More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1756 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1756  aminotransferase class V  100 
 
 
438 aa  914  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60376  normal  0.594036 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3047  aminotransferase class V  55.71 
 
 
428 aa  506  1e-142  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.500863  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6132  aminotransferase class V  40.89 
 
 
422 aa  332  9e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3802  putative aminotransferase  34.32 
 
 
437 aa  235  9e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161541  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4973  putative aminotransferase  34.47 
 
 
437 aa  232  9e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656767  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3800  aminotransferase class V  30.75 
 
 
433 aa  190  4e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2611  aminotransferase, class V  31.55 
 
 
441 aa  179  7e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.189769  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1478  twin-arginine translocation pathway signal  27.67 
 
 
441 aa  176  7e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4359  aminotransferase, class V  28.68 
 
 
393 aa  171  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3584  aminotransferase class V  26.98 
 
 
388 aa  160  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2502  aminotransferase class V  25.27 
 
 
399 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207929  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1377  aminotransferase, class V  24.29 
 
 
390 aa  147  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1607  aminotransferase class V  28.15 
 
 
399 aa  143  5e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2155  aminotransferase, class V  24.32 
 
 
427 aa  142  2e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0697123  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.21 
 
 
412 aa  138  2e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  25.89 
 
 
393 aa  137  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.66 
 
 
414 aa  136  6e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  27.76 
 
 
408 aa  134  4e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12890  cysteine desulfurase  27.72 
 
 
422 aa  134  4e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33720  PvdN  23.49 
 
 
427 aa  134  4e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000909297  hitchhiker  0.00809469 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.76 
 
 
404 aa  133  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1965  twin-arginine translocation pathway signal  23.69 
 
 
426 aa  132  9e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0412227  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.73 
 
 
406 aa  132  1e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2837  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.1 
 
 
415 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00234776  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3921  aminotransferase class V  22.8 
 
 
445 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1661  cysteine desulphurases, SufS  27.95 
 
 
414 aa  131  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278494  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2865  aminotransferase  23.49 
 
 
427 aa  131  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.44 
 
 
414 aa  130  4e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2273  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.46 
 
 
442 aa  130  6e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  28.72 
 
 
410 aa  130  6e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.94 
 
 
414 aa  129  7e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1852  twin-arginine translocation pathway signal  23.01 
 
 
431 aa  129  9e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.776832 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.77 
 
 
406 aa  129  1e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  26.65 
 
 
424 aa  129  1e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.18 
 
 
414 aa  129  1e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.44 
 
 
413 aa  129  1e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4214  aminotransferase, class V  24.83 
 
 
428 aa  129  1e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.21 
 
 
408 aa  128  2e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  31.54 
 
 
406 aa  128  2e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2990  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.67 
 
 
428 aa  128  2e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  28.74 
 
 
416 aa  128  2e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.27 
 
 
413 aa  128  2e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  28.19 
 
 
414 aa  127  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  31.54 
 
 
406 aa  127  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  31.54 
 
 
406 aa  128  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  31.54 
 
 
406 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  31.54 
 
 
406 aa  128  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  27.51 
 
 
414 aa  127  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  28.86 
 
 
414 aa  127  4e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.02 
 
 
412 aa  127  4e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  31.54 
 
 
406 aa  127  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1623  cysteine desulfurase  27.78 
 
 
406 aa  126  6e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0344832 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  31.54 
 
 
406 aa  127  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  31.54 
 
 
406 aa  127  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.46 
 
 
413 aa  126  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2088  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.89 
 
 
406 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0721  aminotransferase class V  21.99 
 
 
389 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.38 
 
 
415 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.37 
 
 
406 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1815  selenocysteine lyase  29.45 
 
 
665 aa  125  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.653401  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2068  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.1 
 
 
443 aa  124  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.512945  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  24.88 
 
 
415 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.27 
 
 
406 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4543  aminotransferase class V  28.75 
 
 
391 aa  124  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1863  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.93 
 
 
416 aa  124  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2745  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.03 
 
 
415 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  31.18 
 
 
406 aa  124  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.32 
 
 
419 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  26 
 
 
409 aa  123  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1138  SufS subfamily cysteine desulfurase  25 
 
 
411 aa  122  9e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.730169  normal  0.0524008 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.06 
 
 
419 aa  122  1e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.07 
 
 
420 aa  122  1e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2941  aminotransferase class V  23.73 
 
 
384 aa  122  1e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1746  aminotransferase class V  25.25 
 
 
407 aa  122  2e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.676598  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04996  cysteine desulfurase  22.38 
 
 
476 aa  121  2e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2355  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.13 
 
 
407 aa  122  2e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.331891  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.19 
 
 
413 aa  122  2e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.14 
 
 
414 aa  122  2e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.724967 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  26.92 
 
 
420 aa  121  2e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0431  putative selenocysteine lyase  26.37 
 
 
406 aa  121  2e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3648  aminotransferase class V  22.51 
 
 
461 aa  120  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  26.84 
 
 
414 aa  120  3e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  26.63 
 
 
394 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.74 
 
 
418 aa  120  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.31 
 
 
678 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.22 
 
 
415 aa  120  4e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3969  cysteine desulfurase  26.89 
 
 
415 aa  120  4e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0413583  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3786  aminotransferase, class V  22.97 
 
 
430 aa  120  5e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.18 
 
 
413 aa  120  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001209  aminotransferase ScrA  21.11 
 
 
469 aa  119  8e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1249  cysteine desulfurase  27.72 
 
 
406 aa  119  9e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.491768  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  26.57 
 
 
429 aa  119  9e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.05 
 
 
657 aa  119  9e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2356  SufS subfamily cysteine desulfurase  28 
 
 
406 aa  119  1e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.32 
 
 
418 aa  119  1e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0754  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.37 
 
 
608 aa  119  1e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03051  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  28.03 
 
 
434 aa  119  1e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.512887 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.7 
 
 
417 aa  119  1e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  26.21 
 
 
880 aa  118  2e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.1 
 
 
413 aa  118  2e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0201229 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>