27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1741 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1741  hypothetical protein  100 
 
 		 977 aa  1996    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0028  hypothetical protein  30.16 
 
 		 914 aa  408  1.0000000000000001e-112  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6241  hypothetical protein  28.68 
 
 		 919 aa  365  3e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.950662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1427  hypothetical protein  28.27 
 
 		 936 aa  353  1e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5623  WD40 domain protein beta Propeller  24.34 
 
 		 956 aa  137  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101899 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0966  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  25.13 
 
 		 976 aa  133  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000198927  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2492  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  21.92 
 
 		 970 aa  100  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2060  WD40 domain-containing protein  25.48 
 
 		 1206 aa  95.5  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.456517  normal  0.995925 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2102  WD40 domain protein beta Propeller  23.55 
 
 		 1078 aa  92  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08230  WD40 domain protein beta Propeller  20.97 
 
 		 918 aa  90.9  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2193  WD40 domain protein beta Propeller  23.8 
 
 		 1077 aa  88.2  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1171  WD40 domain protein beta Propeller  23.96 
 
 		 947 aa  77  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1737  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  33.71 
 
 		 1021 aa  72.8  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.349792  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2423  WD40 domain protein beta Propeller  23.53 
 
 		 881 aa  68.9  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0325  WD40 domain-containing protein beta Propeller  23.31 
 
 		 901 aa  67.8  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0140  WD40 domain protein beta Propeller  22.08 
 
 		 970 aa  63.5  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1222  outer membrane protein  25.41 
 
 		 918 aa  63.2  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0413345  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1988  hypothetical protein  21.28 
 
 		 923 aa  57  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.36521  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0538  hypothetical protein  26.01 
 
 		 885 aa  54.7  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000796497  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  23.69 
 
 		 457 aa  52.4  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0629  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  25.08 
 
 		 1028 aa  51.2  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2405  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  22.89 
 
 		 1078 aa  51.2  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.666802  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1234  trep  23.15 
 
 		 924 aa  47  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941039  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0016  hypothetical protein  24.05 
 
 		 979 aa  46.2  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1792  hypothetical protein  23.91 
 
 		 836 aa  45.4  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.201909  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  26.85 
 
 		 572 aa  45.4  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1406  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.38 
 
 		 700 aa  44.7  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.955873  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>