158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1871 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  100 
 
 		 794 aa  1621    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  41 
 
 		 822 aa  594  1e-168  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  34.46 
 
 		 799 aa  426  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  33.2 
 
 		 792 aa  389  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  33.4 
 
 		 636 aa  244  6e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1078  hypothetical protein  38.74 
 
 		 735 aa  214  7e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0714016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1687  hypothetical protein  38.84 
 
 		 751 aa  206  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.45992  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  34.01 
 
 		 637 aa  178  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  32.63 
 
 		 1162 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2517  hypothetical protein  27.32 
 
 		 615 aa  112  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.174672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  32.59 
 
 		 1657 aa  108  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  33.5 
 
 		 1371 aa  107  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  24.61 
 
 		 886 aa  103  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  25.54 
 
 		 1288 aa  102  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  26.09 
 
 		 1389 aa  100  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  28.88 
 
 		 627 aa  100  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  27.09 
 
 		 1313 aa  97.4  8e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  36.05 
 
 		 650 aa  94.7  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  29.21 
 
 		 2713 aa  94.4  7e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  25 
 
 		 2411 aa  90.5  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  25 
 
 		 2367 aa  90.1  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  26.04 
 
 		 1620 aa  90.1  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  24.47 
 
 		 2807 aa  89.4  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  24.65 
 
 		 2454 aa  87.4  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  41.1 
 
 		 1259 aa  86.3  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  25.25 
 
 		 2421 aa  85.5  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  23.56 
 
 		 1287 aa  85.5  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  25.62 
 
 		 1222 aa  84.7  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  29.05 
 
 		 3793 aa  85.1  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0229  hypothetical protein  29.15 
 
 		 963 aa  82.8  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.449172 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6940  PKD domain containing protein  30.94 
 
 		 642 aa  82  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  29.01 
 
 		 1466 aa  81.6  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  32.57 
 
 		 750 aa  80.9  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  25.56 
 
 		 1602 aa  80.5  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  23.8 
 
 		 561 aa  80.5  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  25.93 
 
 		 2772 aa  80.1  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1634  hypothetical protein  24.05 
 
 		 1245 aa  79.3  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070583  decreased coverage  0.00112421 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  33.92 
 
 		 1059 aa  79  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0230  hypothetical protein  27.78 
 
 		 969 aa  79.3  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.703793  normal  0.0560444 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  27.94 
 
 		 890 aa  79  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  28.32 
 
 		 1064 aa  76.6  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  22.67 
 
 		 1139 aa  76.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  42.15 
 
 		 815 aa  77  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5223  hypothetical protein  37.59 
 
 		 1228 aa  76.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  24.06 
 
 		 1606 aa  76.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  36.84 
 
 		 2064 aa  76.6  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  25.97 
 
 		 3542 aa  75.9  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5608  hypothetical protein  23.41 
 
 		 808 aa  75.1  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.406327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  27.23 
 
 		 1108 aa  74.7  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  27.67 
 
 		 1329 aa  73.2  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  35.29 
 
 		 938 aa  72.4  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  38.64 
 
 		 429 aa  72  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5691  PKD domain containing protein  25.55 
 
 		 662 aa  72  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  25.11 
 
 		 1266 aa  69.7  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  37.04 
 
 		 1526 aa  69.7  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4388  hypothetical protein  25.64 
 
 		 373 aa  69.3  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1798  hypothetical protein  24.08 
 
 		 749 aa  68.2  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.545169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2463  UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase  35.29 
 
 		 1140 aa  68.2  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  24.9 
 
 		 991 aa  67.8  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5096  hypothetical protein  23.16 
 
 		 989 aa  67.8  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  34.26 
 
 		 2296 aa  67  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  30.77 
 
 		 3227 aa  65.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  36.11 
 
 		 2927 aa  65.5  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  48.53 
 
 		 3602 aa  65.1  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  35.34 
 
 		 3737 aa  64.7  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  28.5 
 
 		 581 aa  62.8  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6385  hypothetical protein  41.3 
 
 		 694 aa  63.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.275393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3968  hypothetical protein  26.69 
 
 		 968 aa  63.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.21265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4004  hypothetical protein  31.46 
 
 		 598 aa  63.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0619  Polymorphic membrane protein  27.23 
 
 		 1216 aa  62.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.418961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  25.25 
 
 		 885 aa  62.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  30.83 
 
 		 540 aa  62.4  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  40.7 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4506  hypothetical protein  39.44 
 
 		 1163 aa  60.8  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.521231 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4538  von Willebrand factor, type A  38.04 
 
 		 2588 aa  60.8  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2587  hypothetical protein  37.08 
 
 		 652 aa  60.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0216608 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  38.3 
 
 		 4896 aa  60.1  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  31.28 
 
 		 1507 aa  58.9  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  30.77 
 
 		 14944 aa  58.9  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  35.64 
 
 		 2377 aa  58.2  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1720  C-type lectin domain-containing protein  34.52 
 
 		 726 aa  58.2  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3959  hypothetical protein  31.25 
 
 		 1066 aa  58.2  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  32.35 
 
 		 1488 aa  58.2  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3967  hypothetical protein  27.23 
 
 		 950 aa  57.8  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000017261  normal  0.368217 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1902  hypothetical protein  23.92 
 
 		 797 aa  57.8  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  39.77 
 
 		 599 aa  57.8  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  26.84 
 
 		 1748 aa  57.4  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  23.62 
 
 		 1750 aa  57.4  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4934  hypothetical protein  26.84 
 
 		 774 aa  57  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  29.94 
 
 		 2005 aa  57.4  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4003  hypothetical protein  30.83 
 
 		 658 aa  57  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3743  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1193 aa  57  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5990  hypothetical protein  25.98 
 
 		 925 aa  57.4  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.671162 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6088  hypothetical protein  31.78 
 
 		 535 aa  57.4  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06070  hypothetical protein  34.86 
 
 		 676 aa  56.2  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2195  PKD domain containing protein  36.67 
 
 		 2980 aa  56.6  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000175311 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2484  hypothetical protein  32.33 
 
 		 532 aa  56.2  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.480265 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1618  hypothetical protein  34.29 
 
 		 2267 aa  55.8  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  32.03 
 
 		 1230 aa  55.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  32.95 
 
 		 1483 aa  55.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>