401  monooxygenase, FAD-binding  24.72 
 
 
400 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.236058 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01821  FAD-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07040)  24.46 
 
 
423 aa  106  8e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00520599  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5557  monooxygenase FAD-binding protein  24.8 
 
 
371 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0724  monooxygenase FAD-binding  22.47 
 
 
408 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.30015 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4777  monooxygenase FAD-binding protein  24.8 
 
 
496 aa  104  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.712751  hitchhiker  0.00463722 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10960  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  22.45 
 
 
403 aa  103  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4249  monooxygenase FAD-binding  24.23 
 
 
370 aa  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2116  monooxygenase FAD-binding protein  23.31 
 
 
384 aa  102  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.400145  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2729  hypothetical protein  24.53 
 
 
415 aa  102  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3917  putative oxidoreductase  22.71 
 
 
397 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280043  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4701  putative oxidoreductase transmembrane protein  25.86 
 
 
381 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105263  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7487  putative oxidoreductase  21.48 
 
 
399 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0093  flavoprotein monooxygenase  25 
 
 
467 aa  101  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  23.71 
 
 
395 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  22.96 
 
 
402 aa  97.8  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2471  monooxygenase FAD-binding  24.78 
 
 
373 aa  95.5  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5927  monooxygenase FAD-binding protein  25 
 
 
400 aa  95.5  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11286  hypothetical protein  23.71 
 
 
372 aa  93.6  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1784  monooxygenase, FAD-binding  24 
 
 
410 aa  93.2  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0549  monooxygenase FAD-binding  22.07 
 
 
380 aa  92.8  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.554692  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2022  putative oxidoreductase  21.98 
 
 
407 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.461121  normal  0.126773 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  26.96 
 
 
397 aa  91.7  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  23.71 
 
 
384 aa  92  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5428  hypothetical protein  21.41 
 
 
394 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235903 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3990  monooxygenase FAD-binding  22.65 
 
 
415 aa  90.9  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  24.65 
 
 
388 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1265  monooxygenase FAD-binding protein  23.58 
 
 
396 aa  90.1  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.717662  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0125  monooxygenase FAD-binding  25.47 
 
 
374 aa  88.2  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4470  FAD dependent oxidoreductase  24.08 
 
 
371 aa  88.6  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0067  monooxygenase FAD-binding protein  24.11 
 
 
400 aa  88.6  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0135  monooxygenase FAD-binding  22.28 
 
 
400 aa  87.8  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28690  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  23.25 
 
 
387 aa  85.5  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1283  monooxygenase FAD-binding protein  20.15 
 
 
403 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000514503 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1730  monooxygenase, FAD-binding  24.04 
 
 
395 aa  85.5  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.569431  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2424  monooxygenase FAD-binding protein  22.03 
 
 
393 aa  84  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.127723  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  24.05 
 
 
360 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  24.05 
 
 
364 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  23.75 
 
 
364 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1528  monooxygenase FAD-binding  23.93 
 
 
362 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.392805  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10585  hypothetical protein  20.66 
 
 
388 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000190201  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  23.66 
 
 
403 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4339  monooxygenase FAD-binding  23.01 
 
 
434 aa  80.9  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  24.92 
 
 
392 aa  80.5  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7249  monooxygenase FAD-binding  22.01 
 
 
377 aa  79.7  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  22.75 
 
 
373 aa  79.7  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3224  monooxygenase FAD-binding  25.48 
 
 
399 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26790  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  22.93 
 
 
398 aa  78.6  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15237  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8153  monooxygenase FAD-binding protein  21.92 
 
 
424 aa  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1977  monooxygenase FAD-binding protein  24.85 
 
 
393 aa  77.4  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000420901  unclonable  0.000000044053 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3006  monooxygenase FAD-binding protein  23.97 
 
 
404 aa  77.4  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00211074 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2591  hypothetical protein  22.25 
 
 
389 aa  77  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000360209  hitchhiker  0.000709187 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3960  monooxygenase, FAD-binding  23.44 
 
 
388 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06742  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00590)  22.11 
 
 
697 aa  76.3  0.0000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00748094 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  21.11 
 
 
421 aa  75.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2779  monooxygenase FAD-binding  23.14 
 
 
411 aa  75.5  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0421282 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  21.31 
 
 
378 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0950  monooxygenase, FAD-binding  22.62 
 
 
368 aa  75.1  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0762  monooxygenase FAD-binding  23.19 
 
 
421 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121092 
 
 
-
 
NC_004310  BR0960  monooxygenase, FAD-binding  22.32 
 
 
368 aa  74.7  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234631  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5335  FAD-dependent monooxygenase  22.29 
 
 
378 aa  73.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  22.7 
 
 
379 aa  74.3  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0299  monooxygenase  24.08 
 
 
351 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  23.01 
 
 
388 aa  73.6  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2318  monooxygenase FAD-binding  23.67 
 
 
385 aa  73.6  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  25.45 
 
 
404 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4891  monooxygenase, FAD-binding  25.29 
 
 
402 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  22.47 
 
 
398 aa  72.8  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5197  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  25.82 
 
 
407 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0385  hypothetical protein  20.33 
 
 
391 aa  72  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  23.78 
 
 
369 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5022  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  24.55 
 
 
407 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  25.45 
 
 
422 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  20.7 
 
 
377 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  24.55 
 
 
400 aa  70.5  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  23.64 
 
 
371 aa  70.1  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  22.4 
 
 
377 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  24.74 
 
 
404 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  23.82 
 
 
377 aa  69.7  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5104  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  25.57 
 
 
407 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.447652  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4355  hypothetical protein  22.91 
 
 
421 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0233973  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  22.08 
 
 
396 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09230  conserved hypothetical protein  22.34 
 
 
566 aa  68.9  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_1611  zeaxanthin epoxidase (ABA1) (NPQ2)  22.7 
 
 
429 aa  68.6  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.539309  normal  0.0529961 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>