76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2145 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2145  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
477 aa  999    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2979  alpha/beta hydrolase fold protein  40.13 
 
 
480 aa  349  7e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.171473 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0270  TAP domain-containing protein  28.08 
 
 
670 aa  147  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.948991  hitchhiker  0.000175368 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3206  TAP domain-containing protein  25.8 
 
 
475 aa  139  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812713  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2538  TAP domain-containing protein  25.17 
 
 
693 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112565 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2826  TAP domain-containing protein  24.19 
 
 
688 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000578424  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0265  TAP domain-containing protein  25.11 
 
 
669 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441544  normal  0.0338675 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0057  TAP domain-containing protein  25.78 
 
 
546 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3874  TAP domain protein  23.5 
 
 
508 aa  110  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2321  TAP domain-containing protein  26.61 
 
 
612 aa  109  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279811  normal  0.349466 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3647  alpha/beta fold family hydrolase  24.43 
 
 
680 aa  104  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0071  alpha/beta fold family hydrolase  25.12 
 
 
539 aa  104  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0076  TAP domain-containing protein  23.43 
 
 
549 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0071  TAP domain-containing protein  23.43 
 
 
538 aa  103  9e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0072  TAP domain-containing protein  24.77 
 
 
535 aa  103  9e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0073  TAP domain protein  23.19 
 
 
545 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4278  TAP domain-containing protein  23.43 
 
 
540 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3575  alpha/beta fold family hydrolase  23.21 
 
 
507 aa  102  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0079  TAP domain-containing protein  24.58 
 
 
485 aa  101  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3780  TAP domain-containing protein  23.13 
 
 
517 aa  102  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0123  TAP domain protein  26 
 
 
656 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0074  TAP domain-containing protein  24.88 
 
 
535 aa  101  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.523955 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0076  TAP domain-containing protein  24.3 
 
 
539 aa  101  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000458817 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4190  TAP domain-containing protein  22.6 
 
 
519 aa  100  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4460  TAP domain-containing protein  20.81 
 
 
533 aa  99.8  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.726615 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0068  peptidase S33, prolyl aminopeptidase  25.71 
 
 
521 aa  99  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1502  proteinase  23.45 
 
 
513 aa  97.4  5e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  32.42 
 
 
740 aa  95.5  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02798  cysteine proteinase  22.42 
 
 
533 aa  90.5  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1447  TAP domain-containing protein  22.1 
 
 
511 aa  88.2  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2103  alpha/beta hydrolase fold  24.66 
 
 
645 aa  86.3  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418615  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3977  TAP domain-containing protein  22.84 
 
 
532 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.692071  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0147  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 
668 aa  85.1  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.557879  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4864  TAP domain-containing protein  20.1 
 
 
527 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0722  alpha/beta fold family hydrolase  22.97 
 
 
480 aa  79.7  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3801  cysteine proteinase  23.24 
 
 
502 aa  78.6  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0118  alpha/beta hydrolase fold  21.68 
 
 
503 aa  67.8  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742968  normal  0.120342 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2774  hypothetical protein  67.39 
 
 
45 aa  61.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  24.43 
 
 
520 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2331  putative protease  26.94 
 
 
300 aa  58.2  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  22.94 
 
 
533 aa  56.6  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  22.94 
 
 
508 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  22.94 
 
 
508 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3616  TAP domain protein  25.69 
 
 
546 aa  55.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812667  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  21.87 
 
 
511 aa  53.9  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  21.87 
 
 
511 aa  53.9  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  21.87 
 
 
511 aa  53.9  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0998  alpha/beta hydrolase fold protein  25.87 
 
 
675 aa  53.5  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  25.14 
 
 
521 aa  52.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  24.74 
 
 
515 aa  52.8  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  20.62 
 
 
476 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3464  TAP domain-containing protein  26.52 
 
 
527 aa  51.6  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660985  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7397  TAP domain-containing protein  23.7 
 
 
613 aa  51.2  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312183  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4973  TAP domain protein  27.36 
 
 
522 aa  50.1  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39691  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1042  TAP domain-containing protein  24.27 
 
 
535 aa  50.1  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0225624 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  21.56 
 
 
505 aa  50.1  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4357  TAP domain-containing protein  22.58 
 
 
504 aa  49.3  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619924  normal  0.129935 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  22.88 
 
 
504 aa  49.7  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  20.22 
 
 
520 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1192  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
490 aa  48.9  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0438  TAP domain protein  24.24 
 
 
542 aa  48.9  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.574551  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  20.86 
 
 
564 aa  48.5  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  22.87 
 
 
516 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  24.69 
 
 
505 aa  47.8  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000258971  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  25.79 
 
 
508 aa  47.8  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  21.93 
 
 
495 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00753  nuclear segregation protein (Bfr1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14120)  26.97 
 
 
484 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.119324  normal  0.769842 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0841  TAP domain protein  23.76 
 
 
521 aa  45.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127306 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0185  TAP domain protein  22.65 
 
 
551 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.696189  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  23.1 
 
 
505 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3345  TAP domain-containing protein  24.89 
 
 
532 aa  44.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0319674  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1545  TAP domain-containing protein  21.43 
 
 
542 aa  45.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1488  TAP domain-containing protein  21.78 
 
 
522 aa  45.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026814 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  23.62 
 
 
546 aa  43.5  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1065  TAP domain protein  22.27 
 
 
544 aa  43.9  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  26.98 
 
 
540 aa  43.5  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.974168 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>