More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1840 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1840  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 365 aa  741    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.772932 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0795  RND family efflux transporter MFP subunit  26.37 
 
 		 411 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2533  RND family efflux transporter MFP subunit  26.11 
 
 		 343 aa  95.5  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66716  normal  0.672833 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1340  secretion protein HlyD  25.92 
 
 		 424 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  25.3 
 
 		 417 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  25.94 
 
 		 400 aa  84  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.72 
 
 		 419 aa  84  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0208015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  25.7 
 
 		 360 aa  83.6  0.000000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  25.93 
 
 		 431 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00603978  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0558  secretion protein HlyD  26.82 
 
 		 360 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.177986  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3749  RND family efflux transporter MFP subunit  24.93 
 
 		 340 aa  82  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  22.78 
 
 		 376 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.24 
 
 		 428 aa  81.6  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00204407  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.67 
 
 		 377 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1830  secretion protein HlyD  24.59 
 
 		 449 aa  80.5  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.18 
 
 		 361 aa  79.7  0.00000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0963  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.18 
 
 		 451 aa  79.3  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0174638  normal  0.124893 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.26 
 
 		 360 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0831  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.74 
 
 		 372 aa  79  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0273609  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.98 
 
 		 432 aa  77.8  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.99 
 
 		 383 aa  77.8  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0487  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.16 
 
 		 360 aa  77.4  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0913  hypothetical protein  22.49 
 
 		 338 aa  77  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0882  hypothetical protein  22.49 
 
 		 338 aa  76.3  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  25.71 
 
 		 426 aa  75.5  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  23.2 
 
 		 489 aa  75.5  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000975793  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1847  putative efflux transporter  24.2 
 
 		 421 aa  75.5  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1414  secretion protein HlyD  23.82 
 
 		 430 aa  74.3  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2956  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.77 
 
 		 430 aa  73.9  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.232515 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1349  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.04 
 
 		 409 aa  73.9  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0580213 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2872  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.64 
 
 		 387 aa  73.2  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  24.19 
 
 		 405 aa  73.6  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1965  secretion protein HlyD  22.71 
 
 		 388 aa  73.2  0.000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.455875 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0431  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.94 
 
 		 368 aa  72.8  0.000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0480  RND family efflux transporter MFP subunit  23.22 
 
 		 363 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1731  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.67 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08701  membrane fusion protein  23.36 
 
 		 392 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3297  secretion protein HlyD  24.15 
 
 		 418 aa  71.6  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.58 
 
 		 505 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3085  secretion protein HlyD family protein  29.89 
 
 		 353 aa  71.2  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22636  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1281  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.46 
 
 		 387 aa  71.2  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000959286  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2977  RND family efflux transporter MFP subunit  25.3 
 
 		 401 aa  70.5  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.540318  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0949  RND family efflux transporter MFP subunit  22.35 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3883  secretion protein HlyD  23.76 
 
 		 424 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01120  membrane fusion efflux protein  22.57 
 
 		 373 aa  70.1  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3060  secretion protein HlyD family protein  24.47 
 
 		 353 aa  70.1  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1839  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.1 
 
 		 420 aa  69.7  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4021  secretion protein HlyD  25.72 
 
 		 345 aa  69.7  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.58 
 
 		 432 aa  69.3  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0659148 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0764  RND family efflux transporter MFP subunit  22.63 
 
 		 385 aa  69.3  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1621  secretion protein HlyD  23.53 
 
 		 407 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.69 
 
 		 435 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0206  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.5 
 
 		 386 aa  68.2  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0930  RND family efflux transporter MFP subunit  20.89 
 
 		 366 aa  68.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  22.87 
 
 		 389 aa  68.6  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.04 
 
 		 407 aa  68.6  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.32 
 
 		 421 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1613  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.45 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.8 
 
 		 453 aa  67.8  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  23.13 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.32 
 
 		 421 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1204  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.42 
 
 		 471 aa  67  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1672  RND family efflux transporter MFP subunit  22.82 
 
 		 429 aa  67  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  25.27 
 
 		 328 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3548  RND family efflux transporter MFP subunit  26 
 
 		 442 aa  66.6  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2603  secretion protein HlyD  25.7 
 
 		 389 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.22725  normal  0.133946 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00481  hypothetical protein  22.58 
 
 		 368 aa  66.6  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1080  MacA  21.28 
 
 		 394 aa  66.2  0.0000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0696  secretion protein HlyD family protein  28.52 
 
 		 353 aa  66.6  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.24713 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1440  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.47 
 
 		 374 aa  66.2  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0549  secretion protein HlyD  23.08 
 
 		 407 aa  66.2  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4297  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.73 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.430357  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02661  membrane-fusion protein  23.1 
 
 		 375 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.489029 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1419  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.62 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.267588  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3918  secretion protein HlyD  23.38 
 
 		 433 aa  65.1  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2912  secretion protein HlyD  23.33 
 
 		 418 aa  65.1  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0694  secretion protein HlyD  23.42 
 
 		 417 aa  64.7  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.459164  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001980  probable RND efflux membrane fusion protein  21.94 
 
 		 367 aa  65.5  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.979341  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1102  secretion protein HlyD  27.52 
 
 		 470 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2553  hypothetical protein  23.86 
 
 		 368 aa  65.5  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4041  hypothetical protein  23.36 
 
 		 366 aa  64.7  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0513022 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1469  secretion protein HlyD  25.32 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.910926 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.92 
 
 		 466 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2825  Fis family transcriptional regulator  23.92 
 
 		 466 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506795  normal  0.45265 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  22.43 
 
 		 517 aa  64.3  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1670  RND family efflux transporter MFP subunit  23.56 
 
 		 371 aa  64.7  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0601  secretion protein HlyD  23.97 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.986761  normal  0.63228 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2861  secretion protein HlyD  22.89 
 
 		 489 aa  63.9  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1129  secretion protein HlyD  24.85 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.827247  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1497  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.53 
 
 		 407 aa  63.9  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.30393  hitchhiker  0.00778895 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1814  RND family efflux transporter MFP subunit  24.75 
 
 		 432 aa  63.9  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3533  RND family efflux transporter MFP subunit  22.83 
 
 		 409 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.722317 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0495  secretion protein HlyD  26.32 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0177  hypothetical protein  26.1 
 
 		 509 aa  63.5  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2074  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.99 
 
 		 353 aa  63.5  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.104068  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3351  RND family efflux transporter MFP subunit  24.26 
 
 		 367 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  25.31 
 
 		 390 aa  63.2  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1515  RND family efflux transporter MFP subunit  25.07 
 
 		 405 aa  63.5  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  23.17 
 
 		 379 aa  63.2  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1853  secretion protein HlyD  31.25 
 
 		 471 aa  63.2  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>