128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2108 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2108  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 		 650 aa  1339    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000141623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  47.25 
 
 		 1474 aa  580  1e-164  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  37.9 
 
 		 797 aa  424  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  29.06 
 
 		 512 aa  160  5e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  24.06 
 
 		 746 aa  159  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  28.84 
 
 		 572 aa  154  5e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  30.89 
 
 		 636 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3718  glycoside hydrolase family protein  30.86 
 
 		 504 aa  148  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  26.89 
 
 		 516 aa  146  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  27.8 
 
 		 536 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  28.8 
 
 		 519 aa  138  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.56 
 
 		 558 aa  137  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  26.07 
 
 		 532 aa  137  5e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0842  Alpha-L-arabinofuranosidase  24.74 
 
 		 546 aa  134  6e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.122484  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.39 
 
 		 538 aa  133  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  28.57 
 
 		 562 aa  133  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3398  glycoside hydrolase family protein  26.52 
 
 		 514 aa  131  5.0000000000000004e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740676  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  28.63 
 
 		 1195 aa  130  6e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1710  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.5 
 
 		 541 aa  130  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2409  hypothetical protein  25 
 
 		 541 aa  125  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  29.54 
 
 		 551 aa  125  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  24.48 
 
 		 523 aa  122  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  30.03 
 
 		 522 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  24.42 
 
 		 550 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3545  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.03 
 
 		 547 aa  122  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0270111  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.04 
 
 		 515 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  25.76 
 
 		 566 aa  122  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1878  beta-xylosidase  27.4 
 
 		 539 aa  122  3e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  29.86 
 
 		 522 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  25.1 
 
 		 563 aa  119  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  26.95 
 
 		 512 aa  119  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  26.8 
 
 		 560 aa  118  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  25.5 
 
 		 532 aa  117  6.9999999999999995e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2996  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.22 
 
 		 559 aa  117  7.999999999999999e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0848  Beta-xylosidase  26.06 
 
 		 552 aa  117  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.168219  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2413  glycoside hydrolase family protein  28.15 
 
 		 521 aa  116  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.333908  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0457  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.55 
 
 		 539 aa  115  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354643 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  24.63 
 
 		 577 aa  114  6e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  28.18 
 
 		 581 aa  112  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  26.31 
 
 		 522 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2090  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.68 
 
 		 537 aa  112  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00759162  normal  0.572245 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1251  glycoside hydrolase family protein  25.35 
 
 		 665 aa  111  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  27.86 
 
 		 543 aa  110  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2329  Xylan 1,4-beta-xylosidase  24.63 
 
 		 537 aa  110  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.26 
 
 		 540 aa  109  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  25.19 
 
 		 535 aa  109  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3334  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.54 
 
 		 536 aa  107  8e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.783434  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.57 
 
 		 546 aa  106  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.789253 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  25.59 
 
 		 545 aa  105  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  24.12 
 
 		 497 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  25.87 
 
 		 537 aa  105  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  29.83 
 
 		 517 aa  105  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  26.48 
 
 		 484 aa  103  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  25.27 
 
 		 1585 aa  102  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1420  glycoside hydrolase family 43  26.31 
 
 		 530 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394008  normal  0.931127 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2914  glycoside hydrolase family protein  25.36 
 
 		 547 aa  99.4  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0431  glycoside hydrolase family protein  34.72 
 
 		 451 aa  99.8  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  27.32 
 
 		 556 aa  99.8  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2504  Xylan 1,4-beta-xylosidase  22.58 
 
 		 558 aa  98.2  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29240  beta-xylosidase  30.77 
 
 		 527 aa  98.2  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2114  glycoside hydrolase family 43  26.06 
 
 		 518 aa  96.3  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.554254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  24.73 
 
 		 537 aa  95.5  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3880  glycoside hydrolase family protein  24.58 
 
 		 571 aa  94.7  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1291  Beta-xylosidase  26.09 
 
 		 553 aa  92.4  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3522  glycoside hydrolase family protein  25.21 
 
 		 534 aa  92.8  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653851  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3875  glycoside hydrolase family protein  24.68 
 
 		 518 aa  92.8  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  25.1 
 
 		 691 aa  92.4  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  26.23 
 
 		 542 aa  91.3  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3531  glycoside hydrolase family 43  24.74 
 
 		 511 aa  90.9  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185955 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  27.39 
 
 		 525 aa  90.5  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2699  glycoside hydrolase family 43  25.77 
 
 		 496 aa  90.5  9e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276179  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  26.38 
 
 		 540 aa  89.4  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06751  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06110)  26.47 
 
 		 591 aa  88.2  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.326162 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21180  beta-xylosidase  27.08 
 
 		 526 aa  88.6  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.166078 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  26.83 
 
 		 492 aa  87.8  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  27.51 
 
 		 522 aa  86.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2459  Xylan 1,4-beta-xylosidase  33.33 
 
 		 488 aa  85.1  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  29.02 
 
 		 1338 aa  80.5  0.00000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  29.58 
 
 		 586 aa  79.7  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  29.11 
 
 		 497 aa  76.3  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3618  glycoside hydrolase family protein  26.89 
 
 		 508 aa  74.7  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000797588  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  25.33 
 
 		 524 aa  73.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08477  xylosidase : arabinofuranosidase (AFU_orthologue; AFUA_2G13190)  24.24 
 
 		 546 aa  71.6  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03261  xylosidase  30.14 
 
 		 365 aa  71.2  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.687612  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3302  glycoside hydrolase family 43  23.11 
 
 		 532 aa  69.7  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00567592  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1257  glycoside hydrolase family 43  23.52 
 
 		 500 aa  68.9  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  28.11 
 
 		 345 aa  63.5  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  26.05 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  23.62 
 
 		 495 aa  61.6  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07275  xylosidase/glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00930)  22.22 
 
 		 503 aa  61.2  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000188631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  25 
 
 		 501 aa  60.1  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2028  glycoside hydrolase family protein  21.4 
 
 		 498 aa  59.7  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  24.02 
 
 		 855 aa  58.5  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  25.55 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  28.64 
 
 		 537 aa  56.6  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  22.61 
 
 		 472 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  23.84 
 
 		 330 aa  53.5  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  26.9 
 
 		 450 aa  52.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2732  glycoside hydrolase family 43  24.88 
 
 		 315 aa  52.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  25.93 
 
 		 319 aa  52.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>