187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2031 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 
762 aa  1585    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.12 
 
 
795 aa  708    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  56.69 
 
 
553 aa  627  1e-178  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  56.4 
 
 
542 aa  611  1e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.28 
 
 
618 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.48 
 
 
613 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.49 
 
 
634 aa  553  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.38 
 
 
775 aa  553  1e-156  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  46.6 
 
 
777 aa  537  1e-151  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.69 
 
 
790 aa  536  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.27 
 
 
779 aa  533  1e-150  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.05 
 
 
774 aa  532  1e-150  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.31 
 
 
609 aa  535  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.05 
 
 
766 aa  531  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.79 
 
 
772 aa  518  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  37.43 
 
 
795 aa  514  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  38.71 
 
 
776 aa  511  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.03 
 
 
905 aa  508  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.78 
 
 
533 aa  496  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.07 
 
 
613 aa  493  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.63 
 
 
526 aa  472  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.47 
 
 
605 aa  467  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.14 
 
 
781 aa  446  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.42 
 
 
549 aa  444  1e-123  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.58 
 
 
618 aa  436  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.62 
 
 
785 aa  419  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.7 
 
 
765 aa  419  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.88 
 
 
534 aa  410  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.92 
 
 
655 aa  412  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.7 
 
 
534 aa  410  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  41.63 
 
 
736 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.87 
 
 
779 aa  405  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.62 
 
 
760 aa  399  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.94 
 
 
527 aa  397  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.02 
 
 
821 aa  394  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.01 
 
 
812 aa  395  1e-108  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.01 
 
 
812 aa  395  1e-108  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  43.16 
 
 
469 aa  381  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.83 
 
 
505 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.68 
 
 
546 aa  369  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.14 
 
 
834 aa  362  2e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.08 
 
 
525 aa  358  1.9999999999999998e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.9 
 
 
422 aa  358  2.9999999999999997e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.68 
 
 
665 aa  345  1e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  34.69 
 
 
614 aa  340  7e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.034495 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  36.89 
 
 
543 aa  334  4e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  38.59 
 
 
602 aa  333  7.000000000000001e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7722  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.83 
 
 
628 aa  330  5.0000000000000004e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.1 
 
 
545 aa  327  5e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  37.82 
 
 
637 aa  327  7e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  36.72 
 
 
639 aa  322  9.999999999999999e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  38.9 
 
 
639 aa  322  1.9999999999999998e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.35 
 
 
529 aa  315  2.9999999999999996e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2148  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.55 
 
 
549 aa  311  4e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0482384  normal  0.117 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1669  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.77 
 
 
547 aa  300  6e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.254995  normal  0.452028 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.2 
 
 
481 aa  299  1e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  35.53 
 
 
558 aa  294  5e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.38 
 
 
593 aa  288  2e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0449  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.7 
 
 
447 aa  287  4e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.81 
 
 
636 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.33 
 
 
688 aa  285  2.0000000000000002e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.7 
 
 
584 aa  285  3.0000000000000004e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.3 
 
 
493 aa  281  4e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.6 
 
 
515 aa  280  6e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  33.4 
 
 
816 aa  279  2e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.05 
 
 
794 aa  277  7e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.52 
 
 
528 aa  276  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  33.98 
 
 
525 aa  275  3e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.35 
 
 
627 aa  273  8.000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.33 
 
 
636 aa  273  9e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.24 
 
 
683 aa  273  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.32 
 
 
504 aa  268  2.9999999999999995e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.38 
 
 
533 aa  261  4e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.33 
 
 
688 aa  259  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  39 
 
 
639 aa  256  8e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.34 
 
 
858 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.62 
 
 
797 aa  254  4.0000000000000004e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.35 
 
 
639 aa  253  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1032  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.65 
 
 
518 aa  252  2e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3941  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.13 
 
 
811 aa  251  3e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2989  putative beta-N-acetylhexosaminidase  34.14 
 
 
807 aa  246  9.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.86 
 
 
673 aa  244  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.08 
 
 
673 aa  241  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.77 
 
 
852 aa  239  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.94 
 
 
820 aa  239  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2735  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.31 
 
 
676 aa  233  7.000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.38332  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0947  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.5 
 
 
500 aa  230  6e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1487  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.95 
 
 
866 aa  230  6e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0842  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.16 
 
 
489 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6586  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.8 
 
 
863 aa  213  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  30.54 
 
 
1140 aa  213  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0553  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.93 
 
 
857 aa  205  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06345  N-acetyl-beta-hexosaminidase  33.9 
 
 
778 aa  204  6e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4327  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.6 
 
 
868 aa  200  9e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2737  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.58 
 
 
530 aa  194  4e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.536035  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05690  N-acetyl-beta-hexosaminidase  28.7 
 
 
476 aa  192  2e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3271  glycosyl hydrolase  28.9 
 
 
889 aa  190  9e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0765357  hitchhiker  0.00388677 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0943  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.73 
 
 
884 aa  190  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125845  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2936  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.42 
 
 
896 aa  184  6e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000338099  normal  0.491372 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1396  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.49 
 
 
913 aa  183  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>