129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1984 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1984  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 501 aa  1019    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000194355  normal  0.0100498 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1059  permease YjgP/YjgQ family protein  55.65 
 
 		 498 aa  552  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546166  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1788  permease  42.71 
 
 		 483 aa  385  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0011  permease YjgP/YjgQ family protein  35.49 
 
 		 527 aa  306  5.0000000000000004e-82  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1323  permease YjgP/YjgQ family protein  39.03 
 
 		 478 aa  293  7e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.976143 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3562  permease YjgP/YjgQ family protein  36.95 
 
 		 480 aa  291  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.326279 
 
 
-
 
NC_002950  PG0598  hypothetical protein  31.88 
 
 		 651 aa  225  2e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06260  hypothetical protein  29.47 
 
 		 456 aa  188  2e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0371515  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1462  permease YjgP/YjgQ family protein  28.95 
 
 		 495 aa  187  3e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2110  permease YjgP/YjgQ family protein  30.69 
 
 		 486 aa  187  4e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185125  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  27.96 
 
 		 441 aa  177  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0824  permease YjgP/YjgQ family protein  27.45 
 
 		 444 aa  174  5e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00713526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  27.9 
 
 		 403 aa  164  3e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  27.12 
 
 		 442 aa  160  5e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  26.97 
 
 		 442 aa  160  5e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1901  permease YjgP/YjgQ family protein  28.39 
 
 		 441 aa  155  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0241  permease YjgP/YjgQ family protein  26.42 
 
 		 481 aa  152  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  25.91 
 
 		 443 aa  140  4.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  30.7 
 
 		 389 aa  84  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  27.89 
 
 		 382 aa  79.7  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  24.36 
 
 		 418 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  28.51 
 
 		 395 aa  74.3  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  28.1 
 
 		 395 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  24.64 
 
 		 399 aa  70.1  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  25.85 
 
 		 392 aa  69.7  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  28.44 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 434 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  29.83 
 
 		 356 aa  67.8  0.0000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  25.25 
 
 		 394 aa  66.6  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  24.89 
 
 		 379 aa  62.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  29.07 
 
 		 389 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  24.11 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  23.27 
 
 		 392 aa  60.8  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  32.26 
 
 		 401 aa  60.8  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  28.46 
 
 		 361 aa  60.5  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  24.48 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  27.6 
 
 		 391 aa  59.7  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  27.18 
 
 		 1040 aa  59.7  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  29.92 
 
 		 395 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  32.26 
 
 		 401 aa  59.7  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  24.78 
 
 		 379 aa  59.3  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  29.92 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  31.45 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  22.4 
 
 		 792 aa  58.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  26.37 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  26.98 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1296  permease YjgP/YjgQ family protein  28.93 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00381796  normal  0.151885 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  30.15 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0402  permease YjgP/YjgQ  27.23 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0017509  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3417  permease YjgP/YjgQ family protein  24.32 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1948  permease, putative  25 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00215493  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1230  permease YjgP/YjgQ family protein  29.41 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.494831  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2943  permease YjgP/YjgQ  24.52 
 
 		 396 aa  57  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3338  permease YjgP/YjgQ family protein  24.78 
 
 		 388 aa  57  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  25.97 
 
 		 388 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  25.6 
 
 		 364 aa  55.1  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  29.92 
 
 		 359 aa  54.3  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2465  permease YjgP/YjgQ  27.44 
 
 		 371 aa  53.5  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0309  permease YjgP/YjgQ family protein  18.46 
 
 		 417 aa  53.5  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1212  permease YjgP/YjgQ family protein  23.08 
 
 		 393 aa  53.5  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205645  decreased coverage  0.00000154162 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  28.12 
 
 		 401 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1490  permease YjgP/YjgQ family protein  26.83 
 
 		 371 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.857253  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  37.5 
 
 		 386 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  27.48 
 
 		 1153 aa  52.8  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1068  permease YjgP/YjgQ family protein  22.53 
 
 		 393 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.388378  hitchhiker  0.0000584929 
 
 
-
 
NC_004310  BR0687  hypothetical protein  23.12 
 
 		 402 aa  51.6  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0679  hypothetical protein  23.12 
 
 		 402 aa  52  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  24.83 
 
 		 370 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1394  permease YjgP/YjgQ family protein  26.83 
 
 		 371 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00373064  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  25.86 
 
 		 364 aa  51.2  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  28.33 
 
 		 359 aa  51.2  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1407  permease YjgP/YjgQ family protein  28.86 
 
 		 378 aa  50.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.185064 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0508  YjgP/YjgQ permease  32 
 
 		 396 aa  50.8  0.00005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  25.53 
 
 		 365 aa  50.8  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  21.28 
 
 		 418 aa  50.4  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2601  permease YjgP/YjgQ family protein  28.43 
 
 		 402 aa  50.4  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0318  permease YjgP/YjgQ family protein  25.62 
 
 		 363 aa  50.1  0.00009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.341931 
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  29.52 
 
 		 360 aa  49.7  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  26.52 
 
 		 360 aa  49.7  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  36.51 
 
 		 358 aa  48.9  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  36.36 
 
 		 384 aa  48.9  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  26.83 
 
 		 359 aa  48.9  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  25.7 
 
 		 359 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02856  conserved hypothetical protein  23.95 
 
 		 356 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000121999  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1043  hypothetical protein  26.72 
 
 		 377 aa  48.5  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0296445  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1747  permease YjgP/YjgQ  25.54 
 
 		 369 aa  48.5  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02805  hypothetical protein  23.95 
 
 		 356 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000010354  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3447  YjgP/YjgQ permease  23.95 
 
 		 356 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0713  permease YjgP/YjgQ family protein  23.95 
 
 		 356 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3265  YjgP/YjgQ permease  23.95 
 
 		 356 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.342085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44330  permease YjgP/YjgQ family  23.83 
 
 		 357 aa  48.5  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.504882  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  32.38 
 
 		 358 aa  47.8  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1804  permease YjgP/YjgQ family protein  23.86 
 
 		 392 aa  48.1  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  31.9 
 
 		 387 aa  47.8  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1198  permease  27.94 
 
 		 359 aa  47.8  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00112188  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2100  hypothetical protein  24 
 
 		 339 aa  47.4  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0377846  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3160  YjgP/YjgQ permease  27.27 
 
 		 356 aa  47.4  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3108  permease YjgP/YjgQ family protein  23.15 
 
 		 370 aa  47.4  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000374217  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  24.11 
 
 		 1061 aa  47  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3118  permease YjgP/YjgQ family protein  23.15 
 
 		 370 aa  47  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000110304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>