41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2146 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2146  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 211 aa  436  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.756264  normal  0.322548 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2643  MarR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 211 aa  94.7  9e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4547  transcriptional regulator, MarR family  21.59 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.294634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2094  regulatory protein MarR  26.2 
 
 		 219 aa  62  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0118468 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 156 aa  52  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 		 149 aa  52  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2313  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 157 aa  50.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 145 aa  49.3  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4279  transcriptional regulator, MarR family  29.31 
 
 		 161 aa  48.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0560787 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 		 159 aa  45.8  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 172 aa  45.1  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 157 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3314  transcriptional regulator, MarR family  26.09 
 
 		 138 aa  45.1  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3344  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 138 aa  45.1  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3321  transcriptional regulator, MarR family  26.09 
 
 		 138 aa  45.1  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1928  transcriptional regulator, MarR family  26.09 
 
 		 138 aa  45.1  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.428879 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3304  transcriptional regulator, MarR family  26.09 
 
 		 138 aa  45.1  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3099  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 144 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.634884  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4956  transcriptional regulator, MarR family  31.37 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0148893  normal  0.105583 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2996  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 144 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000177119  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3085  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 144 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.729277  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3308  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 138 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1265  transcriptional regulator, MarR family  32.86 
 
 		 146 aa  43.5  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3012  MarR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 139 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135712  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0389  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 155 aa  43.1  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502293  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2725  putative transcription regulator protein  37.25 
 
 		 157 aa  42.7  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.612085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 148 aa  42.7  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1196  MarR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 141 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1179  MarR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 141 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.317868  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 151 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 151 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 150 aa  42.4  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  31.31 
 
 		 151 aa  42  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 153 aa  42  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 151 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0020  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 234 aa  42  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.965636 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0953  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 144 aa  42  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1206  MarR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 141 aa  41.6  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.500506  normal  0.0194653 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 162 aa  41.6  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 145 aa  41.2  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>